| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 本文缩写词表 | 第12-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-28页 |
| 1.1 大豆 | 第13-19页 |
| 1.1.1 大豆概况及其野生资源分布 | 第13-16页 |
| 1.1.2 大豆基因组研究进展 | 第16-19页 |
| 1.2 高通量测序技术 | 第19-28页 |
| 1.2.1 高通量测序技术及其在作物遗传育种方面的应用 | 第19-26页 |
| 1.2.2 基因组重测序技术路线 | 第26-28页 |
| 2 一个江南野生大豆基因组测序及其分析 | 第28-56页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28-33页 |
| 2.1.1 材料 | 第28页 |
| 2.1.2 方法 | 第28-33页 |
| 2.1.2.1 文库构建与测序 | 第28-29页 |
| 2.1.2.2 数据预处理与评估 | 第29-30页 |
| 2.1.2.3 基因组序列拼接 | 第30-31页 |
| 2.1.2.4 基因组注释及后续分析 | 第31-33页 |
| 2.2 结果 | 第33-55页 |
| 2.2.1 基因组测序及预处理结果 | 第33-36页 |
| 2.2.2 基因组拼接及注释 | 第36-38页 |
| 2.2.3 基因组变异分析 | 第38-41页 |
| 2.2.4 野生大豆兰溪1号中特有序列分析 | 第41-44页 |
| 2.2.5 栽培大豆Williams82中特有序列分析 | 第44-52页 |
| 2.2.6 大SNP密度比较及其驯化起源分析 | 第52-55页 |
| 2.3 讨论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 硕士期间论文著作 | 第64页 |