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荔枝花序上雏形叶衰老机理的研究

摘要第3-5页
abstract第5-7页
缩略词表第8-16页
第一章 前言第16-31页
    1.1 研究背景第16-29页
        1.1.1 植物成花及成花逆转研究进展第16-18页
            1.1.1.1 植物成花途径研究第16-17页
            1.1.1.2 植物成花逆转研究第17-18页
        1.1.2 荔枝成花研究现状第18-22页
            1.1.2.1 环境对荔枝成花的影响第19-20页
            1.1.2.2 荔枝成花生理生化基础第20-22页
            1.1.2.3 荔枝成花相关基因研究第22页
        1.1.3 叶片衰老研究进展第22-24页
            1.1.3.1 影响叶片衰老因素第22-23页
            1.1.3.2 叶片衰老相关基因第23-24页
        1.1.4 荔枝雏形叶与花发育关系第24-25页
        1.1.5 高通量测序技术研究进展第25-26页
            1.1.5.1 转录组测序技术第25页
            1.1.5.2 表达谱测序技术第25-26页
        1.1.6 NAC转录因子研究进展第26页
            1.1.6.1 NAC转录因子的结构第26页
            1.1.6.2 NAC转录因子的功能第26页
        1.1.7 VIGS应用研究进展第26-29页
            1.1.7.1 VIGS载体病毒的范围第27-28页
            1.1.7.2 VIGS技术应用的范围第28页
            1.1.7.3 影响VIGS效率的因素第28-29页
    1.2 研究目的及意义第29-30页
    1.3 研究技术路线第30-31页
第二章 不同品种花序雏形叶对花序生长发育的影响第31-52页
    2.1 引言第31页
    2.2 材料与方法第31-34页
        2.2.1 试验材料第31页
        2.2.2 实验方法第31-34页
            2.2.2.1 荔枝成花情况调查第31-32页
            2.2.2.2 代谢谱GC-MS分析第32-34页
            2.2.2.3 荔枝果实品质分析第34页
            2.2.2.4 实验结果统计分析第34页
    2.3 结果与分析第34-49页
        2.3.1 ‘糯米糍’和‘桂味’花序雏形叶对花序发育的影响第34-36页
        2.3.2 不同的温度处理对‘糯米糍’和‘桂味’荔枝花序发育的影响第36-41页
        2.3.3 不同类型花序枝韧皮部浸出液成分分析第41-45页
            2.3.3.1 代谢谱物质种类筛选分析第42-44页
            2.3.3.2 ‘糯米糍’代谢物质分析第44页
            2.3.3.3 ‘桂味’代谢物质分析第44页
            2.3.3.4 代谢物质相对含量的热图分析第44-45页
            2.3.3.5 主要代谢物质PCA分析第45页
        2.3.4 不同类型花序枝坐果后果实品质分析第45-49页
    2.4 讨论第49-52页
        2.4.1 荔枝花序上的雏形叶对花序发育的影响第49-50页
        2.4.2 韧皮部浸出液代谢组学分析第50-52页
第三章 荔枝不同发育方向的花序及雏形叶的表达谱分析第52-72页
    3.1 引言第52页
    3.2 材料与方法第52-55页
        3.2.1 实验材料第52页
        3.2.2 实验方法第52-55页
            3.2.2.1 总RNA的提取第52-53页
            3.2.2.2 表达谱测序流程第53页
            2.2.2.3 原始数据分析流程第53-54页
            3.2.2.4 差异基因分析流程第54-55页
    3.3 结果与分析第55-69页
        3.3.1 原始测序数据过滤比对与分析第55页
        3.3.2 测序样品生物学重复关联分析第55页
        3.3.3 测序样品差异表达基因的分析第55-57页
        3.3.4 样品差异表达基因分类与筛选第57-69页
            3.3.4.1 差异表达基因GO分类第57-62页
            3.3.4.2 差异表达基因趋势分析第62页
            3.3.4.3 NAC转录因子差异表达基因分析第62-65页
            3.3.4.4 激素相关差异表达基因分析第65-69页
    3.4 讨论第69-72页
第四章 过表达NACs促进活性氧诱导的拟南芥和烟草的衰老第72-85页
    4.1 引言第72页
    4.2 材料与方法第72-77页
        4.2.1 实验材料第72-73页
            4.2.1.1 植物材料第72页
            4.2.1.2 菌株与质粒第72-73页
            4.2.1.3 实验试剂第73页
            4.2.1.4 实验器材第73页
        4.2.2 实验方法第73-77页
            4.2.2.1 总RNA提取第73-74页
            4.2.2.2 cDNA第一链合成第74页
            4.2.2.3 目的基因克隆第74-75页
            4.2.2.4 荧光定量PCR第75-76页
            4.2.2.5 表达载体构建第76页
            4.2.2.6 拟南芥遗传转化第76页
            4.2.2.7 烟草遗传转化第76-77页
            4.2.2.8 阳性苗的鉴定第77页
            4.2.2.9 叶片衰老表型分析第77页
    4.3 结果与分析第77-82页
        4.3.1 目的基因分析第77页
        4.3.2 活性氧对LcNAC5,LcNAC4及LcNAP1表达的影响第77-78页
        4.3.3 进化树构建分析第78页
        4.3.4 拟南芥上过表达LcNAC5,LCNAC4和LcNAP1促进ROS诱导的叶片衰老第78-81页
        4.3.5 烟草上过表达LcNAC5,LcNAC4和LcNAP1促进ROS诱导的叶片衰老第81-82页
    4.4 讨论第82-85页
第五章 利用VIGS研究LcNAC5在雏形叶衰老过程中的作用第85-104页
    5.1 引言第85页
    5.2 材料与方法第85-88页
        5.2.1 实验材料第85-86页
            5.2.1.1 植物材料第85页
            5.2.1.2 菌株与质粒第85页
            5.2.1.3 实验试剂第85-86页
            5.2.1.4 实验器材第86页
        5.2.2 实验方法第86-88页
            5.2.2.1 载体构建第86页
            5.2.2.2 侵染菌液制备第86页
            5.2.2.3 侵染荔枝嫩梢第86页
            5.2.2.4 荧光定量PCR第86页
            5.2.2.5 衰老情况调查第86-87页
            5.2.2.6 转录组测序流程第87-88页
    5.3 结果与分析第88-100页
        5.3.1 沉默载体构建第88页
        5.3.2 荧光定量检测第88-89页
        5.3.3 VIGS处理后延迟MV诱导的叶片衰老第89页
        5.3.4 测序数据分析第89-96页
            5.3.4.1 测序质量的评估第89-91页
            5.3.4.2 测序饱和度分析第91-92页
            5.3.4.3 测序随机性分析第92-93页
            5.3.4.4 基因覆盖度统计第93页
            5.3.4.5 表达量丰度统计第93-94页
            5.3.4.6 样品重复性分析第94-95页
            5.3.4.7 样品主成分分析第95页
            5.3.4.8 分组间差异统计第95-96页
        5.3.5 差异表达基因分析第96-100页
            5.3.5.1 差异表达基因Go分类统计第96-97页
            5.3.5.2 差异表达基因KEGG分析第97-99页
            5.3.5.3 差异表达基因转录因子分析第99-100页
    5.4 讨论第100-104页
        5.4.1 VIGS技术对基因功能的研究第100-102页
        5.4.2 利用R-SEQ测序分析沉默样本第102-104页
第六章 LcMCⅡ-1在荔枝叶片衰老过程中的功能研究第104-120页
    6.1 引言第104页
    6.2 材料与方法第104-107页
        6.2.1 实验材料第104-105页
            6.2.1.1 植物材料第104-105页
            6.2.1.2 菌株与质粒第105页
            6.2.1.3 实验试剂第105页
        6.2.2 实验方法第105-107页
            6.2.2.1 总RNA提取第105页
            6.2.2.2 cDNA第一链合成第105页
            6.2.2.3 目的基因克隆第105页
            6.2.2.4 荧光定量PCR第105页
            6.2.2.5 亚细胞的定位第105-106页
            6.2.2.6 VIGS实验第106页
            6.2.2.7 拟南芥的转化第106页
            6.2.2.8 烟草瞬时转化第106-107页
    6.3 结果与分析第107-115页
        6.3.1 目的基因分析第107页
        6.3.2 亚细胞定位分析第107页
        6.3.3 表达模式分析第107-113页
            6.3.3.1 MV诱导雏形叶脱落第107-112页
            6.3.3.2 低温诱导雏形叶脱落第112页
            6.3.3.3 自然状态下衰老叶片第112-113页
        6.3.4 VIGS基因沉默分析第113-114页
        6.3.5 过表达拟南芥分析第114-115页
        6.3.6 烟草瞬时转化分析第115页
    6.4 讨论第115-120页
        6.4.1 LcMCⅡ-1表达分析第115-118页
        6.4.2 LcMCⅡ-1功能分析第118-120页
第七章 全文总结第120-124页
    7.1 主要研究内容第120-122页
    7.2 本论文创新点第122-123页
    7.3 后续研究展望第123-124页
致谢第124-125页
参考文献第125-142页
附录A第142-144页
附录B第144页

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