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长期传代的TGEV CN12株全基因组遗传变异及qPCR检测方法的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
本论文常用英文缩写词第7-11页
第一章 前言第11-20页
    1.1 概况第11页
    1.2 病毒的形态与理化特征第11-12页
    1.3 病毒的生物学特征第12-13页
    1.4 病毒的基因组结构与功能第13-15页
        1.4.1 病毒的非结构蛋白及其功能第14页
        1.4.2 病毒的结构蛋白及其功能第14-15页
    1.5 TGEV检测技术的研究进展第15-18页
        1.5.1 病毒的分离鉴定第15-16页
        1.5.2 免疫电镜法第16页
        1.5.3 免疫荧光法技术第16页
        1.5.4 ELISA方法第16-17页
        1.5.5 核酸探针杂交检测方法第17页
        1.5.6 聚合酶链式反应(PCR)技术第17-18页
        1.5.7 免疫胶体金技术第18页
    1.6 本研究的目的与意义第18-20页
第二章 猪传染性胃肠炎病毒的分离鉴定、传代培养及全基因序列分析第20-36页
    2.1 材料与方法第20-31页
        2.1.1 病毒、细胞与菌株第20页
        2.1.2 实验相关试剂及配制第20-21页
        2.1.3 主要仪器设备第21-22页
        2.1.4 细胞的复苏第22页
        2.1.5 细胞的传代第22页
        2.1.6 病料的处理第22页
        2.1.7 病毒的繁殖第22-23页
        2.1.8 病毒的纯化第23页
        2.1.9 纯化后病毒的鉴定第23-25页
            2.1.9.1 引物的设计与合成第23页
            2.1.9.2 病毒总RNA的提取第23-24页
            2.1.9.3 cDNA第一条链合成第24-25页
            2.1.9.4 cDNA第一链的RT-PCR扩增第25页
        2.1.10 病毒在PK-15细胞上的连续传代培养第25-26页
        2.1.11 不同代次病毒TCID50的测定第26页
        2.1.12 TGEV CN12株的全基因组序列的测定与分析第26-31页
            2.1.12.1 全基因序列引物的合成第26-28页
            2.1.12.2 TGEV CN12株全基因组分段RT-PCR扩增第28页
            2.1.12.3 PCR产物的回收与纯化第28-29页
            2.1.12.4 PCR纯化产物的连接第29页
            2.1.12.5 DH5α感受态细胞的制备第29页
            2.1.12.6 连接产物转化DH5α 感受态细胞第29-30页
            2.1.12.7 PCR筛选阳性克隆第30页
            2.1.12.8 TGEV CN12株全基因序列测定与比较分析第30-31页
    2.2 结果与分析第31-34页
        2.2.1 病毒的繁殖第31页
        2.2.2 病毒的纯化第31页
        2.2.3 纯化后病毒的鉴定第31-32页
        2.2.4 不同代次病毒TCID50的测定第32页
        2.2.5 TGEV CN12株全基因序列测定与比较分析第32-34页
            2.2.5.1 全基因组分段扩增结果第32-33页
            2.2.5.2 TGEV CN12株全基因组与序列分析第33-34页
    2.3 讨论第34-36页
第三章 猪传染性胃肠炎病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立第36-47页
    3.1 材料与方法第36-40页
        3.1.1 毒株、细胞和菌株第36页
        3.1.2 主要试剂及仪器第36页
        3.1.3 TGEV的繁殖第36页
        3.1.4 引物的设计与合成第36页
        3.1.5 质粒模板标准品的制备第36-39页
            3.1.5.1 病毒RNA的提取第36-37页
            3.1.5.2 cDNA第一条链合成与PCR的扩增第37-38页
            3.1.5.3 PCR筛选阳性克隆第38页
            3.1.5.4 重组克隆质粒的抽提第38-39页
        3.1.6 实时荧光定量PCR标准曲线的建立第39页
        3.1.7 特异性试验第39页
        3.1.8 敏感性试验第39-40页
        3.1.9 重复性试验第40页
        3.1.10 临床样品检测与结果分析第40页
    3.2 结果与分析第40-44页
        3.2.1 TGEV S基因的克隆鉴定及质粒模板标准品的制备第40-41页
        3.2.2 实时荧光定量PCR标准曲线的建立第41-42页
        3.2.3 实时荧光定量PCR特异性试验结果第42-43页
        3.2.4 实时荧光定量PCR敏感性试验结果第43页
        3.2.5 实时荧光定量PCR重复性试验结果第43-44页
        3.2.6 临床样品检测试验结果第44页
    3.3 讨论第44-47页
全文总结第47-48页
致谢第48-49页
参考文献第49-55页
附录 pMD18-T Simple Vector的结构图第55页

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