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龙眼体胚发生过程中与ARF相关小分子RNA的功能研究

缩写词第9-10页
摘要第10-14页
Abstract第14-17页
第一章 引言第18-26页
    1 植物小分子RNA研究进展第18-21页
        1.1 植物miRNA及其生物学功能第18-20页
        1.2 植物体胚发生过程中miRNA的研究进展第20页
        1.3 植物ta-siRNA及其生物学功能第20-21页
    2 植物生长素响应基因家族研究进展第21-22页
        2.1 植物生长素响应因子的特征第21-22页
        2.2 植物生长素响应基因克隆与表达研究第22页
    3 植物miRNA及TAS3与其靶基因生长素响应因子的功能研究第22-24页
        3.1 植物miR160、miR167、miR390、TAS3及其靶基因生长素响应因子的互作机制第22-23页
        3.2 Micro-Tom番茄遗传转化研究进展第23-24页
    4 本研究的意义和主要内容第24-26页
        4.1 本项目研究的意义第24-25页
        4.2 本项目的研究内容第25-26页
第二章 龙眼体胚miR160、miR167、miR390与TAS3初级体克隆及生物信息学分析第26-42页
    第一节 龙眼体胚miR160、miR167、miR390与TAS3初级体克隆第26-31页
        1 材料与方法第26-29页
            1.1 材料第26页
            1.2 方法第26-29页
                1.2.1 龙眼体胚不同发育时期的培养材料总RNA提取及cDNA合成第26-27页
                1.2.2 龙眼体胚pri-miR160、pri-miR167、pri-miR390与pri-TAS3克隆的引物设计及PCR扩增第27-29页
                1.2.3 目的基因克隆的PCR反应体系及扩增程序第29页
                1.2.4 目的片段的回收、克隆和测序第29页
        2 结果与分析第29-30页
            2.1 龙眼体胚miR160、miR167、miR390与TAS3基因初级体保守序列的扩增第29-30页
            2.2 龙眼体胚miR160、miR167、miR390与TAS3基因初级体cDNA末端的RACE扩增第30页
        3 讨论第30-31页
            3.1 龙眼体胚miR160、miR167、miR390、TAS3初级体序列克隆存在的问题及意义第30-31页
    第二节 龙眼胚性愈伤组织pri-miR160、pri-miR167、pri-miR390与pri-TAS3生物信息学分析第31-42页
        1 材料与方法第31-32页
            1.1 材料第31页
            1.2 方法第31-32页
        2 结果与分析第32-41页
            2.1 龙眼体胚pri-miR160、pri-miR167、pri-miR390与pri-TAS3二级结构及成熟序列的预测与分析第32-38页
                2.1.1 龙眼体胚pri-miR160二级结构及成熟序列的预测与分析第32-34页
                2.1.2 龙眼体胚pri-miR167二级结构及成熟序列的预测与分析第34-35页
                2.1.3 龙眼体胚pri-miR390二级结构及成熟序列的预测与分析第35-36页
                2.1.4 龙眼体胚pri-TAS3二级结构及成熟序列的预测与分析第36-38页
            2.2 龙眼体胚pri-miR160、pri-miR167、pri-miR390与pri-TAS3的同源性分析第38-41页
                2.2.1 龙眼体胚pri-miR160的同源性分析第38页
                2.2.2 龙眼体胚pri-miR167的同源性分析第38-39页
                2.2.3 龙眼体胚pri-miR390的同源性分析第39-40页
                2.2.4 龙眼体胚pri-TAS3的同源性分析第40-41页
        3 讨论第41-42页
第三章 龙眼胚性愈伤组织靶基因ARFs的克隆及生物信息学分析第42-53页
    第一节 龙眼胚性愈伤组织靶基因ARFs的克隆第42-46页
        1 材料与方法第42-44页
            1.1 材料第42页
            1.2 方法第42-44页
                1.2.1 龙眼胚性愈伤组织、球形胚和鱼雷形胚总RNA提取和cDNA的合成第42页
                1.2.2 龙眼胚性愈伤组织ARFs基因的引物设计及PCR扩增第42-43页
                1.2.3 龙眼胚性愈伤组织ARF基因家族PCR扩增反应体系和程序第43-44页
                1.2.4 目的片段的回收、克隆和测序第44页
        2 结果与分析第44-46页
            2.1 龙眼胚性愈伤组织ARFs基因保守区序列的获得第44页
            2.2 龙眼生长素响应因子ARFs基因cDNA末端的RACE扩增第44-45页
            2.3 龙眼生长素响应因子ARFs基因的核苷酸序列分析第45-46页
    第二节 龙眼生长素响应因子ARF3、ARF4、ARF6、ARF8、ARF10、ARF16和ARF17的生物信息学分析第46-53页
        1 材料与方法第46页
            1.1 材料第46页
            1.2 方法第46页
        2 结果与分析第46-51页
            2.1 龙眼胚性愈伤组织生长素响应蛋白ARFs理化性质与保守结构域的预测与分析第46-47页
            2.2 龙眼胚性愈伤组织生长素响应蛋白ARFs磷酸化位点的预测与分析第47-48页
            2.3 龙眼胚性愈伤组织生长素响应蛋白ARFs二级及三维结构的预测与分析第48-49页
            2.4 龙眼胚性愈伤组织生长素响应蛋白ARFs的亚细胞定位和信号肽预测分析第49页
            2.5 龙眼胚性愈伤组织ARFs蛋白质的跨膜结构预测与分析第49-50页
            2.6 龙眼胚性愈伤组织生长素响应蛋白ARF3、ARF6、ARF8、ARF10、ARF16和ARF17与拟南芥ARF蛋白家族的的系统进化树分析第50-51页
        3 讨论第51-53页
第四章 龙眼生长素响应因子ARFs及TAS3基因的裂解位点验证第53-59页
    1 材料与方法第53-54页
        1.1 材料第53页
        1.2 方法第53-54页
    2 结果与分析第54-57页
        2.1 龙眼TAS3基因及其靶基因ARF3、ARF4的裂解位点验证第54-55页
        2.2 龙眼miR167靶基因ARF6、ARF8的裂解位点验证第55-56页
        2.3 龙眼miR160靶基因ARF10、ARF16、ARF17的裂解位点验证第56-57页
    3 讨论第57-59页
第五章 龙眼体胚发生过程中小分子RNA及其靶基因ARFs的定量表达分析第59-76页
    1 材料与方法第59-61页
        1.1 材料第59-60页
        1.2 方法第60-61页
            1.2.1 不同浓度2,4-D处理龙眼胚性愈伤组织第60页
            1.2.2 总RNA的提取和cDNA的合成第60页
            1.2.3 实时荧光定量PCR第60-61页
    2 结果与分析第61-72页
        2.1 龙眼体胚发生过程中小分子RNA及其靶基因ARFs在龙眼体细胞胚胎不同发育阶段的qPCR分析第61-65页
            2.1.1 龙眼TAS3基因及其靶基因ARF3、ARF4在龙眼体细胞胚胎不同发育阶段的表达分析第62页
            2.1.2 龙眼miR167初级体及其靶基因ARF6、ARF8在龙眼体细胞胚胎不同发育阶段的表达分析第62-63页
            2.1.3 龙眼miR160初级体及其靶基因ARF1O、ARF16、ARF17在龙眼体细胞胚胎不同发育阶段的表达分析第63-64页
            2.1.4 龙眼miR390初级体及其靶基因TAS3在龙眼体细胞胚胎不同发育阶段的表达分析第64-65页
        2.2 龙眼小分子RNA及其靶基因ARFs在龙眼“四季蜜”不同组织部位的qPCR分析第65-69页
            2.2.1 龙眼TAS3基因及其靶基因ARF3、ARF4在龙眼“四季蜜”不同组织部位的表达分析第65-66页
            2.2.2 龙眼miR167初级体及其靶基因ARF6、ARF8在龙眼“四季蜜”不同组织部位的表达分析第66-67页
            2.2.3 龙眼miR160初级体及其靶基因ARF10、ARF16、ARF17在龙眼“四季蜜”不同组织部位的表达分析第67-68页
            2.2.4 龙眼miR390初级体及其靶基因TAS3在龙眼“四季蜜”不同组织部位的表达分析第68-69页
        2.3 龙眼小分子RNA及其靶基因ARFs在2,4-D处理下龙眼胚性愈伤组织中的qPCR分析第69-72页
            2.3.1 龙眼TAS3基因及其靶基因ARF3、ARF4在2,4-D处理下龙眼胚性愈伤组织中的表达分析第69页
            2.3.2 龙眼miR167初级体及其靶基因ARF6、ARF8在2,4-D处理下龙眼胚性愈伤组织中的表达分析第69-70页
            2.3.3 龙眼miR1 60初级体及其靶基因ARF10、ARF16、ARF17在2,4-D处理下龙眼胚性愈伤组织中的表达分析第70-71页
            2.3.4 龙眼miR390初级体及其靶基因TAS3在2,4-D处理下龙眼胚性愈伤组织中的表达分析第71-72页
    3 讨论第72-76页
        3.1 龙眼miR160、miR167、miR390、TAS3初级体及其靶基因ARFs的互作机制介导龙眼体胚的发生第72-73页
        3.2 龙眼miR160、miR167、miR390、TAS3初级体及其靶基因ARFs在龙眼“四季蜜”不同组织的特异性表达第73-74页
        3.3 不同浓度2,4-D处理下龙眼miR160、miR167、miR390、TAS3初级体及其靶基因ARFs的表达差异第74-76页
第六章 龙眼TAS3基因转化Micro-Tom番茄的研究第76-85页
    1 材料与方法第76-78页
        1.1 材料第76-77页
            1.1.1 试验材料第76页
            1.1.2 培养基组分第76页
            1.1.3 试验试剂第76-77页
        1.2 方法第77-78页
            1.2.1 龙眼TAS3基因超表达载体的构建第77页
            1.2.2 农杆菌介导的龙眼TAS3表达载体的转化第77页
            1.2.3 根癌农杆菌转化番茄子叶第77-78页
            1.2.4 转基因植株的检测第78页
            1.2.5 检测TAS3、miR390、ARF3和ARF4在转基因番茄中的表达情况第78页
    2 结果与分析第78-83页
        2.1 构建植物表达载体及重组质粒的鉴定第78-79页
        2.2 检测转基因植株第79-80页
        2.3 T_0代转基因植物的表型第80-81页
        2.4 转基因番茄定量表达分析第81-83页
            2.4.1 检测分析TAS3、miR390在转基因番茄中的表达情况第81-82页
            2.4.2 检测分析ARF3在转基因番茄中的表达情况第82页
            2.4.3 检测分析ARF4在转基因番茄中的表达情况第82-83页
    3 讨论第83-85页
        3.1 过表达龙眼TAS3基因影响植物根部、茎干及叶片的生长第83页
        3.2 龙眼TAS3、miR390和ARFs三者之间的互作机制研究第83-85页
第七章 小结第85-90页
    1 龙眼体胚miR160、miR167、miR390与TAS3初级体克隆及生物信息学分析第85页
    2 龙眼胚性愈伤组织靶基因ARF3、ARF4、ARF6、ARF8、ARF10、ARF16、ARF17的克隆及生物信息学分析第85-86页
    3 龙眼TAS3、ARF3、ARF4、ARF6、ARF8、ARF1O、ARF16、ARF17的裂解位点验证第86-87页
    4 龙眼体胚miR160、miR167、miR390与TAS3初级体及其靶基因ARFs的定量表达分析第87页
    5 龙眼TAS3基因超表达研究及其与miR390、ARFs三者间的互作机制研究第87-90页
参考文献第90-96页
附录第96-110页
    附录1 GenBank上登录的龙眼miR160、miR167、miR390与TAS3初级体及其靶基因的序列信息(12条)第96-109页
    附录2 转基因植株表型图第109-110页
在学硕士期间发表学术论文情况第110-111页
    一、在学期间发表论文第110页
    二、在学期间参加的学术会议第110-111页
致谢第111页

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