| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 第1章 引言 | 第15-35页 |
| 1.1 研究目的及意义 | 第15-16页 |
| 1.2 温度对植物生长的影响 | 第16-17页 |
| 1.2.1 温度对植物生长发育的影响 | 第16页 |
| 1.2.2 温度对植物光合作用的影响 | 第16-17页 |
| 1.3 烟碱代谢研究进展 | 第17-29页 |
| 1.3.1 烟碱代谢途径 | 第17-23页 |
| 1.3.1.1 吡咯环的形成 | 第18-20页 |
| 1.3.1.2 吡啶环的形成 | 第20-21页 |
| 1.3.1.3 吡啶环和吡咯环的结合 | 第21-23页 |
| 1.3.2 烟碱转化 | 第23-24页 |
| 1.3.3 烟碱代谢的上游调控 | 第24-26页 |
| 1.3.4 烟碱的转运 | 第26页 |
| 1.3.5 烟碱合成的环境调控 | 第26-29页 |
| 1.3.5.1 土壤 | 第27页 |
| 1.3.5.2 光照 | 第27-28页 |
| 1.3.5.3 温度 | 第28页 |
| 1.3.5.4 水分 | 第28-29页 |
| 1.4 植物叶绿素代谢研究进展 | 第29-34页 |
| 1.4.1 植物叶绿素的分解代谢 | 第29-31页 |
| 1.4.1.1 叶绿素b向叶绿素a的转化 | 第29-30页 |
| 1.4.1.2 叶绿素a的绿色降解产物 | 第30-31页 |
| 1.4.1.3 绿色降解产物的进一步代谢 | 第31页 |
| 1.4.1.4 叶绿素降解产物的最终代谢 | 第31页 |
| 1.4.2 植物叶绿素降解相关的酶 | 第31-33页 |
| 1.4.2.1 叶绿素b还原酶 | 第31-32页 |
| 1.4.2.2 叶绿素酶 | 第32页 |
| 1.4.2.3 脱镁螯合酶 | 第32页 |
| 1.4.2.4 脱镁叶绿素甲酯酸a单加氧酶 | 第32页 |
| 1.4.2.5 红色叶绿素降解物还原酶 | 第32-33页 |
| 1.4.3 环境因子对叶绿素的影响 | 第33-34页 |
| 1.4.3.1 光 | 第33页 |
| 1.4.3.2 温度 | 第33页 |
| 1.4.3.3 水分 | 第33-34页 |
| 1.5 技术路线 | 第34-35页 |
| 第2章 基于de novo全转录组和RNA-seq分析不同生长温度对烟草生物碱含量及烟碱代谢的影响 | 第35-73页 |
| 2.1 引言 | 第35-36页 |
| 2.2 材料与方法 | 第36-44页 |
| 2.2.1 供试材料与处理 | 第36-38页 |
| 2.2.1.1 供试材料及培养 | 第36页 |
| 2.2.1.2 不同温度处理 | 第36页 |
| 2.2.1.3 样品收集 | 第36-38页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第38页 |
| 2.2.2.1 生长指标的测定 | 第38页 |
| 2.2.2.2 烟碱及其微量生物碱含量测定 | 第38页 |
| 2.2.3 烟草（Nicotiana tabacum L. var. Yun87）全转录组的测序及解析 | 第38-40页 |
| 2.2.3.1 De novo全转录组测序文库的构建 | 第38-39页 |
| 2.2.3.2 测序reads去噪及序列从头拼接（de nevo） | 第39-40页 |
| 2.2.3.3 Unigene数据的功能注释、分类及代谢途径分析 | 第40页 |
| 2.2.3.4 烟碱代谢途径关键基因的鉴定 | 第40页 |
| 2.2.4 不同生长温度影响烟草发育过程中数字基因表达谱的解析 | 第40-42页 |
| 2.2.4.1 数字基因表达谱测序样品的制备及测序 | 第40-41页 |
| 2.2.4.2 基于转录组测序数据的数字基因表达谱Tag的功能注释 | 第41-42页 |
| 2.2.4.3 烟碱代谢相关基因表达模式的聚类分析 | 第42页 |
| 2.2.5 烟碱代谢相关基因实时荧光定量PCR分析 | 第42-44页 |
| 2.2.5.1 RNA提取与质量检测 | 第42-43页 |
| 2.2.5.2 引物设计及cDNA合成 | 第43页 |
| 2.2.5.3 引物筛选 | 第43-44页 |
| 2.2.5.4 标准曲线的制作 | 第44页 |
| 2.2.5.5 基因表达量分析 | 第44页 |
| 2.2.6 数据处理 | 第44页 |
| 2.3 结果与分析 | 第44-67页 |
| 2.3.1 不同生长温度对烟叶生长的影响 | 第44-47页 |
| 2.3.2 不同生长温度对烟株干物质含量积累的影响 | 第47-48页 |
| 2.3.3 不同生长温度对烟草烟碱及微量生物碱含量的影响 | 第48-52页 |
| 2.3.3.1 不同生长温度对烟草烟碱含量的影响 | 第48-49页 |
| 2.3.3.2 不同生长温度对烟草新烟碱含量的影响 | 第49-50页 |
| 2.3.3.3 不同生长温度对烟草假木贼碱含量的影响 | 第50-51页 |
| 2.3.3.4 不同生长温度对烟草降烟碱含量的影响 | 第51-52页 |
| 2.3.4 转录组解析结果 | 第52-59页 |
| 2.3.4.1 测序数据处理及统计 | 第52-54页 |
| 2.3.4.2 Unigene功能注释及COG分类 | 第54-56页 |
| 2.3.4.3 Unigene的GO分类 | 第56-58页 |
| 2.3.4.4 转录组中烟碱代谢相关Unigenes的鉴定 | 第58-59页 |
| 2.3.5 烟碱代谢数字基因表达谱的解析 | 第59-61页 |
| 2.3.6 荧光定量PCR结果 | 第61-65页 |
| 2.3.6.1 不同生长温度对烟碱吡咯环合成相关酶基因表达的影响 | 第61-63页 |
| 2.3.6.2 不同生长温度对烟碱吡啶环合成相关酶基因表达的影响 | 第63-64页 |
| 2.3.6.3 不同生长温度对烟碱两环形成的相关酶基因表达的影响 | 第64-65页 |
| 2.3.7 qPCR与RNA-seq的相关性分析结果 | 第65-66页 |
| 2.3.8 烟碱代谢途径相关酶基因差异表达聚类结果 | 第66-67页 |
| 2.4 讨论 | 第67-73页 |
| 2.4.1 不同生长温度对烟叶生长及干物质含量积累的影响 | 第67-68页 |
| 2.4.2 转录组及表达谱解析 | 第68-69页 |
| 2.4.3 不同生长温度对烟草生物碱含量的影响 | 第69-70页 |
| 2.4.4 烟碱含量与代谢相关酶基因聚类分析 | 第70-73页 |
| 第3章 生长温度对不同生育期烟草生物碱含量及烟碱代谢的影响 | 第73-89页 |
| 3.1 引言 | 第73页 |
| 3.2 材料与方法 | 第73-76页 |
| 3.2.1 材料与处理 | 第73-75页 |
| 3.2.1.1 供试材料及培养 | 第74页 |
| 3.2.1.2 不同温度处理 | 第74-75页 |
| 3.2.1.3 样品收集 | 第75页 |
| 3.2.2 测定指标与方法 | 第75页 |
| 3.2.2.1 烟碱及其微量生物碱含量测定 | 第75页 |
| 3.2.3 烟碱代谢相关基因实时荧光定量PCR分析 | 第75-76页 |
| 3.2.4 数据处理 | 第76页 |
| 3.3 结果与分析 | 第76-85页 |
| 3.3.1 不同生长温度对烟草根系生物碱含量的影响 | 第76-79页 |
| 3.3.2 不同生长温度对烟草叶片生物碱含量的影响 | 第79-82页 |
| 3.3.3 不同生长温度对烟碱代谢相关酶基因表达的影响 | 第82-85页 |
| 3.4 讨论 | 第85-89页 |
| 3.4.1 不时期气温对烟碱含量的影响 | 第85-87页 |
| 3.4.2 不同时期气温对烟碱代谢关键酶基因表达的影响 | 第87-89页 |
| 第4章 生长温度对不同生育期烟草叶片光合作用及质体色素代谢的影响 | 第89-113页 |
| 4.1 引言 | 第89-90页 |
| 4.2 材料与方法 | 第90-91页 |
| 4.2.1 材料与处理 | 第90页 |
| 4.2.2 测定指标与方法 | 第90页 |
| 4.2.2.1 烟叶生长指标的测定 | 第90页 |
| 4.2.2.2 光合参数的测定 | 第90页 |
| 4.2.2.3 质体色素含量及相关酶活性测定 | 第90页 |
| 4.2.3 荧光定量PCR | 第90-91页 |
| 4.2.4 数据处理 | 第91页 |
| 4.3 结果与分析 | 第91-109页 |
| 4.3.1 不同生长温度对烟叶生长的影响 | 第91-93页 |
| 4.3.2 不同生长温度对不同生育期烟叶净光合速率的影响 | 第93-94页 |
| 4.3.3 不同生长温度对烟叶质体色素含量的影响 | 第94-98页 |
| 4.3.3.1 叶绿素含量的影响 | 第94-97页 |
| 4.3.3.2 类胡萝卜素含量的影响 | 第97-98页 |
| 4.3.4 不同生长温度对不同生育期烟叶质体色素降解代谢相关酶的影响 | 第98-103页 |
| 4.3.4.1 移栽-团棵期叶绿素降解代谢相关酶的活性 | 第98-100页 |
| 4.3.4.2 团棵-现蕾期叶绿素降解代谢相关酶活性 | 第100-101页 |
| 4.3.4.3 成熟期叶绿素降解代谢相关酶活性 | 第101-102页 |
| 4.3.4.4 类胡萝卜素降解关键酶LOX活性 | 第102-103页 |
| 4.3.5 不同生长温度对烟叶质体色素降解代谢相关酶基因表达的影响 | 第103-109页 |
| 4.3.5.1 移栽-团棵期质体色素降解代谢相关酶基因表达变化分析 | 第103-105页 |
| 4.3.5.2 团棵—现蕾期质体色素降解代谢相关酶基因表达变化分析 | 第105页 |
| 4.3.5.3 成熟期质体色素降解代谢相关酶基因表达变化分析 | 第105-107页 |
| 4.3.5.4 不同生长温度对烟叶LOX基因表达变化分析 | 第107-109页 |
| 4.4 结论与讨论 | 第109-113页 |
| 4.4.1 烤烟生长及叶片净光合速率 | 第109页 |
| 4.4.2 烟叶叶绿素含量变化 | 第109-110页 |
| 4.4.3 烟叶类胡萝卜素含量变化 | 第110页 |
| 4.4.4 烟叶质体色素代谢相关酶 | 第110-111页 |
| 4.4.5 烟叶质体色素代谢相关酶基因表达差异 | 第111-113页 |
| 第5章 总结 | 第113-115页 |
| 参考文献 | 第115-126页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文和研究成果 | 第126-127页 |
| 致谢 | 第127页 |
