| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 鳄类寄生虫研究进展 | 第13-23页 |
| 1 鳄类寄生虫种类 | 第13-16页 |
| 1.1 原生动物门 | 第13-14页 |
| 1.2 扁形动物门 | 第14页 |
| 1.3 线形动物门 | 第14-15页 |
| 1.4 其他寄生虫 | 第15-16页 |
| 2 鳄类寄生虫生活史 | 第16-18页 |
| 2.1 原生动物门 | 第16-17页 |
| 2.2 线形动物门 | 第17-18页 |
| 3 寄生虫对鳄类危害 | 第18-19页 |
| 3.1 原生动物门 | 第18页 |
| 3.2 线形动物门 | 第18页 |
| 3.3 其他寄生虫 | 第18-19页 |
| 4 鳄类寄生虫诊断 | 第19-21页 |
| 4.1 病原学诊断 | 第19-20页 |
| 4.2 免疫学诊断 | 第20页 |
| 4.3 分子生物学诊断 | 第20-21页 |
| 5 鳄类寄生虫防治 | 第21-22页 |
| 6 研究的目的及意义 | 第22-23页 |
| 第二章 扬子鳄肠道寄生虫种类及其多样性的初步研究 | 第23-35页 |
| 1 材料和方法 | 第24-26页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第24页 |
| 1.2 样本采集地 | 第24页 |
| 1.3 粪样收集 | 第24页 |
| 1.4 粪样检查 | 第24-25页 |
| 1.5 数据处理 | 第25-26页 |
| 2 结果 | 第26-30页 |
| 2.1 扬子鳄肠道寄生虫种类 | 第26-27页 |
| 2.2 不同月份扬子鳄肠道寄生虫感染情况 | 第27页 |
| 2.3 不同龄期扬子鳄肠道寄生虫感染情况 | 第27页 |
| 2.4 不同月份扬子鳄肠道寄生虫多样性 | 第27页 |
| 2.5 不同龄期扬子鳄肠道寄生虫多样性 | 第27-30页 |
| 3 讨论 | 第30-35页 |
| 3.1 扬子鳄肠道寄生虫感染情况分析 | 第31-32页 |
| 3.2 扬子鳄肠道寄生虫多样性分析 | 第32页 |
| 3.3 扬子鳄肠道寄生虫防治措施 | 第32-35页 |
| 第三章 新种线虫Ortleppascaris sinensis sp. nov.的形态和分子鉴定 | 第35-53页 |
| 1 材料和方法 | 第35-38页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第35-36页 |
| 1.2 线虫标本的收集与保存 | 第36页 |
| 1.3 线虫标本的形态学观察 | 第36-37页 |
| 1.4 分子特征分析 | 第37-38页 |
| 2. 结果 | 第38-44页 |
| 2.1 线虫O. sinensis的形态特征 | 第38-39页 |
| 2.2 线虫O. sinensis的分子特征 | 第39-44页 |
| 3 讨论 | 第44-53页 |
| 3.1 线虫分类依据 | 第44页 |
| 3.2 线虫Ortleppascaris属划分依据 | 第44-48页 |
| 3.3 线虫O. sinensis与Ortleppascaris属线虫形态学特征比较 | 第48-50页 |
| 3.4 线虫O. sinensis与Ortleppascaris属线虫分子特征比较 | 第50-53页 |
| 第四章 线虫Ortleppascaris sinensis线粒体基因组测定及蛔目系统发生分析 | 第53-93页 |
| 1 材料和方法 | 第54-58页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第54页 |
| 1.2 线虫标本的收集与保存 | 第54页 |
| 1.3 线虫O. sinensis基因组DNA的提取 | 第54页 |
| 1.4 引物设计 | 第54-56页 |
| 1.5 常规PCR和Long-PCR | 第56页 |
| 1.6 序列处理、校对及拼接 | 第56页 |
| 1.7 线虫O. sinensis线粒体基因组结构特征分析 | 第56-57页 |
| 1.8 蛔目线虫线粒体基因组序列比较分析 | 第57-58页 |
| 1.9 蛔目线虫系统发生分析 | 第58页 |
| 2 结果 | 第58-86页 |
| 2.1 线虫O. sinensis线粒体基因组结构特征分析 | 第58-69页 |
| 2.2 蛔目线虫线粒体基因组比较分析 | 第69-84页 |
| 2.3 蛔目线虫系统发生分析 | 第84-86页 |
| 3 讨论 | 第86-93页 |
| 3.1 线粒体基因组大小、碱基组成及分布 | 第87-88页 |
| 3.2 密码子使用 | 第88-89页 |
| 3.3 tRNA和rRNA | 第89-90页 |
| 3.4 AT富集区 | 第90页 |
| 3.5 蛔目线虫系统发生分析 | 第90-93页 |
| 第五章 感染线虫Ortleppascaris sinensis的扬子鳄胃壁组织病理变化 | 第93-101页 |
| 1 材料和方法 | 第93-94页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第93页 |
| 1.2 线虫标本的收集 | 第93页 |
| 1.3 病理标本的准备 | 第93-94页 |
| 2 结果 | 第94-98页 |
| 2.1 样本采集信息 | 第94页 |
| 2.2 线虫鉴定 | 第94-95页 |
| 2.3 胃肠壁病理改变 | 第95-98页 |
| 3 讨论 | 第98-101页 |
| 第六章 线虫Ortleppascaris sinensis的LAMP快速检测法 | 第101-111页 |
| 1 材料和方法 | 第101-104页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第101页 |
| 1.2 线虫O. sinensis基因组DNA提取及验证 | 第101-102页 |
| 1.3 LAMP引物设计 | 第102-103页 |
| 1.4 LAMP反应体系的初步建立 | 第103页 |
| 1.5 LAMP扩增产物检测 | 第103页 |
| 1.6 LAMP反应体系优化 | 第103页 |
| 1.7 PCR检测线虫O. sinensis | 第103-104页 |
| 1.8 LAMP敏感性检测 | 第104页 |
| 1.9 LAMP特异性检测 | 第104页 |
| 1.10 LAMP检测感染线虫O. sinensis扬子鳄粪样 | 第104页 |
| 2. 结果 | 第104-108页 |
| 2.1 LAMP反应体系优化结果 | 第104页 |
| 2.2 LAMP反应扩增产物的鉴定 | 第104页 |
| 2.3 LAMP敏感性检测 | 第104-106页 |
| 2.4 LAMP特异性检测 | 第106-107页 |
| 2.5 LAMP检测感染线虫O. sinensis扬子鳄粪样 | 第107-108页 |
| 3 讨论 | 第108-111页 |
| 第七章 结论 | 第111-113页 |
| 1. 结论 | 第111-112页 |
| 2. 创新点 | 第112页 |
| 3. 拟进一步研究内容 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-127页 |
| 致谢 | 第127-129页 |
| 附Ⅰ：鳄类寄生虫种类 | 第129-157页 |
| 附Ⅱ：读博期间发表论文 | 第157页 |
