| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 L-丝氨酸的概述 | 第9-10页 |
| 1.1.1 L-丝氨酸的理化性质 | 第9页 |
| 1.1.2 L-丝氨酸的生理意义及应用 | 第9页 |
| 1.1.3 L-丝氨酸的生产方法 | 第9-10页 |
| 1.2 谷氨酸棒杆菌产L-丝氨酸的研究 | 第10-12页 |
| 1.2.1 谷氨酸棒杆菌的简介 | 第10页 |
| 1.2.2 谷氨酸棒杆菌中L-丝氨酸的生物合成途径 | 第10-11页 |
| 1.2.3 谷氨酸棒杆菌产L-丝氨酸的代谢工程改造 | 第11-12页 |
| 1.3 基因组测序的研究 | 第12-14页 |
| 1.3.1 基因组学研究背景 | 第12页 |
| 1.3.2 基因组测序技术的发展 | 第12-13页 |
| 1.3.3 谷氨酸棒杆菌基因组测序的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.4 比较基因组学的研究 | 第14-16页 |
| 1.4.1 比较基因组学的概念 | 第14-15页 |
| 1.4.2 比较基因组学在工业微生物育种中的应用 | 第15-16页 |
| 1.5 本论文立题依据 | 第16页 |
| 1.6 研究内容 | 第16-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-27页 |
| 2.1 实验材料 | 第17-19页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第17页 |
| 2.1.2 本论文所用的引物 | 第17-18页 |
| 2.1.3 培养基 | 第18-19页 |
| 2.1.4 仪器设备 | 第19页 |
| 2.1.5 实验试剂 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-27页 |
| 2.2.1 细菌基因组提取、测序、组装及注释 | 第19-20页 |
| 2.2.2 谷氨酸棒杆菌进化分析 | 第20页 |
| 2.2.3 核心基因和特有基因分析 | 第20页 |
| 2.2.4 SNP和InDel分析 | 第20页 |
| 2.2.5 丙酮酸脱氢酶酶活测定 | 第20-21页 |
| 2.2.6 敲除及回复突变质粒构建 | 第21-22页 |
| 2.2.7 感受态的制备与转化 | 第22页 |
| 2.2.8 谷氨酸棒杆菌基因敲除及回复突变菌株构建 | 第22-24页 |
| 2.2.9 摇瓶发酵及菌株发酵过程曲线测定 | 第24页 |
| 2.2.10 代谢流量分析 | 第24-27页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第27-45页 |
| 3.1 SYPS-062基因组特征分析 | 第27-33页 |
| 3.1.1 基因组测序与SYPS-062进化分析 | 第27-28页 |
| 3.1.2 SYPS-062 COG功能分析 | 第28-29页 |
| 3.1.3 SYPS-062核心基因与特有基因、SNP与Indel分析 | 第29-33页 |
| 3.1.4 分析与讨论 | 第33页 |
| 3.2 SYPS-062与SYPS06233a比较基因组学分析 | 第33-41页 |
| 3.2.1 SYPS-062与SYPS06233a基因组差异分析 | 第33-34页 |
| 3.2.2 差异基因敲除或回复突变菌株的构建 | 第34-36页 |
| 3.2.3 差异基因敲除或回复突变菌株的发酵性能 | 第36-37页 |
| 3.2.4 aceE点突变对SYPS06233a代谢流的影响 | 第37-40页 |
| 3.2.5 分析与讨论 | 第40-41页 |
| 3.3 aceE点突变对不同表型谷氨酸棒杆菌的影响 | 第41-45页 |
| 3.3.1 aceE点突变对菌株 33aΔSS表型的影响 | 第41-42页 |
| 3.3.2 aceE点突变对菌株 33aΔSSAAI表型的影响 | 第42-44页 |
| 3.3.3 分析与讨论 | 第44-45页 |
| 主要结论与展望 | 第45-47页 |
| 主要结论 | 第45-46页 |
| 展望 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-51页 |
| 附录 1：作者在攻读硕士期间发表的论文 | 第51-52页 |
| 附录 2：SYPS-062与ATCC14067基因组间的特有基因 | 第52-57页 |
| 附录 3：SYPS-062与SYPS06233a基因组间的SNP和InDel | 第57页 |
