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番茄褪绿病毒的分子鉴定及荧光定量PCR检测体系的建立与应用

中文摘要第9-11页
Abstract第11-12页
1 前言第13-29页
    1.1 番茄褪绿病毒简介第13-22页
        1.1.1 番茄褪绿病毒的分类及病原特征第13-14页
        1.1.2 番茄褪绿病毒发生和分布第14-15页
        1.1.3 番茄褪绿病毒的寄主范围和危害第15-16页
        1.1.4 番褪绿病毒的生物学特性第16-17页
        1.1.5 番茄褪绿病毒的传播介体及方式第17-18页
        1.1.6 番茄褪绿病毒的检测技术第18-21页
        1.1.7 番茄褪绿病毒病的防治措施第21-22页
    1.2 番茄黄化曲叶病毒简介第22-25页
        1.2.1 番茄黄化曲叶病毒的分类及特征第22页
        1.2.2 番茄黄化曲叶病毒病发生情况及田间寄主范围第22-23页
        1.2.3 番茄黄化曲叶病毒病的传播方式第23-24页
        1.2.4 番茄黄花曲叶病毒病的症状第24页
        1.2.5 番茄黄化曲叶病毒的检测技术第24-25页
    1.3 荧光定量PCR简介第25-28页
        1.3.1 荧光定量PCR的原理第25页
        1.3.2 实时荧光定量PCR的几个重要参数第25-26页
        1.3.3 实时荧光PCR的分类第26页
        1.3.4 实时荧光定量PCR的方法第26-27页
        1.3.5 荧光定量PCR的特点第27页
        1.3.6 荧光定量PCR的应用第27-28页
    1.4 研究目的意义与内容第28-29页
2 材料与方法第29-46页
    2.1 实验材料与仪器第29-31页
        2.1.1 样品采集第29-30页
        2.1.2 试剂与耗材第30页
        2.1.3 主要实验仪器第30-31页
        2.1.4 实验所需试剂及配制第31页
    2.2 番茄褪绿病毒的鉴定及检测第31-38页
        2.2.1 样品RNA提取第31-32页
        2.2.2 引物的设计与合成第32-33页
        2.2.3 反转录cDNA的合成第33页
        2.2.4 PCR扩增第33-34页
        2.2.5 PCR产物的琼脂糖凝胶电泳检测第34页
        2.2.6 PCR产物回收第34-35页
        2.2.7 基因片段连接载体第35页
        2.2.8 大肠杆菌感受态细胞的制备第35-36页
        2.2.9 连接产物转化大肠杆菌第36页
        2.2.10 阳性克隆的PCR验证第36-37页
        2.2.11 碱裂解法提取质粒DNA第37-38页
        2.2.12 重组质粒的鉴定第38页
        2.2.13 序列分析第38页
    2.3 番茄黄化曲叶病毒与番茄褪绿病毒复合侵染的鉴定第38-40页
        2.3.1 样品DNA提取第38-39页
        2.3.2 番茄黄化曲叶病毒的PCR检测与扩增第39页
        2.3.3 PCR产物的克隆及测序第39-40页
    2.4 番茄褪绿病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR体系的建立第40-46页
        2.4.1 引物设计与验证第40页
        2.4.2 模板RNA的提取及cDNA的制备第40-41页
        2.4.3 PCR扩增第41页
        2.4.4 PCR产物的克隆及测序第41-42页
        2.4.5 SYBR Green l荧光定量PCR反应体系条件的优化第42-43页
        2.4.6 标准曲线的绘制第43-44页
        2.4.7 溶解曲线的分析第44页
        2.4.8 特异性试验第44页
        2.4.9 灵敏度检测第44页
        2.4.10 重复性试验第44页
        2.4.11 SYBR Green I光定量PCR的检测样品第44-45页
        2.4.12 接种不同时间病毒含量变化第45-46页
3 结果与分析第46-61页
    3.1 番茄褪绿病毒的鉴定第46-52页
        3.1.1 天津、河北番茄褪绿病毒的鉴定及检测第46-47页
        3.1.2 天津、河北番茄褪绿病毒分离物外壳蛋白及热激蛋白扩增第47-48页
        3.1.3 序列一致性分析结果第48-49页
        3.1.4 系统进化树分析第49-52页
    3.2 番茄黄化曲叶病毒与番茄褪绿病毒复合侵染的鉴定第52页
    3.3 ToCV SYBR Green I荧光定量PCR方法的建立第52-61页
        3.3.1 RNA提取及PCR验证第52-54页
        3.3.2 重组质粒的鉴定第54页
        3.3.3 ToCV SYBR Green I荧光定量PCR反应体系条件的优化第54-56页
        3.3.4 标准曲线的绘制第56-57页
        3.3.5 溶解曲线的建立第57页
        3.3.6 特异性试验第57-58页
        3.3.7 灵敏度检测第58页
        3.3.8 重复性试验第58-59页
        3.3.9 样品的检测第59-61页
4 讨论第61-63页
    4.1 番茄褪绿病毒的检测与鉴定第61页
    4.2 番茄褪绿病毒和番茄黄化曲叶病毒复合侵染第61-62页
    4.3 ToCV SYBR Green I荧光定量PCR方法的建立第62-63页
5 结论第63-64页
参考 文献第64-72页
致谢第72-73页
攻读硕士学位期间发表论文第73页

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