| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 缩略词表 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-27页 |
| 1 重金属铅(Pb)污染是制约蔬菜产品质量安全的重要因素 | 第15页 |
| 2 植物Pb吸收、防御解毒和毒害的分子机制 | 第15-19页 |
| ·植物对Pb的吸收累积 | 第16-17页 |
| ·植物对Pb的防御解毒机制 | 第17-18页 |
| ·Pb对植物的毒害机制 | 第18-19页 |
| 3 NGS在植物转录组及重金属胁迫响应基因鉴定中的应用 | 第19-20页 |
| 4 植物重金属胁迫响应miRNAs的分离鉴定与调控机制 | 第20-22页 |
| ·重金属胁迫响应差异miRNAs的分离鉴定 | 第20-21页 |
| ·植物miRNA重金属胁迫响应调控机制 | 第21-22页 |
| 5 蛋白组学技术在解析植物重金属胁迫响应调控机制中的应用 | 第22-23页 |
| 6 代谢组学技术在解析植物重金属胁迫响应中的应用 | 第23-24页 |
| 7 本研究目的与意义 | 第24-27页 |
| 第二章 基于NGS技术的萝卜肉质根转录组de novo测序分析 | 第27-37页 |
| 1 材料与方法 | 第28-29页 |
| ·植物材料 | 第28页 |
| ·试验方法 | 第28-29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-34页 |
| ·萝卜肉质根的转录组Illumina测序和de novo组装 | 第29-30页 |
| ·组装Unigene的功能注释 | 第30-32页 |
| ·组装Unigene的GO分类 | 第32页 |
| ·组装Unigene的COG分类 | 第32-33页 |
| ·组装Unigene的KEGG分类 | 第33-34页 |
| 3 讨论 | 第34-37页 |
| 第三章 萝卜肉质根Pb胁迫响应相关基因表达谱分析 | 第37-51页 |
| 1 材料与方法 | 第38-41页 |
| ·植物材料与胁迫处理 | 第38页 |
| ·试验方法 | 第38-41页 |
| 2 结果与分析 | 第41-49页 |
| ·测序结果统计分析 | 第41页 |
| ·Pb胁迫响应差异基因筛选 | 第41-42页 |
| ·差异表达基因的GO功能富集分析 | 第42-43页 |
| ·差异表达基因的KEGG pathway富集分析 | 第43-45页 |
| ·参与植物重金属防御和解毒机制的候选差异基因鉴定 | 第45-48页 |
| ·差异基因表达模式qRT-PCR验证 | 第48-49页 |
| 3 讨论 | 第49-51页 |
| 第四章 萝卜肉质根Pb胁迫响应miRNA及其靶基因的分离与鉴定 | 第51-69页 |
| 1 材料与方法 | 第52-54页 |
| ·植物材料与胁迫处理 | 第52页 |
| ·试验方法 | 第52-54页 |
| 2 结果与分析 | 第54-64页 |
| ·萝卜肉质根sRNA文库序列分析 | 第54-56页 |
| ·已知miRNA的分离鉴定 | 第56-57页 |
| ·新型miRNA的分离鉴定 | 第57-58页 |
| ·萝卜Pb胁迫响应miRNA的分离鉴定 | 第58页 |
| ·降解组测序验证萝卜肉质根中鉴定miRNA的靶基因 | 第58-61页 |
| ·Pb胁迫响应miRNA靶基因鉴定 | 第61-63页 |
| ·miRNA靶基因qRT-PCR验证 | 第63-64页 |
| 3 讨论 | 第64-69页 |
| ·通过Solexa测序技术鉴定萝卜中Pb胁迫响应miRNA | 第64-65页 |
| ·萝卜Pb胁迫响应的miRNA介导的调控网络 | 第65-69页 |
| 第五章 利用iTRAQ技术进行萝卜肉质根Pb胁迫的蛋白组学分析 | 第69-87页 |
| 1 材料与方法 | 第70-72页 |
| ·植物材料与胁迫处理 | 第70页 |
| ·蛋白质提取 | 第70页 |
| ·iTRAQ定量分析 | 第70-71页 |
| ·数据处理 | 第71-72页 |
| 2 结果与分析 | 第72-84页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫下蛋白质的鉴定与定量 | 第72-74页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫下差异蛋白的功能分类 | 第74-75页 |
| ·在不同Pb浓度下共同差异表达蛋白的聚类和功能富集分析 | 第75-83页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫蛋白组和转录组的关联分析 | 第83-84页 |
| 3 讨论 | 第84-87页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫下细胞结构相关差异蛋白鉴定 | 第84-85页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫下碳水化合物和能量代谢相关差异蛋白鉴定 | 第85-86页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫下抗氧化防御相关差异蛋白鉴定 | 第86页 |
| ·萝卜肉质根中Pb胁迫下蛋白组和转录组的关联分析 | 第86-87页 |
| 第六章 利用GC-MS技术进行萝卜肉质根Pb胁迫的代谢组学分析 | 第87-99页 |
| 1 材料与方法 | 第88-89页 |
| ·植物材料与胁迫处理 | 第88页 |
| ·样本制备 | 第88页 |
| ·GC/MS分析 | 第88-89页 |
| ·数据处理 | 第89页 |
| 2 结果与分析 | 第89-96页 |
| ·GC-MS鉴定结果 | 第89-90页 |
| ·GC-MS数据的多元变量分析 | 第90-91页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫响应的差异代谢物鉴定 | 第91-92页 |
| ·萝卜肉质根Pb胁迫响应的代谢组和转录组关联分析 | 第92-96页 |
| 3 讨论 | 第96-99页 |
| ·萝卜Pb胁迫响应下的动态代谢物变化 | 第97页 |
| ·萝卜Pb胁迫下的基因-代谢物网络分析 | 第97-99页 |
| 全文结论 | 第99-101页 |
| 本文创新之处 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-115页 |
| 附录 | 第115-141页 |
| 致谢 | 第141-143页 |
| 博士在读期间发表学术论文 | 第143-144页 |
