| 缩略词 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 前言 | 第9-15页 |
| 第一部分 吉林省水痘-带状疱疹病毒基因型鉴定 | 第15-29页 |
| 材料与方法 | 第15-23页 |
| 1 材料 | 第15-18页 |
| ·样本本来源 | 第15-17页 |
| ·主要试剂与仪器 | 第17-18页 |
| 2 引物 | 第18-20页 |
| 3 方法 | 第20-23页 |
| ·VZV核酸的提取 | 第20页 |
| ·PCR产物切胶回收纯化 | 第20-21页 |
| ·VZV阳性样本鉴定 | 第21页 |
| ·VZV基因分型的方法 | 第21页 |
| ·PCR-RFLP鉴别VZV野毒株/疫苗株 | 第21-22页 |
| ·序列测定 | 第22-23页 |
| ·序列整理和分子生物学信息分析 | 第23页 |
| 结果 | 第23-27页 |
| 1. 序列测定结果 | 第23页 |
| 2. VZV基因分型结果 | 第23-24页 |
| 3. ORF38(PstI)的PCR-RFLP结果 | 第24-25页 |
| 4. ORF54(BglI)的PCR-RFLP结果 | 第25页 |
| 5. ORF62(SmaI)的PCR-RFLP结果 | 第25-26页 |
| 6. 核苷酸序列系统进化树分析 | 第26-27页 |
| 讨论 | 第27-28页 |
| 结论 | 第28-29页 |
| 第二部分 疫苗株全基因组测定分析 | 第29-62页 |
| 材料与方法 | 第29-37页 |
| 1 材料 | 第29-33页 |
| ·样本本来源 | 第29-31页 |
| ·主要试剂与仪器 | 第31-33页 |
| 2 引物 | 第33-34页 |
| 3 方法 | 第34-37页 |
| ·核酸的提取 | 第34-35页 |
| ·PCR产物切胶回收纯化 | 第35页 |
| ·目的片段的扩增 | 第35-36页 |
| ·PCR产物的检测和鉴定 | 第36-37页 |
| ·序列整理和分子生物学信息分析 | 第37页 |
| 结果 | 第37-58页 |
| 1. 序列测定结果 | 第37页 |
| 2. VZV-BK全基因组序列信息 | 第37-41页 |
| 3. Oka-BK与其它VZV全基因序列的比较 | 第41-57页 |
| ·Oka-BK与Dumas的比较 | 第41-53页 |
| ·Oka-BK与Oka-P/Oka-V/Oka-V_(GSK)/Oka-V_(Merck)的比较 | 第53-56页 |
| ·Oka-BK与其它VZV的反式激活因子、糖蛋白氨基酸的比较 | 第56-57页 |
| 4. Oka-BK与其它VZV种系发育分析 | 第57-58页 |
| ·Oka-BK与其它VZV核苷酸亲缘关系树分析 | 第57-58页 |
| ·Oka-BK与其它VZV核苷酸遗传距离分析 | 第58页 |
| 讨论 | 第58-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-67页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
