| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 英文缩略表 | 第11-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-19页 |
| ·猪伪狂犬病的发生、发展历史 | 第13-14页 |
| ·猪伪狂犬病病毒的生物学特征 | 第14-17页 |
| ·猪伪狂犬病病毒的分子生物学特性 | 第14-15页 |
| ·猪伪狂犬病病毒的培养特性 | 第15-16页 |
| ·猪伪狂犬病病毒的感染特性 | 第16页 |
| ·猪伪狂犬病病毒的临床症状和病理变化 | 第16-17页 |
| ·猪伪狂犬病病毒的血清和基因分型 | 第17页 |
| ·诊断和疫苗研究 | 第17-18页 |
| ·研究目的及意义 | 第18-19页 |
| 第二章 PRV HeN1株全基因组测序和注释及其插入缺失特征的验证 | 第19-28页 |
| ·材料和方法 | 第19-22页 |
| ·病毒和细胞 | 第19页 |
| ·菌株、试剂与载体 | 第19页 |
| ·主要设备仪器 | 第19-20页 |
| ·病毒基因组DNA的提取及纯化 | 第20页 |
| ·引物设计 | 第20-21页 |
| ·病毒基因组分段PCR扩增 | 第21页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第21-22页 |
| ·PCR产物的回收、克隆和测序 | 第22页 |
| ·测序结果拼接和基因组注释 | 第22页 |
| ·在中国其他毒株上验证He N1特异插入缺失区域 | 第22页 |
| ·结果 | 第22-26页 |
| ·病毒基因组DNA琼脂糖凝胶电泳 | 第22-23页 |
| ·基因组序列分段PCR扩增结果 | 第23-25页 |
| ·PRV HeN1全基因组序列的获得 | 第25页 |
| ·PRV HeN1基因注释 | 第25页 |
| ·在中国其他毒株上验证He N1特异插入缺失区域 | 第25-26页 |
| ·讨论 | 第26-28页 |
| 第三章 以HeN1为代表的中国PRV毒株与国外毒株的比较基因组分析 | 第28-42页 |
| ·材料和方法 | 第28-30页 |
| ·毒株序列 | 第28页 |
| ·中国毒株与国外毒株全基因组水平差异比较 | 第28页 |
| ·HeN1株和欧美毒株的蛋白编码序列比较分析 | 第28-29页 |
| ·HeN1与Kaplan、Becker、Bartha、JS、TJ和BJ/YT差异氨基酸的比较分析 | 第29页 |
| ·中国毒株与国外参考毒株之间微卫星序列（SSR）的比较分析 | 第29页 |
| ·PRV和HSV-1 编码蛋白的变异性比较 | 第29页 |
| ·限制性片段长度多态性分析（RFLP） | 第29-30页 |
| ·PRV遗传进化分析 | 第30页 |
| ·PRV Bartha和HeN1株间的交叉中和实验 | 第30页 |
| ·结果 | 第30-39页 |
| ·中国毒株与国外毒株全基因组水平差异比较 | 第30-32页 |
| ·国内外PRV毒株相应的各蛋白编码序列间有显著的氨基酸变异 | 第32-34页 |
| ·SSR在中国毒株与国外参考毒株之间的比较分析 | 第34-35页 |
| ·PRV和HSV-1 所编码的蛋白在毒株间的变异性比较 | 第35页 |
| ·PRV的基因分型 | 第35-38页 |
| ·伪狂犬病病毒的进化速率 | 第38页 |
| ·Bartha和HeN1免疫猪产生的抗血清对这两株病毒的交叉保护力研究 | 第38-39页 |
| ·讨论 | 第39-42页 |
| 第四章 猪伪狂犬病病毒HeN1株感染和毒力相关基因的变异特征分析 | 第42-52页 |
| ·材料和方法 | 第42页 |
| ·序列信息 | 第42页 |
| ·PRV感染和毒力相关基因的比对分析 | 第42页 |
| ·PRV序列的进化树分析 | 第42页 |
| ·结果 | 第42-50页 |
| ·HeN1与国内外参考株的各相关基因核苷酸同源性比较 | 第42-43页 |
| ·PRV感染和毒力相关蛋白的变异特征 | 第43-44页 |
| ·PRV各基因进化树分析 | 第44-50页 |
| ·讨论 | 第50-52页 |
| 第五章 全文结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 附录 | 第59-101页 |
| 附录表S1分段扩增HeN1全基因组的引物 | 第59-64页 |
| 附录表S2 HeN1株与国内外毒株Kaplan、Bartha、Becker、BJ/YT、TJ和JS蛋白编码差异比较表 | 第64-77页 |
| 附录表S3国外毒株Kaplan、Bartha和Becker与HeN1相比各蛋白变异氨基酸数量表 | 第77-79页 |
| 附录表S4 PRV和HSV-1 基于贝叶斯算法估算得到替换率和各自毒株间最近分化时间 | 第79-81页 |
| 附录图S1所有PRV毒株基于66个基因构建的的进化树 | 第81-101页 |
| 致谢 | 第101-102页 |
| 作者简历 | 第102页 |
