| 中文摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第13-33页 |
| ·哺乳动物肌纤维类型对骨骼肌的影响 | 第13-15页 |
| ·肌纤维的类型 | 第13页 |
| ·肌纤维类型与肌肉产量的关系 | 第13-14页 |
| ·肌纤维类型与肌肉品质的关系 | 第14-15页 |
| ·骨骼肌的形成及分化机制 | 第15-20页 |
| ·骨骼肌的组成 | 第15页 |
| ·骨骼肌的形成和分化机制 | 第15-16页 |
| ·骨骼肌形成过程中的关键基因及蛋白调控因子 | 第16-20页 |
| ·小尾寒羊和杜泊羊的品种特征及生长性能比较 | 第20-21页 |
| ·品种特征比较 | 第20页 |
| ·生长性能比较 | 第20-21页 |
| ·绵羊 mRNA 转录组研究进展 | 第21-29页 |
| ·转录组及其复杂性 | 第21页 |
| ·转录组分析技术 | 第21-27页 |
| ·绵羊 mRNA 转录组分析 | 第27-29页 |
| ·肌球蛋白轻链基因家族研究进展 | 第29-31页 |
| ·MYL1 基因 | 第29-30页 |
| ·MYL2 基因 | 第30-31页 |
| ·MYL3 基因 | 第31页 |
| ·MYL4 基因 | 第31页 |
| ·本试验的目的和意义 | 第31-33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-54页 |
| ·试验材料 | 第33-34页 |
| ·试验动物及样品采集 | 第33页 |
| ·试验仪器与设备 | 第33页 |
| ·试验试剂 | 第33-34页 |
| ·试验方法 | 第34-46页 |
| ·RNA 的提取与检测 | 第34-35页 |
| ·臂二头肌转录组文库的构建及高通量测序 | 第35页 |
| ·高通量测序数据的 qRT-PCR 验证 | 第35-37页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因 cDNA 序列的克隆与测序 | 第37-45页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因的表达差异分析 | 第45-46页 |
| ·数据分析 | 第46-54页 |
| ·高通量测序数据的生物信息学分析 | 第46-50页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因的 cDNA 序列分析 | 第50-51页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因编码蛋白的序列分析 | 第51-53页 |
| ·qRT-PCR 结果分析 | 第53-54页 |
| 3 结果与分析 | 第54-83页 |
| ·臂二头肌总 RNA 和 cDNA 文库的质量 | 第54-55页 |
| ·臂二头肌总 RNA 的质量 | 第54页 |
| ·cDNA 测序文库的质量 | 第54-55页 |
| ·高通量测序数据的生物信息学分析结果 | 第55-65页 |
| ·测序序列在参考基因上的随机性分布 | 第55-56页 |
| ·测序序列与参考基因组和参考基因的比对统计 | 第56-57页 |
| ·两个文库间基因表达的统计 | 第57页 |
| ·基因结构的优化结果 | 第57-58页 |
| ·两个文库间差异表达基因的注释结果 | 第58-62页 |
| ·两个文库间发现的新转录本的特征 | 第62页 |
| ·两个文库中可变剪接的类型与特征 | 第62-63页 |
| ·两个文库中 cSNPs 的类型与分布 | 第63-65页 |
| ·转录组中 SSRs 的类型与分布 | 第65页 |
| ·测序数据的可靠性验证结果 | 第65页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因 cDNA 序列的克隆及测序结果 | 第65-69页 |
| ·保守区的克隆及测序结果 | 第65-66页 |
| ·3′端的克隆与测序结果 | 第66页 |
| ·5′端的克隆及测序结果 | 第66-67页 |
| ·拼接序列及全长验证结果 | 第67-69页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因 cDNA 序列的分析结果 | 第69-73页 |
| ·cDNA 序列的基本特征 | 第69-72页 |
| ·5 ′侧翼调控区的序列特征 | 第72-73页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因编码蛋白的分析结果 | 第73-80页 |
| ·蛋白质的基本性质 | 第73页 |
| ·氨基酸序列的变异 | 第73-74页 |
| ·蛋白质的理化性质 | 第74-76页 |
| ·蛋白质的二级结构 | 第76-78页 |
| ·蛋白质的三级结构 | 第78-79页 |
| ·蛋白质的序列相似性及遗传变异 | 第79-80页 |
| ·不同组织和品种间 MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因的差异表达 | 第80-83页 |
| 4 讨论 | 第83-90页 |
| ·高通量测序数据的覆盖度对生物信息学分析有影响 | 第83页 |
| ·差异表达基因的深度分析有助于挖掘骨骼肌生长和发育的相关基因 | 第83-84页 |
| ·两文库间 cSNPs 与可变剪接分析有助于了解基因的表达和调控 | 第84-85页 |
| ·qRT-PCR 法证明高通量测序数据是可靠的 | 第85页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因 cDNA 序列中的特征 | 第85-86页 |
| ·MYL1、MYL2、MYL3 和 MYL4 基因编码蛋白结构与功能的关系 | 第86-89页 |
| ·MYL1 和 MYL4 基因与骨骼肌的生长和发育相关 | 第89-90页 |
| 5 结论 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-107页 |
| 附录 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第109页 |
