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水稻同核异质系的基因组与转录组研究

论文创新点第1-9页
摘要第9-11页
Abstract第11-13页
名词注释第13-14页
第一章 前言第14-40页
   ·水稻雄性不育第14-22页
     ·细胞质雄性不育分类第15-16页
     ·水稻细胞质雄性不育基因研究进展第16-18页
     ·水稻细胞质雄性不育及育性恢复的分子机理第18-20页
     ·雄性不育/育性恢复(CMS/Rf)系统与PPR蛋白第20-21页
     ·同核异质雄性不育系的研究第21-22页
   ·种内杂交的表观遗传学变化第22-25页
     ·DNA甲基化研究方法第23-24页
     ·DNA甲基化在杂交过程中的变化第24-25页
     ·DNA甲基化与杂种优势第25页
   ·高等植物线粒体的RNA编辑第25-30页
     ·RNA编辑的概述及共功能第26页
     ·RNA编辑发生的分子机理第26-28页
     ·RNA编辑与PPR蛋白第28-29页
     ·线粒体RNA编辑与细胞质雄性不育第29-30页
   ·植物雄性不育的基因表达研究第30-34页
     ·高等植物转录组研究方法第30-31页
     ·植物雄性不育的转录组研究第31-33页
     ·线粒体对核基因的反馈调节第33-34页
   ·植物microRNA研究第34-38页
     ·MicroRNA在植物中的进化保守性第35-36页
     ·MicroRNA与植物雄配子的发育第36-37页
     ·MicroRNA与植物雄性不育第37-38页
   ·本研究的目的和意义第38-40页
第二章 水稻同核异质系基因组差异与DNA甲基化研究第40-58页
   ·实验材料第40-42页
     ·水稻同核异质不育系的构建第40-41页
     ·实验材料的选用第41-42页
   ·实验方法第42-51页
     ·水稻同核异质系的细胞学观察第42-43页
     ·水稻同核异质系的分子鉴定第43-49页
     ·构建水稻同核异质系过程中的甲基化分析第49-51页
   ·结果与分析第51-56页
     ·水稻同核异质系的细胞学观察第51-53页
     ·水稻同核异质系的分子鉴定第53-54页
     ·水稻同核异质系构建过程中的甲基化差异第54-56页
   ·讨论第56-58页
     ·水稻同核异质系在单核小孢子时期发生败育第56-57页
     ·水稻同核异质系的基因组和DNA甲基化的变化第57-58页
第三章 水稻同核异质系的线粒体RNA编辑研究第58-76页
   ·实验材料第58-59页
   ·实验方法第59-63页
     ·基因组DNA和总RNA的提取第59-60页
     ·DNase Ⅰ去除RNA中的残余基因组DNA第60-61页
     ·cDNA第一链的合成第61页
     ·PCR扩增及克隆测序第61-63页
   ·结果与分析第63-71页
     ·反转录RNA的纯度分析第63-64页
     ·水稻同核异质不育系cox2的RNA编辑第64-65页
     ·水稻同核异质不育系atp6的RNA编辑第65-67页
     ·水稻同核异质不育系atp9的RNA编辑第67-69页
     ·水稻同核异质不育系之间RNA编辑的比较第69-71页
   ·讨论第71-76页
     ·水稻线粒体中新的编辑位点第71-72页
     ·水稻CMS不育系中细胞质对RNA编辑的影响第72-73页
     ·核质相互作用对水稻RNA编辑的影响第73-74页
     ·RNA编辑与紫稻型CMS的关系第74-76页
第四章 水稻同核异质系的基因表达差异分析第76-92页
   ·实验材料第76页
   ·实验方法第76-80页
     ·RNA的提取第76-77页
     ·样品的生物素标记第77页
     ·芯片杂交第77页
     ·芯片扫描与图像采集及数据分析第77-78页
     ·基因芯片结果的生物信息学分析第78页
     ·差异表达基因的定量PCR验证第78-80页
   ·结果与分析第80-89页
     ·同核异质不育系与保持系间的基因表达差异第80-81页
     ·同核异质不育系与保持系间差异表达显著的基因第81-83页
     ·不同的不育系与可育系间基因的差异表达第83-89页
   ·讨论第89-92页
     ·花粉发育相关基因的差异表达第89-90页
     ·线粒体功能异常与反馈调控第90-91页
     ·同核异质不育系之间差异表达基因的特异性第91-92页
第五章 水稻同核异质系幼穗的miroRNA差异表达分析第92-110页
   ·实验材料第92页
   ·实验方法第92-97页
     ·两种植物的miRNA发掘及实验验证第93-95页
     ·同核异质水稻幼穗的miRNA表达分析第95-97页
   ·结果与分析第97-107页
     ·两种植物miRNA的发掘与保守性分析第97-103页
     ·同核异质水稻幼穗miRNA差异表达分析第103-107页
   ·讨论第107-110页
     ·植物miRNA的保守性及其功能的相似性第107-108页
     ·MiRNA在同核异质水稻幼穗中的调控作用第108-110页
第六章 总讨论第110-112页
参考文献第112-128页
在读期间发表或待发表论文第128-129页
致谢第129页

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