| 中国农业科学院博士学位论文评阅人、答辩委员会签名表 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-15页 |
| 英文缩略表 | 第15-16页 |
| 第一章 引言 | 第16-29页 |
| ·植物叶片衰老机制研究进展 | 第16-26页 |
| ·叶片衰老的概述 | 第16-17页 |
| ·叶片衰老过程中的程序性细胞死亡 | 第17-19页 |
| ·叶片衰老过程叶片衰老相关基因的类型 | 第19-20页 |
| ·叶片衰老过程中影响叶片衰老的因素 | 第20-24页 |
| ·植物叶片衰老的分子机制 | 第24-26页 |
| ·植物叶片衰老的研究方法 | 第26-27页 |
| ·棉花叶片衰老过程研究现状 | 第27-28页 |
| ·研究目的与意义 | 第28-29页 |
| 第二章 叶片 CDNA 文库构建和 EST 测序分析 | 第29-55页 |
| ·实验材料 | 第29-30页 |
| ·植株材料 | 第29-30页 |
| ·实验设计 | 第30页 |
| ·实验方法 | 第30-38页 |
| ·Total RNA 的提取 | 第30-31页 |
| ·mRNA 的分离纯化 | 第31页 |
| ·全长 cDNA 文库的构建 | 第31-36页 |
| ·全长 cDNA 文库的质量鉴定 | 第36-37页 |
| ·均一化 cDNA 文库的构建 | 第37页 |
| ·均一化 cDNA 文库 EST 大规模测序 | 第37页 |
| ·序列的前期处理和组装 | 第37-38页 |
| ·新 EST 的确定 | 第38页 |
| ·序列功能注释和功能分类 | 第38页 |
| ·结果与分析 | 第38-53页 |
| ·叶片总 RNA 的提取 | 第38-39页 |
| ·mRNA 的分离纯化 | 第39-40页 |
| ·全长 cDNA 初级文库的构建以及文库质量鉴定 | 第40-42页 |
| ·全长 cDNA 文库的均一化以及文库质量鉴定 | 第42-44页 |
| ·EST 测序及拼接 | 第44页 |
| ·EST 序列的特征分析 | 第44-46页 |
| ·新 EST 序列的分析 | 第46页 |
| ·序列功能注释和功能分类 | 第46-53页 |
| ·讨论 | 第53-55页 |
| 第三章 陆地棉叶片衰老表达谱的构建和分析 | 第55-73页 |
| ·实验材料 | 第55-56页 |
| ·植株材料 | 第55页 |
| ·实验设计 | 第55-56页 |
| ·实验方法 | 第56-61页 |
| ·生化指标测定 | 第56页 |
| ·棉花叶片总 RNA 的提取 | 第56-57页 |
| ·转录组测序的方法 | 第57页 |
| ·转录组测序的生物信息学分析 | 第57-58页 |
| ·数字表达谱测序的方法 | 第58-60页 |
| ·数字表达谱测序数据分析 | 第60页 |
| ·表达谱数据准确性的验证 | 第60-61页 |
| ·结果与分析 | 第61-72页 |
| ·生化指标的测定及分析时期的选择 | 第61页 |
| ·RNA 的提取及质量检测 | 第61-62页 |
| ·转录组测序数据分析 | 第62-68页 |
| ·数字表达谱测序数据分析 | 第68-69页 |
| ·数字表达谱数据准确性的验证 | 第69-72页 |
| ·讨论 | 第72-73页 |
| 第四章 陆地棉叶片衰老相关基因的分析和功能验证 | 第73-102页 |
| ·实验材料 | 第73-74页 |
| ·植株材料 | 第73页 |
| ·实验设计 | 第73-74页 |
| ·实验方法 | 第74-78页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第74页 |
| ·基因表达模式聚类分析 | 第74页 |
| ·差异表达基因的 GO 和 pathway 显著富集分析 | 第74页 |
| ·陆地棉衰老相关基因与其他物种 SAGs 比较分析 | 第74-75页 |
| ·转录因子和激素 pathway 相关基因的鉴定 | 第75页 |
| ·生化指标测定 | 第75页 |
| ·棉花叶片总 RNA 的提取及反转录 | 第75-76页 |
| ·陆地棉叶片黄化特异基因 YLS 的克隆与分析 | 第76-78页 |
| ·实验结果 | 第78-98页 |
| ·差异表达基因的筛选及表达模式聚类 | 第78-79页 |
| ·差异表达基因的 GO 显著性富集分析 | 第79页 |
| ·差异表达基因的 KEGG 显著性富集分析 | 第79-81页 |
| ·陆地棉与其它植物叶片衰老相关基因的比较分析 | 第81-82页 |
| ·陆地棉叶片衰老相关基因中转录因子的分析 | 第82页 |
| ·差异表达基因中参与激素 pathway 相关基因的分析 | 第82-91页 |
| ·陆地棉叶片衰老相关基因表达模式验证 | 第91-95页 |
| ·陆地棉 GhYLS5/8/9 基因的获得 | 第95-96页 |
| ·GhYLS5/8/9 序列和表达模式分析 | 第96-98页 |
| ·讨论 | 第98-102页 |
| ·差异表达基因中上调和下调基因的界定和分析 | 第98页 |
| ·转录因子参与陆地棉叶片衰老的调控作用 | 第98-99页 |
| ·激素参与陆地棉叶片衰老的调控作用 | 第99-100页 |
| ·陆地棉叶片衰老相关基因的表达模式分析 | 第100-102页 |
| 第五章 全文结论 | 第102-104页 |
| ·全文结论 | 第102-103页 |
| ·研究展望 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 作者简历 | 第116页 |
