| 摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-59页 |
| ·植物复杂性状的分子标记与选择 | 第15-19页 |
| ·从表型到基因型 | 第15-16页 |
| ·QTL的应用价值 | 第16-18页 |
| ·利用多个QTL改良复杂性状 | 第18页 |
| ·F_2群体富集与分子标记辅助轮回选择(MARS) | 第18-19页 |
| ·QTL聚合育种与育种值估计的区别 | 第19页 |
| ·玉米IBM(intermated B73 x Mo17)群体研究进展 | 第19-29页 |
| ·玉米IBM群体的构建 | 第19-20页 |
| ·互交在群体参数中的影响 | 第20-23页 |
| ·玉米IBM重组自交系群体 | 第23-26页 |
| ·玉米IBM近等基因系群体 | 第26-27页 |
| ·玉米IBM单倍体群体 | 第27-28页 |
| ·玉米IBM综合整合图谱 | 第28-29页 |
| ·植物基因组学研究进展 | 第29-36页 |
| ·基因组组装(de novo)研究进展 | 第29-33页 |
| ·全基因组重测序研究进展 | 第33-34页 |
| ·Bin map遗传图谱构建研究进展 | 第34-36页 |
| ·玉米果穗的发育 | 第36-48页 |
| ·玉米成熟花序的特征 | 第36-38页 |
| ·发育中的玉米花序特点及影响花序发育的主要基因 | 第38-44页 |
| ·玉米果穗发展新能源 | 第44-45页 |
| ·穗轴形成的遗传学基础 | 第45-47页 |
| ·结论和展望 | 第47-48页 |
| ·调控植物果穗发育的miRNAs的研究进展 | 第48-56页 |
| ·植物发育中的miRNAs | 第48-50页 |
| ·miR156和miR172在拟南芥花发育中的调控作用 | 第50-52页 |
| ·miR172调控玉米花序发育 | 第52-53页 |
| ·miRNA的研究策略 | 第53-56页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第56-58页 |
| ·技术路线 | 第58-59页 |
| 第二章 玉米IBM Syn10单倍体群体全基因组遗传标记开发和基因型分型 | 第59-109页 |
| ·前言 | 第59-61页 |
| ·材料与方法 | 第61-68页 |
| ·试验材料和DNA提取 | 第61页 |
| ·测序和比对 | 第61页 |
| ·SNP检测和Mo17注释 | 第61-62页 |
| ·短片段插入和缺失(Indel)检测 | 第62页 |
| ·IBM Syn10群体基因分型和Bin map的构建 | 第62-63页 |
| ·遗传图谱的偏分离和调节 | 第63页 |
| ·QTL作图及分析 | 第63页 |
| ·QTL区间的对比 | 第63-64页 |
| ·整合图谱构建 | 第64页 |
| ·高质量亲本SNP验证 | 第64-68页 |
| ·结果与分析 | 第68-85页 |
| ·Mo17重测序及亲本间基因组变异比较 | 第68-71页 |
| ·玉米IBM Syn10群体基因型检测及bin map图谱构建 | 第71-74页 |
| ·偏分离与图谱扩张 | 第74-75页 |
| ·Syn10群体遗传图谱 | 第75-77页 |
| ·标记密度 | 第77-78页 |
| ·全基因玉米株高、开花期QTL检测 | 第78-85页 |
| ·高质量SNP标记集与整合图谱构建 | 第85页 |
| ·讨论 | 第85-109页 |
| ·图谱扩张和无意识的选择 | 第85-89页 |
| ·Syn10群体的优越性 | 第89-91页 |
| ·Syn10群体QTL精细定位的准确性和候选基因的发现 | 第91-107页 |
| ·高质量SNPs在芯片开发和全基因组选择育种中的应用 | 第107-109页 |
| 第三章 不同氮素处理条件下玉米穗轴相关性状的QTL定位 | 第109-131页 |
| ·前言 | 第109页 |
| ·材料与方法 | 第109-112页 |
| ·试验材料和田间处理 | 第109-110页 |
| ·图像分析 | 第110页 |
| ·统计分析 | 第110-111页 |
| ·QTL分析 | 第111-112页 |
| ·结果与分析 | 第112-126页 |
| ·不同环境和处理结果条件下方差分析 | 第112-117页 |
| ·QTL分析 | 第117-126页 |
| ·讨论 | 第126-131页 |
| ·不同氮素水平处理的差异 | 第126-128页 |
| ·穗轴相关性状的图像数据采集 | 第128页 |
| ·QTL检测分析 | 第128-129页 |
| ·Syn4和Syn10群体间QTL的一致性及候选基因 | 第129-130页 |
| ·利用IBMSyn10群体进行精细定位 | 第130-131页 |
| 第四章 高通量测序鉴定玉米果穗microRNAs及其靶基因 | 第131-164页 |
| ·前言 | 第131-132页 |
| ·材料与方法 | 第132-140页 |
| ·供试材料 | 第132-133页 |
| ·玉米雌穗发育期miRNA的鉴定 | 第133-134页 |
| ·玉米雌穗不同发育阶段差异miRNA的鉴定 | 第134-137页 |
| ·miRNA靶基因的鉴定 | 第137-140页 |
| ·结果与分析 | 第140-160页 |
| ·玉米果穗miRNA的鉴定 | 第140-148页 |
| ·玉米果穗不同发育时期miRNA的表达模式 | 第148-151页 |
| ·降解组分析鉴定miRNA的靶基因 | 第151-160页 |
| ·讨论 | 第160-164页 |
| ·真实miRNA预测的评估 | 第160-162页 |
| ·已知miRNA的靶基因 | 第162页 |
| ·特异miRNA的靶基因 | 第162-164页 |
| 全文结论 | 第164-166页 |
| 参考文献 | 第166-191页 |
| 附录 | 第191-197页 |
| 致谢 | 第197-199页 |
| 攻读博士学位期间投稿的学术论文 | 第199-200页 |
