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芸薹属查尔酮异构酶基因家族的克隆与功能鉴定

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-15页
第一章 文献综述第15-19页
   ·类黄酮物质特点及其在植物中的生理生化功能第15页
   ·类黄酮物质生物合成途径第15-17页
     ·类黄酮生物合成途径的分子生物学研究进展第15-17页
   ·TRANSPARENT TESTA5(TT5)基因特征及相关研究进展第17-18页
   ·芸薹科植物的比较基因组学研究第18-19页
第二章 引言第19-21页
第三章 材料与方法第21-43页
   ·菌株、载体和植物材料第21页
     ·植物材料第21页
     ·菌株和载体第21页
   ·主要仪器和设备第21-22页
     ·基本仪器设备第21页
     ·PCR扩增及产物检测仪器第21页
     ·细菌培养及亚克隆用仪器设备第21-22页
     ·Southern杂交仪器第22页
   ·试剂和试剂盒第22-23页
     ·主要分子生物学试剂第22页
     ·配制试剂第22-23页
     ·购买的试剂盒第23页
   ·植物材料的种植及取样第23-25页
     ·DNA材料第23-24页
     ·RNA材料第24页
     ·芸薹族材料基因组总DNA的粗提和纯化第24-25页
   ·芸薹属材料总RNA的提取第25页
     ·总RNA的提取第25页
     ·去除总RNA中DNA第25页
   ·CHI基因家族的RACE第25-28页
     ·RACE末端扩增引物设计第25-26页
     ·合成总cDNA的第一链第26页
     ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝CHI基因家族cDNA 5’末端的第一次扩增第26-27页
     ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝CHI基因家族cDNA 5’末端的第二次扩增第27页
     ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝CHI基因家族cDNA的3’末端一扩扩增第27页
     ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝CHI基因家族cDNA的3’末端第二次扩增第27-28页
   ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝CHI基因家族gDNA扩增第28-29页
   ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝CHI基因家族全长cDNA的扩增第29页
   ·胶回收、亚克隆、质粒抽提、测序和引物合成第29-31页
     ·琼脂糖凝胶电泳第29页
     ·目的片段胶回收第29-30页
     ·大肠杆菌DH5α和JM109感受态的制备第30页
     ·胶回收片段与丁载体连接第30页
     ·质粒DNA转化大肠杆菌第30-31页
     ·重组转化子的蓝白斑筛选及菌液PCR鉴定第31页
     ·转化重组子的质粒抽提第31页
     ·测序及引物合成第31页
   ·甘蓝CHI基因家族的Southern杂交分析第31-34页
     ·探针制备第31-32页
     ·基因组总DNA的限制性酶切消化第32页
     ·Southern杂交凝胶电泳第32-33页
     ·Southern杂交凝胶转膜及固定第33页
     ·探针与尼龙膜的Southern杂交和检测第33-34页
     ·剥离探针第34页
   ·核酸和蛋白序列的结构和功能的生物信息学分析第34页
     ·BnCHI、BrCHI和l BoCHI蛋白的系统发育分析第34页
   ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝CHI基因家族的RT-PCR分析第34-37页
     ·RNA的反转录第34-35页
     ·内标检测与cDNA浓度调节第35页
     ·甘蓝型油菜、白菜和甘蓝CHI基因半定量RT-PCR的引物和检测温度第35-36页
     ·不同组织器官中CHI基因家族各成员表达模式的半定量RT-PCR检测第36-37页
     ·CHI基因家族在黄、黑籽系间的表达差异性检测第37页
   ·芸薹属CHI基因家族RNAi载体的构建第37-39页
     ·RNAi载体构建所用引物第37-38页
     ·芸薹属CHI基因家族RNAi片段的克隆第38页
     ·载体骨架的制备和反义片段的插入第38页
     ·中间载体的酶切和正义片段的插入第38页
     ·RNAi载体转化根癌农杆菌第38-39页
   ·芸薹属CHI基因家族正义植物表达载体的构建第39页
     ·芸薹属CHI基因家族正义片段和植物表达载体骨架的制备第39页
     ·正义植物表达载体的构建与鉴定第39页
   ·甘蓝型油菜CHI基因家族RNAi载体的遗传转化第39-41页
     ·发无菌苗第39页
     ·预培养第39-40页
     ·侵染与共培养第40页
     ·杀农杆菌(洗外植体)与诱导抗性愈伤第40页
     ·分化培养第40-41页
     ·分化茎第41页
     ·长茎第41页
     ·生根第41页
     ·驯化及移栽第41页
   ·再生植株的分子检测和性状初步鉴定第41-43页
     ·Basta复检第41-42页
     ·PCR检测第42页
     ·性状调查第42-43页
第四章 结果与分析第43-89页
   ·各器官组织总RNA的提取和总cDNA的获得第43页
     ·白菜、甘蓝、甘蓝型油菜各器官组织RNA的提取第43页
     ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝生殖器官RACE总cDNA的获得第43页
   ·甘蓝型油菜、白菜、甘监基因组总DNA的提取第43-44页
   ·BrTT5、BoCHI、BnTT5基因家族gDNA的克隆第44-45页
   ·白菜、甘监、甘蓝型油菜CHI基因家族全长cDNA的克隆第45-47页
   ·BrTT5、BoTT5、BnCHI基因家族核酸水平的分析第47-61页
     ·BrTT5、BoTT5、BnCHI基因家族的基因结构和核酸特征第47-55页
     ·BrCHI、BoCHI、BnCHI基因家族核苷酸水平同源性和进化关系第55-61页
   ·芸薹属CHI基因家族编码蛋白的分析第61-75页
     ·BrCHI、BoCHI、BnCHI家族蛋白的基本参数第61-62页
     ·BrCHI、BoCHI、BnCHl家族蛋白的同源性第62-65页
     ·BrCHI、BoCHI、BnCHI家族蛋白的保守区域和活性中心预测第65页
     ·BrCHI、BoCHI、BnCHI家族蛋白的翻译后修饰及拓扑学预测第65-68页
     ·BrCHI、BoCHI、BnCHI家族蛋白的二级结构预测第68-69页
     ·BrCHI、BoCHI、BnCHI家族蛋白的三级结构预测第69-72页
     ·BnCHI、BrCHI和BoCHI蛋白的进化关系分析第72-75页
   ·BoCHI基因家族可能的成员数第75-76页
   ·BrCHI、BoCHI、BnCHI基因家族的表达特征第76-78页
     ·BrCHI基因家族的表达特征第76-77页
     ·BoCHI基因家族的表达特征第77页
     ·BnCHI基因家族成员的表达特征第77-78页
   ·BrCHI、BoCHI、BnCHI基因家族在黑、黄籽间的表达差异性第78-81页
     ·BrCHI基因家族在黑、黄籽材料中的表达差异分析第78-79页
     ·BoCHS基因家族在黑、黄籽材料中的表达差异分析第79-80页
     ·BnCHS基因家族在黑、黄籽材料中的表达差异分析第80-81页
   ·芸薹属CHI基因家族RNAi载体的构建第81-83页
     ·芸薹属CHI基因家族RNAi片段的克隆第81页
     ·反义片段的插入——中间载体的构建第81-82页
     ·正义片段的插入——RNA干扰载体的获得第82页
     ·转化农杆菌及菌株的PCR检测第82-83页
   ·CHI家族正义植物表达载体的构建第83-84页
   ·转RNAi载体的再生植株的分子检测和性状调查第84-89页
     ·再生植株的草甘膦(Basta)抗性复检结果第84-85页
     ·再生植株的PCR检测第85页
     ·再生植株的性状调查第85-89页
第五章 讨论与结论第89-95页
   ·系统克隆了白菜、甘蓝、甘蓝型油菜CHI基因家族第89页
   ·芸薹属CHI基因家族编码蛋白的特征第89页
   ·从CHI位点分析甘蓝型油菜、白菜、甘蓝之间的亲缘关系第89-90页
   ·芸薹属CHI基因家族经历了“三倍化”并进一步加倍第90-91页
   ·芸薹属CHI基因家族器官特异性的保守和歧化第91页
   ·本研究检测的芸薹属黄籽材料中CHI表达正常第91-92页
   ·芸薹属CHI基因家族表现出了快速进化的特征第92-93页
   ·RNAi转基因表明芸薹属CHI同时影响种皮色素、种子大小、侧枝数等性状第93-95页
参考文献第95-97页
致谢第97-99页
发表论文及参加课题一览表第99页

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