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改进的“分子开关”技术在SNP位点CYP2C19*2和*3分型中的应用

中文摘要第1-6页
Abstract第6-11页
引言第11-14页
第一章 “分子开关”用于 CYP2C19*2 和*3 位点检测方法的建立第14-35页
 1 实验材料第14-18页
   ·标本来源第14-15页
   ·实验仪器与设备第15页
   ·常用材料与试剂第15-16页
   ·主要试剂盒第16页
   ·常用酶类第16页
   ·Marker第16-17页
   ·菌株第17页
   ·培养基第17页
   ·缓冲液和常用试剂的配制第17-18页
 2 实验方法第18-25页
   ·检测位点选择第18页
   ·PCR 引物设计与合成第18-21页
   ·血液 DNA 的提取第21页
   ·DNA 样品的定量与质量鉴定第21页
   ·样本 DNA 的扩增第21-22页
   ·PCR 产物的回收第22页
   ·样本测序第22-23页
   ·基于“分子开关”技术检测体系的建立和优化第23-24页
   ·基于“分子开关”的 PCR 技术特异性鉴定第24页
   ·基于“分子开关”的 PCR 技术对 104 例标本的 SNP 分型第24-25页
 3. 结果与分析第25-32页
   ·104 例样本测序结果第25页
   ·PCR 扩增体系中 DNA 模板用量的优化第25-26页
   ·PCR 扩增体系中退火温度的优化第26页
   ·Pfu 酶在扩增体系中的优化第26-27页
   ·检测引物 3′末端单/双硫代磷酸化修饰的差异比较第27-28页
   ·最佳反应体系的确立及 CYP2C19*2 和*3 三个基因型的检测第28-31页
   ·104 例样本 CYP2C19*2 和*3 位点的检测结果第31-32页
 4 讨论第32-35页
第二章 重组 Tth-SSB 蛋白在基于 PCR 的 SNP 分型反应中的应用第35-50页
 1 实验材料第35-38页
   ·标本来源第35页
   ·Tth-SSB 基因组第35-36页
   ·Tth-SSB 引物的设计与合成第36页
   ·CYP2C19*3(636G>A)位点的单硫代检测引物第36页
   ·实验仪器与设备第36-37页
   ·常用材料与试剂第37页
   ·缓冲液和常用试剂的配制第37-38页
 2 实验方法第38-40页
   ·Tth-SSB 基因克隆到 pMD19-T 载体上第38页
   ·Tth-SSB 基因克隆到 PET-28a 表达载体上第38页
   ·Tth-SSB 蛋白的诱导表达和纯化第38-39页
   ·SNP 分型反应中 Tth-SSB 蛋白最佳用量的确定第39页
   ·Tth-SSB 对 PCR 特异性的影响第39-40页
   ·其他添加剂在提高 SNP 分型特异性的探讨第40页
   ·添加 Tth-SSB 后对 104 份标本的基因分型第40页
 3 实验结果第40-47页
   ·T 克隆后双酶切的鉴定结果第40-41页
   ·PET-28a 表达载体克隆后双酶切的鉴定结果第41-42页
   ·10%聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定 Tth- SSB 结果第42-43页
   ·SNP 分型中添加 Tth-SSB 的最佳用量第43页
   ·Tth-SSB 对 SNP 分型特异性的影响第43-44页
   ·添加 Tth-SSB 在三种基因型分型中的验证效果第44-45页
   ·二碱基亚砜添加到扩增体系中的效果第45-46页
   ·甜菜碱添加到扩增体系中的效果第46-47页
   ·海藻糖添加到扩增体系中的效果第47页
   ·104 份标本在添加 Tth-SSB 扩增体系中的检测结果第47页
 4 讨论第47-50页
结论第50-51页
参考文献第51-55页
文献综述:SNP 分型技术的发展及应用第55-64页
 参考文献第61-64页
攻读学位期间发表的论文第64-65页
论文资助项目第65-66页
附录:文中所用缩略语一览表第66-68页
致谢第68-69页

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