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核心顺式元件HDZIP2ATATHB2依赖的海岛棉表皮原因子1(GbPDF1)在棉花纤维起始过程中起重要作用

目录第1-8页
缩略语表第8-9页
摘要第9-12页
Abstract第12-15页
第一章 棉花纤维细胞起始及伸长的研究进展第15-36页
   ·棉花纤维的物质组成与产量构成第15-16页
   ·有关棉花纤维原始细胞分化的几种假说第16-18页
   ·在棉花纤维发育过程中起重要作用基因的发掘与验证第18-27页
     ·纤维发育相关基因发掘与功能验证的一般思路第19-23页
       ·目的基因在棉花纤维中的特异表达与定位第20页
       ·利用不同基因型材料间性状差异与基因表达的关联分析筛选基因第20-21页
       ·棉花纤维的离体培养第21-22页
       ·通过目的基因的遗传转化来进行功能验证第22-23页
     ·已发掘或验证的部分纤维发育相关基因第23-27页
       ·蔗糖合酶基因(Sus)第23-24页
       ·细胞骨架(Cytoskeleton)相关基因第24-25页
       ·油菜素内酯合成与响应相关基因第25-26页
       ·一些转录因子第26-27页
   ·棉花纤维发育相关DNA/PROTEIN-PROTEIN间的相互作用第27-28页
   ·棉花纤维发育相关代谢路径第28-31页
     ·乙烯(Ethylene)与超长链饱和脂肪酸(VLCFAs)合成通路第28-29页
     ·果胶质(Pectin)合成途径第29页
     ·活性氧清除相关路径第29-30页
     ·碳源的合成、转运与分配第30-31页
   ·棉花纤维细胞伸长模式与机制第31页
   ·棉种驯化改变纤维发育过程中的基因调控网络及生物学进程第31-32页
   ·表皮原因子(PROTODERMALFACTOR,PDF)相关研究进展第32-35页
   ·本研究目的、意义及技术路线第35-36页
第二章 棉花中PDF1基因的克隆、结构及表达分析第36-51页
   ·实验材料与方法第36-40页
     ·实验用植物材料第36页
     ·实验方法第36-40页
       ·棉花基因组DNA的提取与Southern杂交第36页
       ·棉花各组织RNA的提取、荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)及Northern杂交第36-37页
       ·棉花中PDF1基因DNA全长序列的分离克隆第37-38页
       ·核苷酸与蛋白质的序列分析第38-39页
       ·利用Genome-Walking技术扩增棉花中PDF1基因的3’-UTR区第39页
       ·H_2O_2及DPI在纤维离体培养条件下对PDF1基因表达丰度的影响第39-40页
   ·结果与分析第40-51页
     ·二倍体野生棉花及四倍体栽培棉种中PDF1基因的拷贝数分析第40-41页
     ·海岛棉3-79及陆地棉TM-1中PDF1基因序列的获得与比较分析第41-44页
     ·海岛棉3-79及陆地棉TM-1中PDF1基因3’-UTR区序列的比较分析第44页
     ·不同棉种间PDF1的亲缘关系分析第44-45页
     ·不同物种间PDF1的亲缘关系分析第45-48页
     ·棉花中PDF1基因的表达特性分析第48-51页
第三章 棉花中PDF1基因的功能及作用机制初步分析第51-85页
   ·实验方法第51-65页
     ·CaMV35S:GbPDF1超量表达载体的构建第51-53页
     ·棉花PDF1基因干涉表达载体的构建第53页
     ·棉花下胚轴的转化与检测第53-55页
       ·棉花下胚轴的转化第53页
       ·转基因材料Southern杂交第53页
       ·棉花各组织RNA的抽提、荧光定量PCR和Northern杂交第53-54页
       ·野生型与转基因干涉植株胚珠蛋白水平上PDF1的表达分析第54-55页
     ·转基因与野生型棉花胚珠的扫描电镜比较分析第55-56页
     ·转基因植株及野生型对照胚珠H_2O_2含量的测定第56页
     ·以GbPDF1为诱饵通过酵母双杂交筛选互作蛋白第56-59页
       ·GbPDF1诱饵载体的构建第56页
       ·以GbPDF1为诱饵筛库第56-58页
       ·重新转化进一步确定GbPDF1的互作蛋白第58-59页
     ·双分子荧光互补实验进一步验证蛋白质互作的可靠性第59-60页
     ·CaMV35S:GbPDF1-G3GFP融合表达载体的构建第60页
     ·拟南芥的转化与检测第60-62页
       ·拟南芥的转化第61页
       ·拟南芥T1代阳性植株的筛选与鉴定第61-62页
     ·CaMV35S:GbPDF1-G3GFP载体瞬时转化烟草叶片第62-63页
     ·CaMV35S:GbPDF1-G3GFP载体稳定转化烟草第63-65页
   ·结果与分析第65-81页
     ·在棉花中超量表达GbPDFl不能正常分化成苗第65-66页
     ·干涉PDF1表达抑制棉花纤维的起始第66-72页
     ·干涉PDF1影响棉花纤维发育相关基因网络第72-74页
     ·GbPDF1相互作用蛋白质的分离第74-78页
     ·GbPDF1的亚细胞定位第78-79页
     ·烟草中超量表达GbPDF1增加初生根长度第79-81页
   ·讨论第81-85页
     ·适当调整改变目的基因表达丰度的策略第81-82页
     ·棉花纤维起始过程中PDF1的功能及其可能的作用机制第82-85页
第四章 棉花中PDF1基因的转录调控分析第85-106页
   ·实验方法第85-93页
     ·GbPDF1启动子的克隆与顺式元件分析第85-86页
     ·引物延伸实验确定GbPDF1的转录起始位点第86-87页
     ·启动子表达载体构建第87-89页
       ·PGbPDF1-1及PGbPDF1-2驱动报告基因GUS的表达载体构建第87页
       ·启动子PGbPDF1-1系列缺失表达载体的构建第87-88页
       ·启动子顺式元件突变表达载体构建第88-89页
     ·启动子驱动GUS报告基因的表达载体转化材料的表达特性分析第89-90页
       ·启动子表达载体转化棉花下胚轴及转化子的检测第89页
       ·启动子表达载体转化拟南芥及转化子的检测第89页
       ·组织化学染色定性分析GUS活性第89-90页
       ·石蜡切片第90页
       ·GUS蛋白定量分析第90页
     ·凝胶阻滞验证DNA与核蛋白的体外互作第90-93页
       ·拟南芥及棉花组织核蛋白的提取第90-92页
       ·寡聚核昔酸探针的同位素标记第92-93页
       ·寡聚核苷酸探针与核蛋白的体外互作及检测第93页
   ·结果与分析第93-104页
     ·GbPDF1基因的启动子的克隆与序列分析第93-95页
     ·GbPDF1核心启动子区的确定第95-100页
     ·GbPDF1核心顺式元件的确定第100-104页
   ·讨论第104-106页
     ·GbPDF1与AtPDF1转录调控关键元件的不一致性第104-105页
     ·与HDZIP2ATATHB2互作蛋白的相关研究第105-106页
小结第106-107页
参考文献第107-119页
附录第119-123页
在读期间所发表的学术论文第123页
申请专利第123-124页
致谢第124页

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