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一种新糖苷酶家族的A.tabescens β-甘露聚糖酶Man78基因克隆及序列分析的研究

目录第1-8页
中文摘要第8-9页
英文摘要第9-10页
英文缩略词表第10-11页
1 前言第11-25页
   ·β-甘露聚糖酶的简介第11-15页
   ·β-甘露聚糖酶的基因克隆第15-17页
   ·β-甘露聚糖酶的基因表达第17-19页
   ·β-甘露聚糖酶的应用及研究进展第19-21页
   ·质谱技术及其在生命科学中的应用第21-22页
   ·研究背景、思路和意义第22-25页
2 实验设备及材料第25-29页
   ·主要仪器设备第25页
   ·实验材料第25-29页
     ·菌种第25-26页
     ·培养基第26页
     ·试剂与母液配制第26-27页
     ·酶类第27-28页
     ·试剂盒第28页
     ·其他第28-29页
3 实验方法第29-49页
   ·β-甘露聚糖酶的活力测定第29-30页
   ·蛋白质浓度测定第30-31页
   ·β-甘露聚糖酶的分离和纯化第31-32页
   ·β-甘露聚糖酶的质谱分析第32页
   ·总RNA的提取第32页
   ·RT-PCR第32-39页
     ·简并引物设计第32-33页
     ·RT-PCR步骤第33-34页
     ·切胶回收PCR产物第34-35页
     ·TA克隆第35-37页
     ·测序第37页
     ·RT-PCR条件摸索第37-39页
       ·更换引物第37页
       ·调整引物比例第37-38页
       ·调整Mg2+浓度第38-39页
       ·调整模板浓度第39页
       ·退火温度摸索第39页
       ·二次PCR及降落PCR第39页
   ·基因组DNA提取第39-40页
   ·简并引物PCR第40-42页
     ·PCR步骤第40-41页
     ·切胶回收PCR产物第41页
     ·TA克隆第41-42页
     ·测序第42页
   ·SMART-5'RACE第42-45页
     ·引物设计第42页
     ·5'RACE-Ready cDNA的制备第42-43页
     ·5'RACE步骤第43-44页
     ·巢式PCR第44-45页
     ·切胶回收5'RACE产物第45页
     ·测序第45页
   ·MART-3' RACE第45-47页
     ·引物设计第45页
     ·3'RACE-Ready cDNA的制备第45-46页
     ·3'RACE步骤第46页
     ·切胶回收3'RACE产物第46-47页
     ·TA克隆第47页
     ·测序第47页
   ·成熟肽PCR第47-48页
   ·拼接全长cDNA序列第48页
   ·生物信息学分析第48-49页
4 实验结果第49-85页
   ·β-甘露聚糖酶的分离和纯化第49-50页
   ·β-甘露聚糖酶的质谱分析第50-51页
   ·总RNA的提取第51-52页
   ·RT-PCR第52-56页
     ·RT-PCR产物的电泳检测第52页
     ·pT双酶切鉴定第52页
     ·RT-PCR产物的测序结果第52-53页
     ·RT-PCR条件摸索第53-56页
       ·RT-PCR产物的电泳检测第54页
       ·pT1双酶切鉴定第54页
       ·RT-PCR产物的测序结果第54-56页
   ·基因组DNA提取的结果第56页
   ·简并引物PCR第56-60页
     ·PCR产物的电泳检测第56页
     ·pT双酶切鉴定第56-57页
     ·PCR产物的测序结果第57-60页
   ·SMART-5'RACE结果第60-61页
     ·5'RACE产物的电泳检测第60页
     ·pT双酶切鉴定第60页
     ·PCR产物的测序结果第60-61页
   ·SMART-3'RACE结果第61-65页
     ·3'RACE产物的电泳检测第61-62页
     ·pT双酶切鉴定第62页
     ·3'RACE产物的测序结果第62-65页
   ·成熟肽PCR结果第65-67页
   ·拼接全长cDNA序列第67-68页
   ·生物信息学分析第68-85页
     ·开放阅读框分析第68-72页
     ·同源性分析第72-75页
     ·一级结构分析第75-79页
     ·二级结构和功能分析第79-83页
     ·三级结构分析第83-85页
5 讨论第85-90页
   ·利用肽段信息进行简并引物的设计第85页
   ·RT-PCR条件的优化第85-86页
   ·以基因组DNA为模板的简并PCR克隆新基因的尝试第86页
   ·TAIL-PCR克隆新基因的5'和3'末端第86-87页
   ·生物信息学分析第87-90页
小结和展望第90-91页
参考文献第91-97页
致谢第97页

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