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十字花科黑腐病菌Ⅲ型分泌系统hpa基因功能的鉴定

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-12页
第一章 前言第12-36页
   ·植物与病原菌相互作用的机理研究第12-19页
     ·植物病原细菌的致病因子及编码致病因子的致病基因第12-15页
       ·胞外多糖第13页
       ·脂多糖第13-14页
       ·胞外酶第14页
       ·植物毒素第14-15页
       ·三型分泌的效应物第15页
     ·病原菌的分泌系统第15-19页
       ·Ⅰ型分泌系统第16页
       ·Ⅱ型分泌系统第16页
       ·Ⅲ型分泌系统第16-18页
       ·Ⅳ型分泌系统第18页
       ·Ⅴ型分泌系统第18-19页
   ·十字花科黑腐病菌分子遗传学研究概况第19-20页
     ·十字花科黑腐病菌特征及其分类现状第19页
     ·Xcc遗传学研究概况第19-20页
   ·hrp基因概述第20-23页
     ·hrp基因簇组成及功能第20-21页
     ·hrp基因簇的调控机理第21-23页
       ·hrp致病岛—效应物蛋白运输的遗传学基础第21-22页
       ·hrp基因的表达第22-23页
   ·T3SS效应物概述第23-32页
     ·效应物的特征第23-25页
       ·T3SS的特征第23-25页
       ·效应物的特征第25页
     ·效应物的研究概况第25-29页
     ·全基因组鉴定效应物系统研究方法概况第29-31页
     ·avr基因的研究概况第31-32页
   ·hpa基因研究概述第32-35页
     ·hpa基因在Xcc 8004 hrp致病岛的基本分布及hpa基因研究概况第32-33页
     ·hpa基因研究概况第33-35页
   ·本研究的目的和意义第35-36页
     ·目的与内容第35页
     ·研究意义第35-36页
第二章 材料与方法第36-59页
   ·菌株和质粒第36-40页
   ·培养基及培养条件第40-41页
     ·大肠杆菌(E.coli)第40页
     ·黄单胞菌(Xcc)第40-41页
   ·菌种保藏第41页
   ·常用抗生素第41页
   ·常用溶液、缓冲液第41-42页
   ·细菌核酸的制备第42-44页
     ·细菌总DNA的提取第42页
     ·质粒的提取(碱裂解法)第42-43页
     ·细菌总RNA的提取第43-44页
     ·cDNA的合成第44页
   ·细菌总蛋白的制备第44-45页
   ·凝胶电泳第45-46页
   ·Western印迹第46-47页
   ·感受态细胞的制备和转化第47-49页
     ·电击法转化大肠杆菌第47-48页
     ·氯化钙法转化大肠杆菌第48-49页
   ·DNA操作第49页
     ·DNA片段的回收第49页
     ·DNA的酶切和连接第49页
   ·PCR扩增DNA片段第49-52页
     ·PCR引物的设计第49-50页
     ·PCR反应第50-52页
     ·反转录PCR(RT-PCR)第52页
   ·DNA测序第52-53页
   ·三亲本接合第53页
   ·突变体营养缺陷型检测第53页
   ·胞外酶的检测第53-54页
     ·胞外蛋白酶的检测第53-54页
     ·胞外淀粉酶的检测第54页
     ·胞外纤维素酶的检测第54页
   ·胞外多糖的检测第54页
   ·植物试验第54-56页
     ·致病性试验第54-55页
     ·过敏反应(HR)试验第55-56页
       ·十字花科黑腐病菌过敏性反应检测第55-56页
   ·细菌在培养基中的生长繁殖第56页
   ·细菌在寄主中的生长繁殖第56-57页
   ·整合突变体的构建第57页
     ·整合突变体的构建第57页
     ·整合突变体的验证第57页
   ·突变体的反式功能互补第57页
   ·候选效应物基因的表达构建第57-58页
   ·目的基因启动子报道基因的构建第58页
   ·候选基因的转运检测构建第58页
   ·β-葡糖醛酸酶(GUS)活性平板检测第58-59页
第三章 结果与分析第59-86页
   ·报告质粒pLAG、pLJ-B、pJAG、pJJB的构建第59-66页
     ·构建策略第59-60页
     ·构建结果第60-62页
       ·pLXG,pJXG的构建第60-61页
       ·pLJB,pJJB,pLAG,pJAG的构建第61-62页
     ·报告质粒的分子验证第62-65页
     ·报告质粒效应物转运实验验证第65-66页
   ·hpa基因功能的验证第66-86页
     ·各hpa基因非极性整和突变体的构建和验证第67-69页
       ·Xcc 8004各hpa基因在各病原菌间的分布(表3-1)第67页
       ·Xcc 8004基因组上目标基因的整合突变体的构建第67页
       ·3001NK的构建第67-68页
       ·3014NK的验证第68页
       ·3022NK的验证第68-69页
     ·影响致病性或过敏反应的hpa基因互补菌株的构建第69-70页
     ·各hpa基因突变体及hrpF突变体的致病性上株结果第70页
     ·各hpa基因突变体及互补株的致病性上株结果第70-71页
     ·各hpa基因整合突变体及互补株的HR上株结果第71-72页
     ·各hpa基因整合突变体及互补株的表型检测第72-74页
     ·各hpa基因信号区融合pL6gus,检测其是否有独立的启动子第74-77页
     ·RT-PCR进一步检测hpa基因是否hrpG,hrpX调控及Xcc 8004 hrp基因簇在不同培养基中的表达差异情况第77-78页
     ·各hpa基因自身是效应物或分子伴侣第78-81页
     ·已知效应物及hrpF导入各非效应物突变体后的HR结果第81-86页
第四章 讨论第86-101页
   ·关于hpa基因第86-88页
     ·关于hpa1基因第86页
     ·关于hpa2基因第86-87页
     ·关于hpaB基因第87页
     ·关于hpaP基因第87页
     ·关于XC3024基因第87页
     ·关于hpaA基因第87-88页
     ·关于hpa基因表达条件的讨论第88页
   ·关于效应物转运和分泌的鉴定系统第88-101页
致谢第101-102页
攻读学位期间发表论文情况第102页

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