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猪GFAT1与SLC2A基因家族中6个基因克隆、定位、SNP检测及与生产性状的关联分析

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
1 文献综述第12-21页
   ·猪基因组研究现状第12-13页
   ·猪中重要生理功能相关基因研究现状与继续寻找新基因的必要性第13-15页
     ·与生长和胴体性状相关的候选基因第13-14页
     ·与肉质性状相关的候选基因第14页
     ·猪生产性状相关候选基因进一步挖掘的必要性第14-15页
   ·葡萄糖转运和氨基己糖路径第15-16页
     ·葡萄糖转运第15-16页
     ·氨基己糖通路第16页
   ·GFAT1基因的研究进展第16-17页
   ·SLC2A基因家族的研究进展第17-21页
     ·GLUTs的分子构型第17-18页
     ·GLUTs的类型第18页
     ·SLC2A基因家族的定位及蛋白GLUTs的结构,分布第18-21页
2 本研究的目的和意义第21-22页
3 材料和方法第22-33页
   ·材料第22-26页
     ·组织样品第22页
     ·DNA样品第22-23页
     ·主要仪器设备第23页
     ·培养基、工具酶及试剂盒第23-24页
     ·主要试剂及配制第24-25页
       ·主要试剂第24页
       ·主要试剂配制第24-25页
     ·数据库及分析软件第25-26页
       ·常用分子生物学网站第25页
       ·主要分子生物学软件和统计软件第25-26页
   ·方法第26-33页
     ·猪候选基因的分离方法第26-28页
       ·猪EST信息的获取和整理第26页
       ·引物设计第26页
       ·总RNA提取第26页
       ·RNA的甲醛凝胶电泳第26-27页
       ·反转录反应(Reverse transcription RT)第27页
       ·PCR扩增条件第27页
       ·PCR产物的纯化、克隆和测序第27-28页
       ·DNA序列同源性检索鉴定第28页
     ·六个基因染色体定位第28-31页
       ·引物设计第28-29页
       ·PCR扩增分型条件第29-30页
       ·数据分析方法第30-31页
     ·利用RT-PCR进行GFAT1和SLC2A4编码区的扩增第31页
     ·利用RT-PCR进行GFAT1和SLC2A4基因组织表达谱研究的方法第31-32页
     ·PCR-RFLP方法检测猪GFAT1和SLC2A4基因的多态性第32页
       ·扩增引物第32页
       ·酶切条件第32页
       ·基因分型第32页
     ·多态标记与性状的关联分析方法第32-33页
4 结果第33-55页
   ·基因片段的分离、序列分析与鉴定结果第33-42页
     ·总RNA的提取与检测结果第33页
     ·分离猪GFAT1、SLC2A2、SLC2A3、SLC2A4、SLC2A5、SLC2A8和SLC2A12基因的结果第33-35页
     ·猪GFAT1基因完整编码区(CDS)的序列分析第35-39页
     ·猪SLC2A4基因完整编码区(CDS)的序列分析第39-42页
   ·基因的定位结果第42-48页
     ·利用SCHP进行染色体区域定位结果第42-45页
       ·GFAT1基因染色体区域定位结果第42-44页
       ·SLC2A基因家族5个基因染色体区域定位结果第44-45页
     ·利用辐射杂种板RH进行精细定位结果第45-48页
       ·GFAT1基因精细定位结果第45-46页
       ·SLC2A基因家族5个基因精细定位结果第46-48页
   ·RT-PCR扩增的结果第48-50页
     ·GFAT1组织表达表达谱分析第48-49页
     ·SLC2A4组织表达表达谱分析第49-50页
   ·猪GFAT1和SLC2A4基因的SNP检测及其与性状的关联分析第50-55页
     ·猪GFAT1基因第八内含子多态检测及与性状的关联分析第50-52页
       ·SNP检测第50-51页
       ·不同猪群基因型频率的检测结果第51-52页
     ·猪SLC2A4基因第四外显子多态检测及与性状的关联分析第52-55页
       ·SNP检测第52-53页
       ·不同猪群基因型频率的检测结果第53-55页
5 讨论第55-60页
   ·关于基因的物理定位第55-57页
     ·定位引物的设计第55-56页
     ·基因的定位结果第56-57页
   ·关于GFAT1和SLC2A4基因的组织表达谱第57-58页
   ·关于基因的多态性检测及性状的关联分析第58-60页
     ·GFAT1基因第八内含子的多态性第58页
     ·SLC2A4基因第四外显子的多态性第58-60页
6 小结第60-62页
   ·本研究获得的结果第60页
   ·本研究的创新点第60-61页
   ·本研究的不足之处第61页
   ·下一步值得研究的工作第61-62页
参考文献第62-70页
在读期间发表的论文题录第70-71页
附录第71-74页
 附录1 缩略词表第71-72页
 附录2 扩增产物的序列第72-74页
致谢第74页

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