| 中文摘要 | 第1-8页 |
| 英文摘要 | 第8-15页 |
| 符号说明 | 第15-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-43页 |
| 第1节 DNA 降解现象的前期研究 | 第17-23页 |
| ·DNA 降解现象的发现 | 第17-19页 |
| ·Dnd 现象是Tris 依赖性的氧化切割反应 | 第19-20页 |
| ·变铅青链霉菌的异常修饰系统具有DNA 位点特异性 | 第20-22页 |
| ·DNA 异常修饰属于复制后修饰 | 第22-23页 |
| 第2节 DNA异常修饰的研究进展 | 第23-35页 |
| ·变铅青链霉菌中异常修饰基因簇的分离 | 第23-26页 |
| ·序列分析与DNA 异常修饰相关的基因簇 | 第26-27页 |
| ·其他细菌中的Dnd 表型和dnd 基因簇 | 第27-30页 |
| ·Dnd 蛋白功能分析 | 第30-33页 |
| ·DNA 硫修饰的近期进展 | 第33-35页 |
| 第3节 DNA硫修饰的近期进展 | 第35-39页 |
| ·dnd 基因簇的分布和来源 | 第35-37页 |
| ·dndB 的中断会加剧DNA 体外降解 | 第37-39页 |
| ·Dnd 蛋白功能探索 | 第39页 |
| 第4节 DNA 硫修饰的研究意义和挑战 | 第39-41页 |
| ·硫修饰——DNA 分子结构新的补充 | 第39-40页 |
| ·硫修饰——其他相关领域发展的推动力 | 第40-41页 |
| ·DNA 硫修饰的挑战——DNA 硫修饰的化学本质 | 第41页 |
| 第5节 本研究内容和目的 | 第41-43页 |
| ·本研究基础 | 第41页 |
| ·本研究内容和目的 | 第41-43页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第43-56页 |
| 第1节 实验材料 | 第43-50页 |
| ·菌株 | 第43-44页 |
| ·质粒 | 第44-47页 |
| ·培养基和化学试剂 | 第47-50页 |
| ·标准品合成 | 第50页 |
| 第2节 实验方法 | 第50-56页 |
| 第三章 硫修饰DNA 分子的定位 | 第56-62页 |
| 第1节 含dnd 基因簇的野生及工程大肠杆菌Dnd 表型的鉴定 | 第56-58页 |
| 第2节 大肠杆菌B7A 和DH10B(pJTU1238) DNA 酶解产物的HPLC 分离以及含~(35)S 组分的定位 | 第58-62页 |
| 第四章 硫修饰脱氧核糖核苷的结构鉴定 | 第62-93页 |
| 第1节 高压液相-质谱分析鉴定硫修饰脱氧核糖核苷 | 第62-66页 |
| 第2节 高效液相色谱/电喷雾飞行时间质谱联用鉴定硫修饰脱氧核糖核苷 | 第66-68页 |
| 第3节 硫修饰脱氧核糖核苷的结构预测 | 第68-72页 |
| 第4节 紫外新峰中硫修饰双脱氧核糖核酸与标准品的对比分析 | 第72-80页 |
| ·高压液相色谱对比保留时间 | 第72-75页 |
| ·高压液相色谱-质谱对比紫外特征吸收和质谱信号 | 第75-80页 |
| 第5节 高压液相色谱-多级质谱断裂分析 | 第80-82页 |
| 第6节 硫修饰5'-d(G_(PS)A)-3' 空间构象的鉴定 | 第82-86页 |
| 第7节 DNA 磷硫酰化修饰与Dnd 表型的联系 | 第86-90页 |
| 第8节 磷硫酰化DNA 降解过程的推断 | 第90-93页 |
| 第五章 变铅青链霉菌中的DNA 硫修饰 | 第93-105页 |
| 第1节 放射性~(35)S 喂养变铅青链霉菌 | 第93-94页 |
| 第2节 LC-MS 检测变铅青链霉菌中的硫修饰DNA 分子 | 第94-99页 |
| 第3节 变铅青链霉菌中可能的硫修饰分子5'-d(G_(PS)G)-3' 的结构鉴定 | 第99-103页 |
| 第4节 高精度质谱确定链霉菌中硫修饰双脱氧核糖核酸 | 第103-105页 |
| 第六章 其他微生物中DNA 硫修饰结构的鉴定 | 第105-130页 |
| 第1节 不同细菌dnd 同源基因簇比较 | 第105-109页 |
| 第2节 不同细菌中dnd 同源基因簇氨基酸序列比较 | 第109-114页 |
| 第3节 不同细菌中DNA 硫修饰结构的检测 | 第114-130页 |
| ·荧光假单胞菌PfO-1 中的DNA 硫修饰 | 第115-117页 |
| ·Hahella chejuensis KCTC 2396 中的DNA 硫修饰 | 第117-119页 |
| ·Shewanella pealeana ATCC 700345 中的DNA 硫修饰 | 第119-122页 |
| ·Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1002 中的DNA 硫修饰 | 第122-125页 |
| ·Oceanobacter sp. RED65 中的DNA 硫修饰 | 第125-127页 |
| ·Geobacter uraniumreducens Rf4 中的DNA 硫修饰 | 第127-130页 |
| 第七章 参与DNA 硫修饰Dnd 蛋白的表达 | 第130-143页 |
| 第1节 Dnd 蛋白在变铅青链霉菌中的表达纯化 | 第130-135页 |
| ·DndC 蛋白在链霉菌中的超量表达和纯化 | 第130-133页 |
| ·DndB 蛋白在链霉菌中的超量表达和纯化 | 第133-135页 |
| ·DndD 蛋白在链霉菌中的超量表达和纯化 | 第135页 |
| 第2节 Dnd 蛋白在大肠杆菌中的异源表达和纯化 | 第135-140页 |
| ·DndB 蛋白的异源表达和纯化 | 第135-137页 |
| ·DndC 蛋白的异源表达和纯化 | 第137-138页 |
| ·DndE 蛋白的异源表达和纯化 | 第138-140页 |
| 第3节 Dnd 蛋白功能后续研究 | 第140-143页 |
| 第八章 链霉菌FR-008 线性质粒pHZ227 上的arsRBOCT 型抗砷系统 | 第143-161页 |
| 第1节 课题背景介绍 | 第143-146页 |
| 第2节 链霉菌FR-008 中抗砷基因簇的定 | 第146-149页 |
| 第3节 链霉菌FR-008 中的arsRBOCT 抗砷基因簇 | 第149-150页 |
| 第4节 arsRBOCT 抗砷基因功能分析 | 第150-158页 |
| ·链霉菌FR-008 线性质粒pHZ227 上抗砷基因簇的基因置换 | 第150-154页 |
| ·arsRBOCT 基因簇的转录 | 第154-155页 |
| ·arsRBOCT 抗砷操纵子基因功能分析 | 第155-158页 |
| 第5节 arsRBOCT 基因簇的生物信息学比较 | 第158-161页 |
| 第九章 本研究工作总结和展望 | 第161-168页 |
| 第1节 本研究工作总结 | 第161-164页 |
| 第2节 本研究主要创新点 | 第164-165页 |
| 第3节 本研究工作进一步展望 | 第165-168页 |
| 参考文献 | 第168-173页 |
| 致谢 | 第173-175页 |
| 攻读学位期间发表学术论文和申请发明专利 | 第175-176页 |
| 附录 | 第176-179页 |
