摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
一 前言 | 第9-18页 |
1.高保真DNA聚合酶的错配校正机制及其应用 | 第10-11页 |
2.PCR中的DNA聚合反应非成熟性终止 | 第11-12页 |
3.利用高保真DNA聚合酶介导SNP敏感性复合分子“开/关” | 第12-13页 |
4.SNP敏感性复合分子“开/关”与其他SNP检测方法的比较 | 第13-17页 |
5.课题意义 | 第17-18页 |
二 材料与方法 | 第18-29页 |
1.主要实验仪器: | 第18页 |
2.实验材料: | 第18-20页 |
·DNA聚合酶: | 第18-19页 |
·质粒和其他试剂: | 第19页 |
·引物合成: | 第19页 |
·试剂配制: | 第19-20页 |
3.实验路线与方法 | 第20-29页 |
·样品制备 | 第21页 |
·引物设计 | 第21-23页 |
·PCR鉴定SNP敏感性复合分子“开/关”的有效性 | 第23-27页 |
·假阳性样品HindⅢ酶切分析 | 第27-28页 |
·退火温度对假阳性的影响 | 第28页 |
·硫代修饰个数对PCR效率的影响 | 第28-29页 |
三 实验结果与分析 | 第29-52页 |
1.SNP检测样品的鉴定 | 第29-30页 |
2.Pfu酶介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第30-37页 |
·Pfu酶与3′末端一个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第30-31页 |
·Pfu酶与3′末端两个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第31-33页 |
·Pfu酶与3′末端三个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第33-34页 |
·退火温度对SNP敏感性复合分子“开/关”的准确性的影响 | 第34-35页 |
·Pfu酶介导的SNP敏感性复合分子“开/关”的假阳性结果分析 | 第35-37页 |
3.Pyrobest酶介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第37-43页 |
·Pyrobest酶与3′末端一个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第37-38页 |
·Pyrobest酶与3′末端两个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第38-40页 |
·Pyrobest酶与3′末端三个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第40-42页 |
·Pyrobest酶介导的SNP敏感性复合分子“开/关”的假阳性结果分析 | 第42-43页 |
4.Deep Vent酶介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第43-49页 |
·Deep Vent酶与3′末端一个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第43-44页 |
·Deep Vent酶与3′末端两个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第44-45页 |
·Deep Vent酶与3′末端三个硫代磷酸修饰的碱基特异性引物介导的SNP敏感性复合分子“开/关” | 第45-47页 |
·Deep Vent酶介导的SNP敏感性复合分子“开/关”的假阳性结果分析 | 第47-49页 |
5.Pfu、Pyrobest和Deep Vent酶介导SNP敏感性复合分子“开/关”的比较 | 第49-52页 |
四 讨论 | 第52-61页 |
1.SNP敏感性复合分子“开/关”检测SNP的可行性 | 第52页 |
2.影响SNP敏感性复合分子“开/关”检测SNP的因素 | 第52-59页 |
·模板与“开/关”效应的关系 | 第52-53页 |
·PCR退火温度与“开/关”效应的关系 | 第53-54页 |
·硫代磷酸修饰与“开/关”效应的关系 | 第54-58页 |
·高保真酶活性与“开/关”效应的关系 | 第58-59页 |
·Mg~(2+)和dNTP对“开/关”效应的影响 | 第59页 |
3.SNP敏感性复合分子“开/关”检测SNP的前景 | 第59-61页 |
五 结论 | 第61-62页 |
参考文献 | 第62-67页 |
附录 | 第67-71页 |
附录1 质粒pDC316序列 | 第67-70页 |
附录2 缩略语及专有名词注释 | 第70-71页 |
致谢 | 第71页 |