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日本血吸虫性别差异表达基因的筛选及新基因的克隆分析

摘要第1-9页
前言第9-12页
第一章 日本血吸虫成虫性别消减文库的构建及分析第12-31页
 1 引言第12页
 2 材料和方法第12-20页
   ·实验动物第12页
   ·载体第12页
   ·主要试剂第12-13页
   ·主要仪器第13页
   ·日本血吸虫雌雄虫的收集第13页
   ·日本血吸虫雌雄虫总 RNA 的提取第13页
   ·日本血吸虫雌雄虫mRNA 的分离第13页
   ·消减杂交分组第13页
   ·雌雄虫消减cDNA 质粒文库的构建第13-20页
     ·雌雄虫及对照样品(人骨骼肌mRNA)cDNA 第一链的合成第13-14页
     ·雌雄虫及对照样品(人骨骼肌mRNA)cDNA 第二链的合成第14-15页
     ·雌雄虫及对照样品(人骨骼肌mRNA)双链cDNA 的 Rsa I 酶切第15页
     ·作为tester 的雌虫、雄虫及对照骨骼肌cDNA 的接头连接第15-16页
     ·接头连接效率分析第16页
     ·第一轮消减杂交第16-17页
     ·第二轮消减杂交第17-18页
     ·消减杂交所获cDNA 的第一轮 PCR 扩增第18页
     ·消减杂交cDNA 的第二轮巢式 PCR 扩增第18-19页
     ·消减效率的分析第19页
     ·消减杂交cDNA 的回收纯化第19页
     ·消减杂交cDNA 与载体的连接第19页
     ·连接产物的转化第19-20页
   ·消减 cDNA 质粒文库的重组比率及插入片段长度分析第20页
   ·消减cDNA 文库的冗余性第20页
   ·消减文库部分 EST 序列的生物信息学分析第20页
 3. 结果与分析第20-28页
   ·雌虫和雄虫总 RNA 提取第20-21页
   ·雌虫和雄虫mRNA 的纯化第21-22页
   ·雌虫、雄虫cDNA 及 Rsa I 酶切结果第22页
   ·接头连接效率第22-24页
   ·性别差异表达基因文库消减效率的分析第24-25页
   ·消减cDNA 质粒文库的重组比率及插入片段长度分析第25-26页
   ·消减文库的冗余性评价第26-27页
   ·消减文库部分 EST 序列的生物信息学分析第27-28页
 4 讨论第28-29页
 5 本章小结第29-31页
第二章 cDNA微阵列技术分析日本血吸虫成虫性别差异基因表达谱第31-70页
 1 引言第31页
 2 材料和方法第31-39页
   ·实验动物第31页
   ·主要仪器和试剂第31-33页
   ·日本血吸虫雌雄虫的分离收集第33页
   ·用于芯片制备的消减杂交克隆的筛选第33页
   ·cDNA 微阵列的制作第33页
   ·芯片杂交实验第33-35页
     ·芯片预杂交第33页
     ·荧光标记探针(以下在冰浴中进行)第33-35页
     ·芯片杂交第35页
     ·洗片第35页
   ·芯片扫描及数据处理第35-36页
   ·差异表达基因杂交数据的在线分析第36页
   ·差异表达基因的测序和分析第36页
   ·性别差异表达基因的实时定量PCR验证第36-39页
     ·RNA 抽提第37页
     ·去除基因组 DNA第37页
     ·反转录第37页
     ·标准品的制备第37-38页
     ·实时定量 PCR第38-39页
 3 结果第39-65页
   ·cDNA 微阵列的构建第39页
   ·差异表达基因芯片杂交结果第39-45页
   ·基因芯片杂交数据的聚类分析第45-48页
   ·差异表达基因的测序及生物信息学分析第48-63页
   ·血吸虫性别差异表达基因的实时定量 PCR 验证第63-65页
     ·实时定量 PCR 的标准曲线的绘制第63-64页
     ·血吸虫性别差异表达基因的实时荧光定量 PCR 验证结果第64-65页
 4 讨论第65-68页
 5 本章小结第68-70页
第三章 日本血吸虫性别差异表达新基因全长cDNA 的克隆与分析第70-98页
 1 引言第70页
 2. 材料与方法第70-76页
   ·实验动物第70页
   ·主要试剂和酶第70-71页
   ·主要仪器第71页
   ·目标基因的ESTs第71页
   ·RACE 引物第71-72页
   ·日本血吸虫雌雄虫的分离收集第72页
   ·总 RNA 的提取第72页
   ·3′和5′RACE 扩增基因全长cDNA第72-75页
     ·3′RACE第72-74页
     ·5′RACE第74-75页
     ·RACE 产物的测序及全长序列的拼接第75页
   ·新基因全长cDNA 的 RT-PCR 扩增、克隆及测序第75页
   ·新基因全长cDNA 编码蛋白的生物信息学分析第75-76页
 3 结果第76-94页
   ·4 个日本血吸虫性别差异表达新基因全长cDNA 的获得第76-77页
   ·差异表达新基因全长cDNA 序列的生物信息学分析第77-94页
     ·雌虫高表达的新基因 f2 的生物信息学分析第77-81页
     ·雄虫高表达的新基因cm3 cDNA 的生物信息学分析第81-85页
     ·雄虫高表达的新基因cm4 cDNA的生物信息学分析第85-91页
     ·雄虫高表达的新基因m1 cDNA的生物信息学分析第91-94页
 4 讨论第94-97页
 5 本章小结第97-98页
结论第98-100页
致谢第100-101页
英文摘要第101-104页
参考文献第104-121页
附录第121-143页
 附录A 文献综述第121-141页
 附录B 质粒pGEM-T Easy 基因图谱第141-142页
 附录C 在学期间发表论文及参编著作第142-143页

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