| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| ·立题背景及意义 | 第12-19页 |
| ·生物信息集成概述 | 第12-13页 |
| ·生物信息集成的问题和难点 | 第13-15页 |
| ·生物信息集成方法及发展现状 | 第15-19页 |
| ·课题研究内容 | 第19-20页 |
| ·论文结构 | 第20-22页 |
| 第二章 相关技术研究 | 第22-41页 |
| ·元数据与元模型研究 | 第22-28页 |
| ·元数据与元模型定义 | 第22-24页 |
| ·CWM 元模型 | 第24-26页 |
| ·DBMS 元数据与整合平台元模型建立 | 第26-28页 |
| ·本体研究及其在生物信息集成中的作用 | 第28-41页 |
| ·本体 | 第28-32页 |
| ·现有生物学本体及其应用 | 第32-35页 |
| ·本体在数据集成中的作用及发展现状 | 第35-38页 |
| ·集成和整合平台中本体库的建立 | 第38-41页 |
| 第三章 基于元数据的蛋白质组学数据资源整合平台研究 | 第41-47页 |
| ·蛋白质组学数据资源整合需求 | 第41-42页 |
| ·基于元数据的生物数据集成平台设计思想 | 第42-43页 |
| ·基于元数据的蛋白质组学数据集成整体架构 | 第43-45页 |
| ·与同类系统的比较分析 | 第45-47页 |
| 第四章 数据库模式元数据自动提取与转换工具设计与实现 | 第47-65页 |
| ·RSCHEMAETS 的设计 | 第47-52页 |
| ·RSchemaETS 工具工作流程 | 第48页 |
| ·元数据提取、转换与导入的关键问题 | 第48-49页 |
| ·RSchemaETS 设计整体思想与实现框架 | 第49-52页 |
| ·JAVACC 编程简介 | 第52-55页 |
| ·JavaCC 编程概述 | 第52-54页 |
| ·BNF 范式 | 第54页 |
| ·JavaCC 在元数据自动提取与转换中的作用 | 第54-55页 |
| ·RSCHEMAETS 的实现与实例 | 第55-65页 |
| ·元数据自动提取和转换模块实现 | 第55-57页 |
| ·元数据缓存模块的实现 | 第57-59页 |
| ·元数据导入模块的实现 | 第59-61页 |
| ·RSchemaETS 的扩展和重用 | 第61-62页 |
| ·RSchemaETS 提取与导入实例 | 第62-65页 |
| 第五章 查询语言及查询语言解释执行器的设计与研究 | 第65-76页 |
| ·MOBIB 中的查询框架和处理流程 | 第65-69页 |
| ·查询需求分析 | 第65-66页 |
| ·查询系统框架和处理流程 | 第66-69页 |
| ·MOBIB 框集中查询功能设计 | 第69-74页 |
| ·查询语言设计 | 第69-72页 |
| ·映射与查询生成与划分 | 第72-74页 |
| ·查询案例分析 | 第74-76页 |
| 第六章 结束语 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-81页 |
| 作者在攻读硕士学位期间论文发表情况 | 第81-82页 |
| 作者在攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第82-83页 |
| 附录A 裁减后CWM 各包的类图 | 第83-92页 |