| 摘要 | 第1-5页 |
| Summary | 第5-21页 |
| Ⅰ ABBREVIATIONS | 第21-22页 |
| Ⅱ INTRODUCTION | 第22-59页 |
| Ⅱ-1 Chromatin and nucleosome | 第24-33页 |
| Ⅱ-1-1 Chromatin structure | 第24-28页 |
| Ⅱ-1-1-1 Heterochromatin and euchromatin | 第24-25页 |
| Ⅱ-1-1-2 Nucleosome | 第25-28页 |
| Ⅱ-1-1-2-1 Nucleosomes as units of genomic organization | 第26-27页 |
| Ⅱ-1-1-2-2 Nucleosomes as units of transcriptional regulation | 第27-28页 |
| Ⅱ-1-2 Regulation of chromatin structure | 第28-33页 |
| Ⅱ-1-2-1 ATP-dependent chromatin remodeling | 第28-29页 |
| Ⅱ-1-2-2 Histone replacement by histone variants | 第29-31页 |
| Ⅱ-1-2-2-1 H2A variants | 第29-30页 |
| Ⅱ-1-2-2-2 H3 variants | 第30-31页 |
| Ⅱ-1-2-3 Histone covalent modifications | 第31-33页 |
| Ⅱ-2 Chromatin assembly and histone chaperones | 第33-48页 |
| Ⅱ-2-1 Chromatin assembly | 第33-35页 |
| Ⅱ-2-1-1 Nucleosome assembly:deposition of histone dimers | 第33-34页 |
| Ⅱ-2-1-2 Compaction of nucleosome arrays | 第34-35页 |
| Ⅱ-2-1-3 Higher-order chromatin structures | 第35页 |
| Ⅱ-2-2 Histone chaperones | 第35-48页 |
| Ⅱ-2-2-1 Highly conserved histone chaperones | 第37-44页 |
| Ⅱ-2-2-1-1 CAF-1(Chromatin Assembly Factor-1) | 第37-38页 |
| Ⅱ-2-2-1-2 HIRA(Histone regulation A) | 第38页 |
| Ⅱ-2-2-1-3 Asf1(Anti-silencing function 1) | 第38-39页 |
| Ⅱ-2-2-1-4 Spt6 | 第39页 |
| Ⅱ-2-2-1-5 FACT(Faciliates chromatin transcription) complex | 第39-40页 |
| Ⅱ-2-2-1-6 Nucleolin | 第40-41页 |
| Ⅱ-2-2-1-7 NAP1(Nucleosome Assembly Protein 1) | 第41-44页 |
| Ⅱ-2-2-1-7-1 NAP1 structure,postsynthetic modifications,histone shuttling,and oligomerization states | 第41-43页 |
| Ⅱ-2-2-1-7-2 Histone binding activity of NAP1 | 第43页 |
| Ⅱ-2-2-1-7-3 Chaperone activity of NAP1 | 第43-44页 |
| Ⅱ-2-2-1-7-4 TAF-1β/SET | 第44页 |
| Ⅱ-2-2-2 Species-specific histone chaperones | 第44-47页 |
| Ⅱ-2-2-2-1 N1/N2 | 第44-45页 |
| Ⅱ-2-2-2-2 FKBP(The FK506-binding protein) | 第45页 |
| Ⅱ-2-2-2-3 JDP2(Jun dimerization protein 2) | 第45页 |
| Ⅱ-2-2-2-4 Rtt106 | 第45-46页 |
| Ⅱ-2-2-2-5 Protein 6b | 第46页 |
| Ⅱ-2-2-2-6 NPM(Nucleoplasmin/nucleophosmin) | 第46-47页 |
| Ⅱ-2-2-2-7 Chz1(chaperone for H2A.Z-H2B1) | 第47页 |
| Ⅱ-2-2-3 Linker histone chaperones | 第47页 |
| Ⅱ-2-2-4 Histone chaperone-like proteins | 第47-48页 |
| Ⅱ-3 Chromatin remodeling and its function in response to environmental factors | 第48-49页 |
| Ⅱ-4 Objective of my work | 第49页 |
| Ⅱ-5 Review published | 第49-59页 |
| Ⅲ RESULTS | 第59-165页 |
| Ⅲ-1 Molecular characterization of rice and tobacco NAP1 proteins | 第61-76页 |
| Ⅲ-2 Molecular characterization of Arabidopsis NAP1 proteins | 第76-165页 |
| Ⅲ-2-1 NUCLEOSOME ASSEMBLY PROTEIN1(NAP1) Is Involved in Nucleotide Excision Repair in Arabidopsis thaliana | 第80-132页 |
| Ⅲ-2-2 A truncated NUCELOSOME ASSEMBLY PROTEIN1,AtNAP1;3-T,affects Arabidopsis response to abscisic acid | 第132-165页 |
| Ⅳ GENERAL DISCUSSION AND PERSPECTIVES | 第165-180页 |
| Ⅳ-1 NAP1 family genes in plants | 第167-169页 |
| Ⅳ-2 Subcellular localization of plant NAP1 family proteins | 第169-170页 |
| Ⅳ-3 More histone H2A/H2B chaperones in plants | 第170-172页 |
| Ⅳ-4 NAP1 and transcription | 第172页 |
| Ⅳ-5 NAP1 in DNA repair | 第172-174页 |
| Ⅳ-6 NAP1 in ABA signaling | 第174-176页 |
| Ⅳ-7 Other functions of plant NAP1 proteins | 第176-177页 |
| Ⅳ-8 Perspective | 第177-180页 |
| Ⅴ MATERIALS AND METHODS | 第180-205页 |
| Ⅴ-1 Materials | 第182-189页 |
| Ⅴ-1-1 Plant Materials | 第182页 |
| Ⅴ-1-2 Bacteria strains | 第182-183页 |
| Ⅴ-1-2-1 Escherichia coli | 第182-183页 |
| Ⅴ-1-2-2 Agrobacterium tumefaciens | 第183页 |
| Ⅴ-1-3 Cloning and expression vectors | 第183-186页 |
| Ⅴ-1-4 Antibodies | 第186页 |
| Ⅴ-1-5 Antibiotics | 第186页 |
| Ⅴ-1-6 Chemicals | 第186-187页 |
| Ⅴ-1-7 Oligos | 第187-189页 |
| Ⅴ-2 Methods | 第189-205页 |
| Ⅴ-2-1 General techniques in molecular biology | 第189-199页 |
| Ⅴ-2-1-1 Vector construction | 第189-192页 |
| Ⅴ-2-1-1-1 PCR(Polymerase Chain Reaction) | 第189页 |
| Ⅴ-2-1-1-2 Restriction enzyme digestion | 第189页 |
| Ⅴ-2-1-1-3 Agarose gel electrophoresis | 第189-190页 |
| Ⅴ-2-1-1-4 Ligation | 第190页 |
| Ⅴ-2-1-1-5 Competent cell preparation | 第190-191页 |
| Ⅴ-2-1-1-6 Transformation of competent cells | 第191页 |
| Ⅴ-2-1-1-7 Mini-preparation of plasmid DNA by alkaline lysis with SDS | 第191-192页 |
| Ⅴ-2-1-2 Genomic DNA isolation | 第192-193页 |
| Ⅴ-2-1-3 RNA isolation and analysis | 第193-195页 |
| Ⅴ-2-1-3-1 Total RNA extraction | 第193页 |
| Ⅴ-2-1-3-2 Reverse transcription | 第193页 |
| Ⅴ-2-1-3-3 Electrophoretic separation of RNAs | 第193-194页 |
| Ⅴ-2-1-3-4 Transfer of RNA to membrane | 第194页 |
| Ⅴ-2-1-3-5 Northern hybridization | 第194-195页 |
| Ⅴ-2-1-4 Quantitative PCR analysis | 第195页 |
| Ⅴ-2-1-5 Protein expression,purification and detection | 第195-199页 |
| Ⅴ-2-1-5-1 Protein expression in E.Coli | 第195页 |
| Ⅴ-2-1-5-2 Purification of expressed proteins from E.Coli | 第195-196页 |
| Ⅴ-2-1-5-3 Separation of proteins by SDS-PAGE | 第196-197页 |
| Ⅴ-2-1-5-4 Western blot | 第197页 |
| Ⅴ-2-1-5-5 Pull down assay | 第197-198页 |
| Ⅴ-2-1-5-6 Co-Immunoprecipitation analysis | 第198页 |
| Ⅴ-2-1-5-7 Subcellular Protein Fractionation | 第198-199页 |
| Ⅴ-2-1-7 In vitro CK2 phosphorylation assay | 第199页 |
| Ⅴ-2-2 Tobacco BY2 cells culture and transformation | 第199-200页 |
| Ⅴ-2-2-1 TBY2 cell culture | 第199页 |
| Ⅴ-2-2-2 TBY2 cell transformation | 第199-200页 |
| Ⅴ-2-3 Arabidopsis thaliana culture and transformation | 第200-201页 |
| Ⅴ-2-3-1 Arabidopsis culture | 第200页 |
| Ⅴ-2-3-2 Arabidopsis transformation by flower dip method | 第200-201页 |
| Ⅴ-2-4 Chromatin immunoprecipitation(ChIP) | 第201-202页 |
| Ⅴ-2-5 Yeast Two-Hybrid Screening and Assays | 第202页 |
| Ⅴ-2-6 Phenotype analysis of ABA and salt treatment | 第202-203页 |
| Ⅴ-2-7 GUS-reporter Construction and Enzyme Activity Assay | 第203页 |
| Ⅴ-2-8 UV treatment and In Vitro DNA Repair Assay | 第203-204页 |
| Ⅴ-2-9 Microarray | 第204-205页 |
| Ⅵ REFERENCES | 第205-230页 |
| Acknowledgements | 第230-231页 |
