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白背飞虱非编码RNA的鉴定和特征分析

摘要第5-7页
abstract第7-9页
第1章 绪论第13-37页
    1.1 非编码RNA概述第13页
    1.2 miRNA研究进展第13-21页
        1.2.1 miRNA概述第13-14页
        1.2.2 miRNA的产生机制第14页
        1.2.3 miRNA功能调控机制第14-15页
        1.2.4 昆虫中miRNA的功能研究第15-16页
        1.2.5 miRNA的预测方法第16-19页
        1.2.6 miRNA靶基因预测软件第19-21页
    1.3 内源siRNA研究进展第21-22页
        1.3.1 内源siRNA概述第21页
        1.3.2 内源siRNA的产生机制第21-22页
        1.3.3 内源siRNA功能第22页
    1.4 piRNA的研究进展第22-25页
        1.4.1 piRNA概述第22-23页
        1.4.2 piRNA的产生机制第23-24页
        1.4.3 piRNA功能第24-25页
        1.4.4 piRNA cluster鉴定分析软件第25页
    1.5 lncRNA的研究进展第25-29页
        1.5.1 lncRNA概述第25-26页
        1.5.2 lncRNA的产生机制第26页
        1.5.3 lncRNA的作用机制第26-29页
        1.5.4 昆虫中lncRNA的研究第29页
    1.6 circRNA的研究进展第29-34页
        1.6.1 circRNA概述第29页
        1.6.2 circRNA的产生机制第29-30页
        1.6.3 circRNA的作用机制第30-31页
        1.6.4 circRNA的鉴定分析软件第31-34页
    1.7 白背飞虱背景介绍第34-37页
第2章 白背飞虱中非编码小RNA的研究第37-79页
    2.1 鉴定和特征分析白背飞虱细胞中的miRNA第37-54页
        2.1.1 材料和方法第37-40页
        2.1.2 结果和讨论第40-54页
    2.2 白背飞虱成虫小RNA文库中的miRNA特征及比较分析第54-65页
        2.2.1 材料和方法第54-56页
        2.2.2 结果和讨论第56-65页
    2.3 鉴定白背飞虱siRNA和piRNA的表达谱第65-79页
        2.3.1 材料和方法第65-67页
        2.3.2 结果和讨论第67-79页
第3章 白背飞虱和灰飞虱的lncRNA的鉴定和分析第79-95页
    3.1 材料和方法第80-83页
        3.1.1 白背飞虱和灰飞虱样本来源第80页
        3.1.2 计算方法鉴定lncRNA第80-81页
        3.1.3 lncRNA的比较分析第81-82页
        3.1.4 评估转录本发育特异性评分第82页
        3.1.5 lncRNA和已知基因的共表达分析第82页
        3.1.6 GO富集分析第82-83页
    3.2 结果和讨论第83-92页
        3.2.1 白背飞虱和灰飞虱的lncRNA的鉴定第83-85页
        3.2.2 白背飞虱和灰飞虱lncRNA的特征第85-88页
        3.2.3 白背飞虱、灰飞虱和褐飞虱lncRNA的比较分析第88-89页
        3.2.4 灰飞虱lncRNA在发育阶段的表达谱第89页
        3.2.5 白背飞虱lncRNA在发育阶段的表达谱第89-91页
        3.2.6 白背飞虱lncRNA的基因调控作用第91-92页
    3.3 讨论第92-95页
第4章 白背飞虱的circRNA鉴定第95-106页
    4.1 材料和方法第96-97页
        4.1.1 白背飞虱样本来源第96页
        4.1.2 RNA提取和文库构建第96页
        4.1.3 circRNA的计算机方法鉴定及特征鉴定第96页
        4.1.4 circRNA两侧反向互补序列检测第96页
        4.1.5 GO功能和KEGG通路富集第96-97页
        4.1.6 circRNA的miRNA靶位点预测第97页
        4.1.7 circRNA在雌性和雄性成虫中的差异表达分析第97页
    4.2 结果与讨论第97-104页
        4.2.1 白背飞虱中circRNA的鉴定第97-98页
        4.2.2 白背飞虱circRNA的特征第98-100页
        4.2.3 白背飞虱外显子circRNA两侧内含子特征第100页
        4.2.4 circRNA的功能注释第100-102页
        4.2.5 circRNA在发育阶段和组织的表达谱第102-104页
        4.2.6 circRNA在不同性别成虫的表达差异第104页
    4.3 讨论第104-106页
参考文献第106-118页
附录第118-120页
致谢第120-121页
在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果第121页

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