母乳源植物乳杆菌的全基因组测序与潜在的益生能力探究
| 缩略词 | 第4-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-22页 |
| 1.1 母乳微生物群 | 第13-15页 |
| 1.1.1 母乳微生物群的起源 | 第13-14页 |
| 1.1.2 母乳微生物组成与功能 | 第14页 |
| 1.1.3 母乳来源的益生菌 | 第14-15页 |
| 1.2 益生菌 | 第15-17页 |
| 1.2.1 益生菌定义与发展史 | 第15-16页 |
| 1.2.2 益生菌分类 | 第16页 |
| 1.2.3 益生菌的功能与作用机制 | 第16-17页 |
| 1.3 植物乳杆菌 | 第17-19页 |
| 1.3.1 植物乳杆菌生理生化与基因组特征 | 第17-18页 |
| 1.3.2 植物乳杆菌的益生作用研究进展 | 第18-19页 |
| 1.4 高通量测序技术 | 第19-20页 |
| 1.5 研究目的、意义及内容 | 第20-22页 |
| 1.5.1 研究目的与意义 | 第20-21页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第21-22页 |
| 第二章 母乳源植物乳杆菌的分离、鉴定与分型 | 第22-32页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 实验材料和仪器 | 第22-24页 |
| 2.2.1 主要试剂、耗材 | 第22-23页 |
| 2.2.2 主要仪器 | 第23-24页 |
| 2.3 实验方法 | 第24-26页 |
| 2.3.1 培养基及溶液准备 | 第24页 |
| 2.3.2 样本采集及处理 | 第24页 |
| 2.3.3 菌株分离、纯化与保种 | 第24-25页 |
| 2.3.4 MALDI-TOFMS初步鉴定 | 第25页 |
| 2.3.5 16S rRNA扩增与菌株鉴定 | 第25-26页 |
| 2.3.6 rep-PCR分型 | 第26页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第26-30页 |
| 2.4.1 MALDI-TOF MS鉴定结果 | 第26-27页 |
| 2.4.2 菌株测序鉴定分析 | 第27-30页 |
| 2.4.3 rep-PCR分型结果 | 第30页 |
| 2.5 小结 | 第30-32页 |
| 第三章 植物乳杆菌的形态学观察与生长条件优化 | 第32-43页 |
| 3.1 引言 | 第32页 |
| 3.2 实验材料与仪器 | 第32-33页 |
| 3.2.1 主要试剂、耗材 | 第32页 |
| 3.2.2 主要仪器 | 第32-33页 |
| 3.3 实验方法 | 第33-35页 |
| 3.3.1 菌落形态与革兰氏染色观察 | 第33页 |
| 3.3.2 扫描电镜 | 第33-34页 |
| 3.3.3 生长曲线 | 第34页 |
| 3.3.4 最适培养时间的确定 | 第34页 |
| 3.3.5 最适初始pH的确定 | 第34-35页 |
| 3.3.6 最适温度的确定 | 第35页 |
| 3.3.7 糖发酵实验 | 第35页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第35-42页 |
| 3.4.1 菌落形态与革兰氏染色结果分析 | 第35-36页 |
| 3.4.2 扫描电镜结果 | 第36-37页 |
| 3.4.3 生长曲线监测结果 | 第37-38页 |
| 3.4.4 最适培养时间 | 第38页 |
| 3.4.5 最适初始pH | 第38-39页 |
| 3.4.6 最适温度的实验结果 | 第39-40页 |
| 3.4.7 糖发酵结果 | 第40-42页 |
| 3.5 小结 | 第42-43页 |
| 第四章 模拟环境下测试植物乳杆菌的适应性 | 第43-50页 |
| 4.1 引言 | 第43页 |
| 4.2 实验材料和仪器 | 第43-45页 |
| 4.2.1 主要试剂、耗材 | 第43-44页 |
| 4.2.2 主要仪器 | 第44页 |
| 4.2.3 培养基及溶液准备 | 第44-45页 |
| 4.3 实验方法 | 第45-47页 |
| 4.3.1 人工胃肠液耐受试验 | 第45页 |
| 4.3.2 细胞黏附性实验 | 第45-47页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第47-49页 |
| 4.4.1 人工肠胃液结果 | 第47-48页 |
| 4.4.2 细胞黏附结果 | 第48-49页 |
| 4.5 小结 | 第49-50页 |
| 第五章 菌株益生能力的初步探究 | 第50-57页 |
| 5.1 引言 | 第50页 |
| 5.2 实验材料与仪器 | 第50-51页 |
| 5.3.1 实验材料、仪器 | 第50-51页 |
| 5.3.2 主要仪器 | 第51页 |
| 5.3 实验方法 | 第51-52页 |
| 5.3.1 融血实验 | 第51页 |
| 5.3.2 β-半乳糖苷酶实验 | 第51-52页 |
| 5.3.3 抑菌实验 | 第52页 |
| 5.3.4 肝细胞脂质堆积实验 | 第52页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第52-56页 |
| 5.4.1 溶血实验结果 | 第52-53页 |
| 5.4.2 β-半乳糖苷酶实验结果 | 第53-54页 |
| 5.4.3 抑菌实验结果 | 第54-55页 |
| 5.4.4 肝细胞脂质堆积实验结果 | 第55-56页 |
| 5.5 小结 | 第56-57页 |
| 第六章 全基因组测序与功能基因预测分析 | 第57-70页 |
| 6.1 引言 | 第57-58页 |
| 6.2 实验材料与方法 | 第58页 |
| 6.2.1 实验材料、仪器 | 第58页 |
| 6.2.2 主要仪器 | 第58页 |
| 6.3 实验方法 | 第58-59页 |
| 6.3.1 菌株的DNA的提取 | 第58页 |
| 6.3.2 测序文库的构建 | 第58-59页 |
| 6.3.3 上机与组装 | 第59页 |
| 6.3.4 基因组注释功能与预测 | 第59页 |
| 6.4 实验结果与讨论 | 第59-69页 |
| 6.4.1 测序与组装结果分析 | 第59-60页 |
| 6.4.2 植物乳杆菌基因组的基本特点 | 第60-61页 |
| 6.4.3 植物乳杆菌种属分类与遗传发育树的构建 | 第61-62页 |
| 6.4.4 基因组注释功能与预测 | 第62-65页 |
| 6.4.5 两株菌在抑菌基因簇比较结果 | 第65-66页 |
| 6.4.6 胆汁耐受性相关基因 | 第66-67页 |
| 6.4.7 耐药基因检测 | 第67-69页 |
| 6.5 小结 | 第69-70页 |
| 第七章 结论与展望 | 第70-73页 |
| 7.1 结论 | 第70-71页 |
| 7.2 创新点 | 第71页 |
| 7.3 展望 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-82页 |
| 发表论文 | 第82-83页 |
| 附录 | 第83-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
