中文摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 引言 | 第11-31页 |
1.1 CRP(C-reactive protein)C反应蛋白 | 第11-13页 |
1.1.1 CRP的结构 | 第11-12页 |
1.1.2 炎症反应中的CRP | 第12-13页 |
1.2 CRP与疾病 | 第13-15页 |
1.2.1 CRP与心血管疾病 | 第13-14页 |
1.2.2 CRP血浆水平与癌症 | 第14-15页 |
1.3 CRP基因调控 | 第15-20页 |
1.3.1 CRP调控中的细胞因子和转录因子 | 第16-18页 |
1.3.2 CRP转录后调控 | 第18页 |
1.3.3 CRP调控中的表观修饰 | 第18页 |
1.3.4 增强子对CRP的调控 | 第18-20页 |
1.4 SNP与 C反应蛋白 | 第20-29页 |
1.4.1 SNP概述 | 第20-21页 |
1.4.2 SNP与特定疾病或性状的相关性分析 | 第21-22页 |
1.4.3 CRP表达相关SNP | 第22-23页 |
1.4.4 CRP基因多态性与CRP血浆水平差异相关 | 第23-25页 |
1.4.5 CRP基因多态性与疾病状态 | 第25-26页 |
1.4.6 CRP基因相关SNPs与癌症风险 | 第26-29页 |
1.5 本论文研究的目的及意义 | 第29-31页 |
第二章 材料与方法 | 第31-53页 |
2.1 实验材料 | 第31-32页 |
2.1.1 细胞和血液样品 | 第31页 |
2.1.2 实验仪器 | 第31-32页 |
2.1.3 实验药品和试剂 | 第32页 |
2.2 荧光素酶报告基因实验方法 | 第32-38页 |
2.2.1 超级感受态细胞的制备 | 第32-33页 |
2.2.2 构建载体 | 第33-35页 |
2.2.3 提取质粒 | 第35-36页 |
2.2.4 Hep3B细胞的复苏与扩大培养 | 第36页 |
2.2.5 Hep3B细胞的冻存 | 第36页 |
2.2.6 Hep3B细胞铺板与转染 | 第36-37页 |
2.2.7 荧光素酶报告基因试验 | 第37-38页 |
2.3 血液样品基本信息的调取 | 第38页 |
2.4 血液样品DNA提取与测序 | 第38-39页 |
2.4.1 血液样品总DNA的提取 | 第38-39页 |
2.4.2 血液样品SNP位点基因型测序 | 第39页 |
2.5 血液样品CRP含量测定 | 第39-40页 |
2.6 核酸-蛋白互作实验 | 第40-45页 |
2.6.1 细胞和蛋白的提取 | 第40-41页 |
2.6.2 BCA法测量蛋白浓度 | 第41页 |
2.6.3 探针制备 | 第41-42页 |
2.6.4 核酸-蛋白pull-down实验 | 第42-44页 |
2.6.5 考马斯亮蓝染色/银染实验 | 第44页 |
2.6.6 目的条带的胶内酶解与质谱分析 | 第44-45页 |
2.7 Apex1 作为转录因子的鉴定 | 第45-51页 |
2.7.1 WB定性定量鉴定pull-down产物 | 第45-46页 |
2.7.2 WEMSA试验 | 第46-47页 |
2.7.3 Apex1 高表达/敲低实验 | 第47-48页 |
2.7.4 Apex1 功能结构域突变试验 | 第48-49页 |
2.7.5 ChIP试验验证Apex1 在体内与rs3091244 不同等位亲和性 | 第49-51页 |
2.7.6 Co-IP试验 | 第51页 |
2.8 SNP与癌症风险分析 | 第51-53页 |
2.8.1 血浆水平CRP相关SNPs的连锁不平衡(LD)分析 | 第51-52页 |
2.8.2 CRP基因多样性与癌症风险的meta-analysis | 第52页 |
2.8.3 数据分析 | 第52-53页 |
第三章 结果与结论 | 第53-102页 |
3.1 CRP表达相关SNPs | 第53-56页 |
3.2 不同SNPs次要等位对CRP血浆水平贡献不同 | 第56-63页 |
3.2.1 甘肃地区人群等位频率与亚洲人群等位频率相同 | 第56-57页 |
3.2.2 rs3091244 等位频率在全球的分布情况 | 第57-58页 |
3.2.3 血浆CRP相关SNPs能够影响CRP血浆水平 | 第58-59页 |
3.2.4 多态性基因次要等位对CRP血浆水平影响较大 | 第59-61页 |
3.2.5 SNPs不同基因型对血浆CRP水平影响程度不同 | 第61-62页 |
3.2.6 SNPs不同基因型组合对CRP血浆水平影响差异较大 | 第62-63页 |
3.3 转录因子Apex1 能够影响CRP的表达调控 | 第63-76页 |
3.3.1 rs3091244 次要等位转录活性不同 | 第63-65页 |
3.3.2 转录因子Apex1 的发现 | 第65-66页 |
3.3.3 Apex1 高表达/敲低影响CRP表达水平 | 第66-71页 |
3.3.4 Apex1 能够影响rs3091244 不同等位转录活性 | 第71-73页 |
3.3.5 Apex1 发挥转录因子作用并不依赖其氧化还原结构域、内切酶结构域以及AP位点识别结构域 | 第73-76页 |
3.4 Apex1 通过对rs3091244 结合偏向性影响CRP表达 | 第76-81页 |
3.4.1 体外实验证明Apex1对rs3091244 三种等位结合具有偏向性 | 第76-78页 |
3.4.2 在体条件下Apex1对rs3091244 三种等位亲和力不同 | 第78-81页 |
3.5 Apex1 发挥负调控因子作用不依赖其他转录因子 | 第81-82页 |
3.6 癌症病人血浆CRP水平与SNPs基因型关系 | 第82-91页 |
3.6.1 癌症病人血浆CRP水平升高 | 第83-89页 |
3.6.2 癌症病人血浆CRP水平与SNPs基因型关联减弱 | 第89-91页 |
3.7 CRP相关SNPs与总体癌症发病风险无关 | 第91-93页 |
3.8 CRP相关SNPs与特定类型癌症发病风险无关 | 第93-96页 |
3.9 Meta-analysis证实SNPs与癌症风险无关 | 第96-99页 |
3.10 讨论与主要结论 | 第99-102页 |
参考文献 | 第102-115页 |
在学期间研究成果 | 第115-116页 |
致谢 | 第116页 |