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rs3091244调控CRP基因表达机制及其与癌症风险的关系

中文摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 引言第11-31页
    1.1 CRP(C-reactive protein)C反应蛋白第11-13页
        1.1.1 CRP的结构第11-12页
        1.1.2 炎症反应中的CRP第12-13页
    1.2 CRP与疾病第13-15页
        1.2.1 CRP与心血管疾病第13-14页
        1.2.2 CRP血浆水平与癌症第14-15页
    1.3 CRP基因调控第15-20页
        1.3.1 CRP调控中的细胞因子和转录因子第16-18页
        1.3.2 CRP转录后调控第18页
        1.3.3 CRP调控中的表观修饰第18页
        1.3.4 增强子对CRP的调控第18-20页
    1.4 SNP与 C反应蛋白第20-29页
        1.4.1 SNP概述第20-21页
        1.4.2 SNP与特定疾病或性状的相关性分析第21-22页
        1.4.3 CRP表达相关SNP第22-23页
        1.4.4 CRP基因多态性与CRP血浆水平差异相关第23-25页
        1.4.5 CRP基因多态性与疾病状态第25-26页
        1.4.6 CRP基因相关SNPs与癌症风险第26-29页
    1.5 本论文研究的目的及意义第29-31页
第二章 材料与方法第31-53页
    2.1 实验材料第31-32页
        2.1.1 细胞和血液样品第31页
        2.1.2 实验仪器第31-32页
        2.1.3 实验药品和试剂第32页
    2.2 荧光素酶报告基因实验方法第32-38页
        2.2.1 超级感受态细胞的制备第32-33页
        2.2.2 构建载体第33-35页
        2.2.3 提取质粒第35-36页
        2.2.4 Hep3B细胞的复苏与扩大培养第36页
        2.2.5 Hep3B细胞的冻存第36页
        2.2.6 Hep3B细胞铺板与转染第36-37页
        2.2.7 荧光素酶报告基因试验第37-38页
    2.3 血液样品基本信息的调取第38页
    2.4 血液样品DNA提取与测序第38-39页
        2.4.1 血液样品总DNA的提取第38-39页
        2.4.2 血液样品SNP位点基因型测序第39页
    2.5 血液样品CRP含量测定第39-40页
    2.6 核酸-蛋白互作实验第40-45页
        2.6.1 细胞和蛋白的提取第40-41页
        2.6.2 BCA法测量蛋白浓度第41页
        2.6.3 探针制备第41-42页
        2.6.4 核酸-蛋白pull-down实验第42-44页
        2.6.5 考马斯亮蓝染色/银染实验第44页
        2.6.6 目的条带的胶内酶解与质谱分析第44-45页
    2.7 Apex1 作为转录因子的鉴定第45-51页
        2.7.1 WB定性定量鉴定pull-down产物第45-46页
        2.7.2 WEMSA试验第46-47页
        2.7.3 Apex1 高表达/敲低实验第47-48页
        2.7.4 Apex1 功能结构域突变试验第48-49页
        2.7.5 ChIP试验验证Apex1 在体内与rs3091244 不同等位亲和性第49-51页
        2.7.6 Co-IP试验第51页
    2.8 SNP与癌症风险分析第51-53页
        2.8.1 血浆水平CRP相关SNPs的连锁不平衡(LD)分析第51-52页
        2.8.2 CRP基因多样性与癌症风险的meta-analysis第52页
        2.8.3 数据分析第52-53页
第三章 结果与结论第53-102页
    3.1 CRP表达相关SNPs第53-56页
    3.2 不同SNPs次要等位对CRP血浆水平贡献不同第56-63页
        3.2.1 甘肃地区人群等位频率与亚洲人群等位频率相同第56-57页
        3.2.2 rs3091244 等位频率在全球的分布情况第57-58页
        3.2.3 血浆CRP相关SNPs能够影响CRP血浆水平第58-59页
        3.2.4 多态性基因次要等位对CRP血浆水平影响较大第59-61页
        3.2.5 SNPs不同基因型对血浆CRP水平影响程度不同第61-62页
        3.2.6 SNPs不同基因型组合对CRP血浆水平影响差异较大第62-63页
    3.3 转录因子Apex1 能够影响CRP的表达调控第63-76页
        3.3.1 rs3091244 次要等位转录活性不同第63-65页
        3.3.2 转录因子Apex1 的发现第65-66页
        3.3.3 Apex1 高表达/敲低影响CRP表达水平第66-71页
        3.3.4 Apex1 能够影响rs3091244 不同等位转录活性第71-73页
        3.3.5 Apex1 发挥转录因子作用并不依赖其氧化还原结构域、内切酶结构域以及AP位点识别结构域第73-76页
    3.4 Apex1 通过对rs3091244 结合偏向性影响CRP表达第76-81页
        3.4.1 体外实验证明Apex1对rs3091244 三种等位结合具有偏向性第76-78页
        3.4.2 在体条件下Apex1对rs3091244 三种等位亲和力不同第78-81页
    3.5 Apex1 发挥负调控因子作用不依赖其他转录因子第81-82页
    3.6 癌症病人血浆CRP水平与SNPs基因型关系第82-91页
        3.6.1 癌症病人血浆CRP水平升高第83-89页
        3.6.2 癌症病人血浆CRP水平与SNPs基因型关联减弱第89-91页
    3.7 CRP相关SNPs与总体癌症发病风险无关第91-93页
    3.8 CRP相关SNPs与特定类型癌症发病风险无关第93-96页
    3.9 Meta-analysis证实SNPs与癌症风险无关第96-99页
    3.10 讨论与主要结论第99-102页
参考文献第102-115页
在学期间研究成果第115-116页
致谢第116页

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