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海洋细菌Pseudoalteromonas sp.SM0524分泌的褐藻酸裂解酶的研究

摘要第1-14页
Abstract第14-19页
符号说明及缩写词第19-20页
第一章 研究背景和立题依据第20-42页
   ·研究背景第20-40页
     ·褐藻酸第20-25页
       ·褐藻酸来源与结构第20-22页
       ·褐藻酸的理化性质第22-23页
       ·褐藻酸的应用第23-25页
     ·褐藻酸裂解酶第25-40页
       ·分类第25-29页
       ·作用机制第29页
       ·来源与酶学性质第29-33页
       ·基因工程研究第33-34页
       ·结构与功能分析第34-38页
       ·生物学功能与应用第38-40页
   ·题依据与研究内容第40-42页
     ·立题依据第40页
     ·研究内容第40-42页
第二章 褐藻酸裂解酶产生菌株的筛选与鉴定第42-56页
   ·引言第42页
   ·材料与方法第42-49页
     ·材料第42-44页
       ·样品第42页
       ·菌株与质粒第42-43页
       ·培养基第43页
       ·主要试剂第43-44页
       ·主要仪器第44页
       ·数据库及软件第44页
     ·方法第44-49页
       ·样品处理第44-45页
       ·菌株筛选方法第45页
       ·酶活测定第45-46页
       ·菌株形态与生理特征分析第46页
       ·16S rDNA克隆与测序第46-49页
   ·结果与分析第49-53页
     ·菌株筛选第49-51页
     ·菌株SM0524的表型和生理特征第51页
       ·菌株SM0524的形态特征第51页
       ·菌株SM0524的碳源利用情况第51页
     ·菌株SM0524的16S rDNA克隆与序列分析以及菌株种属鉴定第51-53页
   ·讨论第53-56页
第三章 Pseudoalteromonas sp.SM0524分泌的褐藻酸裂解酶的分离纯化和性质研究第56-73页
   ·引言第56页
   ·材料与方法第56-60页
     ·材料第56-58页
       ·菌株与培养基第56-57页
       ·主要试剂耗材第57页
       ·主要仪器第57-58页
     ·实验方法第58-60页
       ·酶活测定第58页
       ·总蛋白含量测定第58页
       ·凝胶电泳SDS-PAGE第58页
       ·酶的分离纯化第58-59页
       ·酶学性质研究第59-60页
       ·酶解产物分析第60页
   ·结果与分析第60-70页
     ·P.sp.SM0524分泌的褐藻酸裂解酶的分离纯化第60-63页
       ·离子交换层析第60-62页
       ·凝胶过滤层析第62-63页
       ·褐藻酸裂解酶的纯度和得率分析第63页
     ·P.sp.SM0524分泌的褐藻酸裂解酶的酶学性质第63-68页
       ·最适酶活温度和酶的热稳定性第63页
       ·最适酶活pH和pH稳定性第63-65页
       ·金属离子对酶活的影响第65页
       ·NaCl对酶活的影响第65-66页
       ·底物特异性研究第66-68页
     ·酶解产物分析第68-70页
   ·讨论第70-73页
第四章 Pseudoalteromonas sp.SM0524褐藻酸裂解酶基因克隆和序列分析第73-86页
   ·引言第73页
   ·材料与方法第73-77页
     ·菌株与质粒第73-74页
     ·主要试剂与仪器第74页
     ·数据库及分析软件第74页
     ·褐藻酸裂解酶N端测序第74页
     ·褐藻酸裂解酶的MALDI-TOF-MS分析第74-75页
     ·基因克隆第75-76页
       ·引物设计第75页
       ·总DNA提取第75页
       ·酶基因克隆第75页
       ·PCR产物的回收纯化第75页
       ·E.coli DH5α感受态细胞的制备第75-76页
       ·质粒转化E.coli DH5α第76页
       ·转化子筛选第76页
       ·基因测序第76页
     ·褐藻酸裂解酶序列分析和同源模建第76-77页
   ·结果与分析第77-84页
     ·褐藻酸裂解酶的N端测序第77页
     ·褐藻酸裂解酶的MALDI-TOF-MS分析第77-78页
     ·P.sp.SM0524的褐藻酸裂解酶基因克隆第78-80页
       ·引物设计第78页
       ·基因克隆第78-80页
     ·P.sp.SM0524的褐藻酸裂解酶基因序列分析第80-84页
       ·褐藻酸裂解酶基因aly-SJ01序列分析第80-82页
       ·褐藻酸裂解酶ALY-SJ01的同源模建与结构分析第82页
       ·褐藻酸裂解酶基因aly-SJ02序列分析第82-84页
       ·褐藻酸裂解酶ALY-SJ02的同源模建与结构分析第84页
   ·讨论第84-86页
第五章 Pseudoalteromonas sp.SM0524褐藻酸裂解酶基因aly-SJ01的重组表达和重组酶性质研究第86-101页
   ·引言第86-87页
   ·材料和方法第87-90页
     ·菌株和质粒第87页
     ·培养基第87页
     ·主要试剂第87页
     ·主要仪器第87页
     ·aly-SJ01在E.coli中的表达第87-90页
       ·表达引物设计第87-88页
       ·PCR扩增目的基因第88页
       ·表达载体的构建第88-89页
       ·E.coli BL21(DE3)异源表达aly-SJ01基因第89页
       ·重组酶的诱导表达与纯化第89-90页
     ·Aly-SJ01重组酶性质研究第90页
     ·Aly-SJ01酶解产物分析第90页
   ·结果与分析第90-99页
     ·褐藻酸裂解酶Aly-SJ01的重组表达和纯化第90-94页
       ·无信号肽序列的aly-SJ01基因的克隆和序列验证第90页
       ·表达载体的构建第90-92页
       ·aly-SJ01基因的异源表达第92页
       ·Aly-SJ01重组酶的纯化第92-94页
     ·Aly-SJ01重组酶性质研究第94-98页
       ·最适温度和p H第94页
       ·Aly-SJ01的热稳定性第94-95页
       ·金属离子、SDS和EDTA对Aly-SJ01酶活的影响第95页
       ·NaCl浓度对Aly-SJ01活性的影响第95页
       ·Aly-SJ01的底物特异性分析第95-97页
       ·Aly-SJ01的催化动力学参数第97-98页
       ·Aly-SJ01的变性温度第98页
     ·Aly-SJ01酶解产物分析第98-99页
   ·讨论第99-101页
第六章 Pseudoalteromonas sp.SM0524的褐藻酸裂解酶基因aly-SJ02的重组表达和重组酶性质研究第101-109页
   ·引言第101页
   ·材料和方法第101-105页
     ·主要试剂和仪器第101页
     ·菌株和质粒第101页
     ·培养基第101页
     ·褐藻酸裂解酶基因aly-SJ02在大肠杆菌中的表达第101-103页
       ·表达引物设计第101-102页
       ·PCR扩增目的基因第102页
       ·表达载体的构建第102-103页
       ·E coli BL21(DE3)异源表达aly-SJ02基因第103页
     ·重组酶Aly-SJ02的诱导表达第103页
     ·重组酶Aly-SJ02的纯化第103-104页
       ·离子交换层析第103-104页
       ·镍亲和层析第104页
     ·Aly-SJ02的酶学性质第104-105页
       ·pH对重组酶Aly-SJ02活性的影响第104页
       ·温度对重组酶Aly-SJ02活性的影响第104页
       ·金属离子和蛋白酶抑制剂对重组酶Aly-SJ02活性的影响第104-105页
   ·结果与分析第105-107页
     ·aly-SJ02在E.coli BL21(DE3)中的表达第105页
     ·重组酶Aly-SJ02的纯化第105页
     ·重组表达的Aly-SJ02的酶学性质第105-107页
       ·最适反应pH第105-106页
       ·最适酶活温度第106-107页
   ·讨论第107-109页
全文总结与展望第109-111页
参考文献第111-123页
攻读学位期间发表的学术论文目录第123-124页
致谢第124-125页
附录第125-140页
学位论文评阅及答辩情况表第140页

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