基于拓扑相似性与语义相似性的疾病基因预测研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-18页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第12-13页 |
| 1.2 疾病基因识别国内外研究现状 | 第13-16页 |
| 1.3 本文主要研究内容和安排 | 第16-18页 |
| 第2章 疾病基因识别基础 | 第18-29页 |
| 2.1 数据源的阐述 | 第18-23页 |
| 2.1.1 蛋白质互作网络 | 第18-19页 |
| 2.1.2 OMIM数据库 | 第19-20页 |
| 2.1.3 GO数据库 | 第20-22页 |
| 2.1.4 表型网络数据 | 第22-23页 |
| 2.2 拓扑相似性概念 | 第23-24页 |
| 2.3 语义相似性 | 第24-25页 |
| 2.4 随机游走算法 | 第25-28页 |
| 2.5 小结 | 第28-29页 |
| 第3章 蛋白质网络中的疾病基因预测 | 第29-33页 |
| 3.1 利用HRSS算法进行语义相似性的计算 | 第29-30页 |
| 3.2 利用随机游走算法进行拓扑相似性的计算 | 第30-31页 |
| 3.3 蛋白质网络中的基因排序算法流程 | 第31-32页 |
| 3.4 小结 | 第32-33页 |
| 第4章 异构网络中的疾病基因预测 | 第33-37页 |
| 4.1 异构网络的搭建 | 第33-34页 |
| 4.2 利用线性相关来衡量扩散谱的相似性 | 第34-35页 |
| 4.3 异构网络中的基因排序算法流程 | 第35-36页 |
| 4.4 小结 | 第36-37页 |
| 第5章 案例分析 | 第37-44页 |
| 5.1 实验数据集 | 第37页 |
| 5.2 实验结果及分析 | 第37-41页 |
| 5.2.1 交叉验证 | 第37-38页 |
| 5.2.2 与其它方法的比较 | 第38-39页 |
| 5.2.3 参数影响 | 第39-41页 |
| 5.3 案例分析 | 第41-43页 |
| 5.3.1 阿尔茨海默病 | 第42页 |
| 5.3.2 乳腺癌 | 第42-43页 |
| 5.3.3 糖尿病 | 第43页 |
| 5.4 小结 | 第43-44页 |
| 结论与展望 | 第44-46页 |
| 参考文献 | 第46-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 附录 A(攻读学位期间所发表的学术论文目录) | 第52页 |
