| 中文摘要 | 第8-11页 |
| 英文摘要 | 第11-14页 |
| 第一章 背景知识 | 第15-25页 |
| §1.1 癌症基因组学 | 第15-19页 |
| §1.2 体细胞突变的检测与分析 | 第19-22页 |
| §1.3 信号通路预测问题 | 第22-25页 |
| 第二章 信号通路算法的研究现状 | 第25-39页 |
| §2.1 从头预测算法 | 第25-29页 |
| §2.2 结合蛋白相互作用网络的预测算法 | 第29-36页 |
| §2.3 结合其它组学数据的预测算法 | 第36-37页 |
| §2.4 分析与总结 | 第37-39页 |
| 第三章 CovEx算法与实验结果分析 | 第39-73页 |
| §3.1 CovEx算法简介 | 第39-41页 |
| §3.2 CovEx算法 | 第41-49页 |
| §3.3 CovEx修正结果的一致性方法 | 第49-52页 |
| §3.4 CovEx算法的创新点 | 第52-54页 |
| §3.5 CovEx算法的实验结果分析 | 第54-73页 |
| 第四章 UniCovEx算法与实验结果分析 | 第73-97页 |
| §4.1 UniCovEx算法简介 | 第73-76页 |
| §4.2 UniCovEx算法 | 第76-82页 |
| §4.3 UniCovEx修正结果的一致性方法 | 第82-83页 |
| §4.4 UniCovEx算法的创新点 | 第83-85页 |
| §4.5 UniCovEx算法的实验结果分析 | 第85-97页 |
| 第五章 算法分析与拓展 | 第97-115页 |
| §5.1 CovEx算法、UniCovEx算法与其它算法的比较分析 | 第97-103页 |
| §5.2 CovEx算法与UniCovEx算法的不足及部分改进策略 | 第103-108页 |
| §5.3 不同癌症类型公共驱动信号通路及癌症相关性研究 | 第108-112页 |
| §5.4 今后的研究方向与全文总结 | 第112-115页 |
| 参考文献 | 第115-123页 |
| 致谢 | 第123-125页 |
| 攻读博士学位期间完成论文情况 | 第125-126页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第126页 |
