| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 缩写和符号清单 | 第13-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-20页 |
| 1.1 油茶 | 第14-15页 |
| 1.1.1 油茶的分布及栽培历史 | 第14页 |
| 1.1.2 油茶的种植价值 | 第14-15页 |
| 1.2 油茶炭疽病病害简介 | 第15-16页 |
| 1.3 果实生长发育中的主要生理变化 | 第16-17页 |
| 1.4 植物miRNA概况 | 第17-20页 |
| 1.4.1 植物miRNA | 第17-18页 |
| 1.4.2 植物miRNA的研究 | 第18页 |
| 1.4.2.1 植物miRNA的生物合成 | 第18页 |
| 1.4.2.2 植物miRNA的调控机理 | 第18页 |
| 1.4.3 植物miRNA的鉴定与靶基因预测 | 第18-20页 |
| 2 引言 | 第20-22页 |
| 2.1 研究背景 | 第20-21页 |
| 2.2 主要研究内容、目的和意义 | 第21-22页 |
| 2.2.1 主要研究内容 | 第21页 |
| 2.2.2 研究目的 | 第21页 |
| 2.2.3 研究意义 | 第21-22页 |
| 3 油茶抗炭疽病相关microRNAs和靶基因挖掘 | 第22-41页 |
| 3.1 材料与方法 | 第22-24页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第22页 |
| 3.1.2 实验主要用材 | 第22页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第22-24页 |
| 3.1.3.1 RNA文库建立及测序 | 第22-23页 |
| 3.1.3.2 测序数据生物学分析 | 第23页 |
| 3.1.3.3 保守miRNAs鉴定 | 第23页 |
| 3.1.3.4 差异表达miRNAs的筛选 | 第23-24页 |
| 3.2 结果分析 | 第24-39页 |
| 3.2.1 测序数据产出总览 | 第24-25页 |
| 3.2.2 小RNA测序数据统计 | 第25-26页 |
| 3.2.3 保守miRNAs的筛选 | 第26-28页 |
| 3.2.4 油茶品种中novel miRNAs的筛选 | 第28页 |
| 3.2.5 差异表达miRNAs筛选 | 第28-29页 |
| 3.2.6 miRNAs差异表达分析 | 第29-30页 |
| 3.2.7 差异表达miRNAs靶基因预测及GO、KEGG功能富集分析 | 第30-37页 |
| 3.2.8 油茶生长发育过程中抗病相关miRNAs表达分析 | 第37-38页 |
| 3.2.9 油茶miRNAs进化与碱基偏好分析 | 第38-39页 |
| 3.3 讨论 | 第39-41页 |
| 3.3.1 油茶基因组中的保守miRNAs鉴定及新miRNAs预测 | 第39-40页 |
| 3.3.2 油茶miRNAs靶基因预测 | 第40-41页 |
| 4 不同抗病性油茶果实和叶片内含物比较研究 | 第41-51页 |
| 4.1 材料与方法 | 第41-44页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第41页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第41页 |
| 4.1.3 实验药品 | 第41页 |
| 4.1.4 测定方法 | 第41-44页 |
| 4.1.4.1 组织蛋白测定 | 第41-42页 |
| 4.1.4.2 可溶性糖含量测定 | 第42页 |
| 4.1.4.3 总酚含量测定 | 第42-43页 |
| 4.1.4.4 原花青素含量测定 | 第43-44页 |
| 4.1.4.5 苯丙氨酸解氨酶活性测定 | 第44页 |
| 4.2 结果与分析 | 第44-48页 |
| 4.2.1 组织蛋白含量变化 | 第44-45页 |
| 4.2.2 可溶性糖含量变化 | 第45-46页 |
| 4.2.3 总酚含量变化 | 第46-47页 |
| 4.2.4 原花青素含量变化 | 第47页 |
| 4.2.5 苯丙氨酸解氨酶活性变化 | 第47-48页 |
| 4.3 讨论 | 第48-51页 |
| 4.3.1 不同抗病油茶品种果实和叶片内含物的比较研究 | 第48-50页 |
| 4.3.2 不同油茶品种果实和叶片酶活性的比较研究 | 第50-51页 |
| 5 总结 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 附录 | 第58-103页 |
| 附表一：过滤后的油茶clean数据的总数及种数长度统计 | 第58页 |
| 附表二：油茶保守miRNAs的分布 | 第58-69页 |
| 附表三：实验中预测到的novel miRNAs | 第69-71页 |
| 附表四：不同油茶品种中共同检出miRNAs的个数以及差异miRNAs个数 | 第71-72页 |
| 附表五：油茶差异miRNAs上下调频数结果统计 | 第72-77页 |
| 附表六：显著差异miRNAs靶基因预测 | 第77-101页 |
| 附表七：不同品种油茶果实和叶片内含物及酶活性的比较 | 第101-103页 |
| 作者简介 | 第103页 |
