| 摘要 | 第7-8页 |
| 1 前言 | 第8-18页 |
| 1.1 尖孢镰刀菌及其致病机理 | 第8-9页 |
| 1.2 万寿菊抑菌素 | 第9-10页 |
| 1.3 生物信息学分析应用 | 第10-13页 |
| 1.3.1 转录组学 | 第10页 |
| 1.3.2 转录组测序技术 | 第10-12页 |
| 1.3.3 高通量测序技术的研究现况 | 第12页 |
| 1.3.4 真菌转录组学的研究意义 | 第12-13页 |
| 1.4 细胞膜转运蛋白 | 第13-17页 |
| 1.4.1 膜蛋白 | 第13页 |
| 1.4.2 MFS家族转运蛋白 | 第13-16页 |
| 1.4.3 L-若藻糖 | 第16-17页 |
| 1.4.4 岩藻糖质子同向转运蛋白家族 | 第17页 |
| 1.5 本课题研究目的及意义 | 第17-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-24页 |
| 2.1 材料、仪器与数据库 | 第18-19页 |
| 2.1.1 材料 | 第18页 |
| 2.1.2 常用生物信息网 | 第18页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第18-19页 |
| 2.1.4 试剂 | 第19页 |
| 2.2 方法 | 第19-24页 |
| 2.2.1 尖孢镰刀菌培养基的配置 | 第19页 |
| 2.2.2 尖孢镰刀菌及突变菌株的制备 | 第19页 |
| 2.2.3 尖孢镰刀菌及其突变菌株RNA提取及测序 | 第19-20页 |
| 2.2.4 测序 | 第20页 |
| 2.2.5 尖孢镰刀菌及其突变菌株的转录组测序数据分析比较 | 第20-21页 |
| 2.2.5.1 原始数据整理与过滤 | 第20页 |
| 2.2.5.2 Unigene表达量及表达差异分析 | 第20-21页 |
| 2.2.6 cDNA制备 | 第21页 |
| 2.2.7 FucP基因克隆 | 第21-22页 |
| 2.2.8 克隆产物测序 | 第22-23页 |
| 2.2.9 测序结果与生物信息学分析 | 第23页 |
| 2.2.9.1 ORF预测与验证 | 第23页 |
| 2.2.9.2 蛋白质二级结构预测 | 第23页 |
| 2.2.9.3 蛋白质三级结构预测 | 第23页 |
| 2.2.9.4 蛋白质理化性质的预测 | 第23页 |
| 2.2.10 条件限制培养基制备及菌株培养 | 第23-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-52页 |
| 3.1 尖孢镰刀菌野生型和突变型转录组差异分析 | 第24-29页 |
| 3.1.1 RNA质量检测 | 第24-25页 |
| 3.1.2 转录组测序结果与分析 | 第25-29页 |
| 3.1.2.1 拼接数据统计分析 | 第25页 |
| 3.1.2.2 转录组eggNOG分析 | 第25-27页 |
| 3.1.2.3 表达差异 | 第27-28页 |
| 3.1.2.4 GO表达分析 | 第28页 |
| 3.1.2.5 KO分析 | 第28-29页 |
| 3.2 差异基因Locus_18025与Locus_3324的确认 | 第29-33页 |
| 3.2.1 Locus_18025与Locus_3324的差异表达 | 第29-30页 |
| 3.2.2 Blastx比对结果 | 第30-33页 |
| 3.3 FucP1与FucP2基因蛋白编码区的克隆及序列研究 | 第33-41页 |
| 3.3.1 FucP1与FucP2基因蛋白编码区的克隆 | 第33-34页 |
| 3.3.2 野生型与突变型FucP1、FucP2基因蛋白编码区序列差异分析 | 第34-41页 |
| 3.3.2.1 FucP 1蛋白编码区序列测序结果与分析 | 第34-37页 |
| 3.3.2.2 FucP 2蛋白编码区序列测序结果与分析 | 第37-41页 |
| 3.4 FucP1与FucP2蛋白结构预测 | 第41-47页 |
| 3.4.1 FucP蛋白基因ORF区与蛋白质一级结构预测 | 第41-42页 |
| 3.4.1.1 FucP1蛋白基因ORF区预测 | 第41页 |
| 3.4.1.2 FucP1蛋白一级结构预测 | 第41-42页 |
| 3.4.1.3 FucP2 ORF区预测 | 第42页 |
| 3.4.1.4 FucP2蛋白一级结构预测 | 第42页 |
| 3.4.2 FucP蛋白二级结构预测 | 第42-45页 |
| 3.4.2.1 FucP1蛋白基因二级结构预测 | 第43-44页 |
| 3.4.2.2 FucP2蛋白二级结构预测 | 第44-45页 |
| 3.4.3 FucP蛋白三级结构预测 | 第45-46页 |
| 3.4.3.1 FucP1蛋白三级结构预测 | 第45-46页 |
| 3.4.3.2 FucP2蛋白基因三级结构预测 | 第46页 |
| 3.4.4 FucP蛋白的理化性质 | 第46-47页 |
| 3.5 FucP1与FucP2基因表达差异与岩藻糖利用的关系 | 第47-52页 |
| 3.5.1 尖孢镰刀菌野生型与突变型的菌落形态 | 第47页 |
| 3.5.2 尖孢镰刀菌野生型菌落生长情况 | 第47-49页 |
| 3.5.3 尖孢镰刀菌突变型菌落生长情况 | 第49-50页 |
| 3.5.4 野生型与突变型二者差异 | 第50-52页 |
| 4 讨论 | 第52-55页 |
| 4.1 尖孢镰刀菌野生型菌株、突变型菌株转录组基因表达差异结果 | 第52-53页 |
| 4.2 FucP1、FucP2的发现与验证 | 第53页 |
| 4.3 FucP1与FucP2表达差异与岩藻糖利用的关系 | 第53-55页 |
| 5 结论 | 第55-56页 |
| 5.1 主要研究成果 | 第55页 |
| 5.2 本研究总结和未来工作展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| Abstract | 第61页 |
| 致谢 | 第63页 |
