基于COI和微卫星的中国沼泽山雀种群分化和遗传多样性研究
摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
第1章 前言 | 第8-18页 |
1.1 沼泽山雀研究进展 | 第8-9页 |
1.1.1 沼泽山雀概述 | 第8页 |
1.1.2 地理分布及亚种分化 | 第8-9页 |
1.1.3 生态习性 | 第9页 |
1.1.4 沼泽山雀研究现状 | 第9页 |
1.2 遗传多样性研究 | 第9-13页 |
1.2.1 群体遗传学和遗传多样性及其研究意义 | 第9-10页 |
1.2.2 遗传多样性的研究方法及应用 | 第10-13页 |
1.3 微卫星分子标记技术 | 第13-15页 |
1.3.1 微卫星标记 | 第13-14页 |
1.3.2 微卫星标记的优点及不足 | 第14-15页 |
1.4 COI基因 | 第15-17页 |
1.4.1 COI基因的应用 | 第16页 |
1.4.2 DNA条形码 | 第16-17页 |
1.5 研究目的与意义 | 第17-18页 |
第2章 材料与方法 | 第18-28页 |
2.1 实验材料、仪器与试剂 | 第18-22页 |
2.1.1 实验标本的采集、保存与鉴定 | 第18-20页 |
2.1.2 实验仪器 | 第20-21页 |
2.1.3 实验试剂 | 第21-22页 |
2.2 实验方法 | 第22-25页 |
2.2.1 总DNA提取 | 第22-23页 |
2.2.2 PCR扩增、测序及序列拼接 | 第23页 |
2.2.3 沼泽山雀的微卫星分子标记筛选和制备 | 第23-24页 |
2.2.4 微卫星PCR反应程序 | 第24-25页 |
2.2.5 基因分型 | 第25页 |
2.3 数据分析 | 第25-28页 |
2.3.1 COI基因遗传多样性分析 | 第25页 |
2.3.2 系统发育树分析 | 第25-26页 |
2.3.3 微卫星的遗传多样性分析 | 第26-28页 |
第3章 实验结果 | 第28-38页 |
3.1 沼泽山雀COI提取结果 | 第28页 |
3.2 线粒体COI基因结果 | 第28-35页 |
3.2.1 线粒体COI基因扩增结果 | 第28页 |
3.2.2 测序结果 | 第28-29页 |
3.2.3 COI基因遗传多样性分析结果 | 第29-35页 |
3.3 微卫星分析 | 第35-38页 |
3.3.1 基因分型结果 | 第35-36页 |
3.3.2 微卫星遗传多样性结果 | 第36页 |
3.3.3 遗传距离和遗传相似性 | 第36-38页 |
第4章 讨论 | 第38-44页 |
4.1 COI基因碱基组成 | 第38页 |
4.2 COI基因的多样性分析 | 第38-39页 |
4.3 系统发生树 | 第39-40页 |
4.4 中性检验 | 第40页 |
4.5 微卫星分析 | 第40-42页 |
4.6 Hardy-Weinberg | 第42-44页 |
总结 | 第44-46页 |
展望 | 第46-48页 |
参考文献 | 第48-58页 |
致谢 | 第58-60页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第60页 |