| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第1章 绪论 | 第11-27页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第11-12页 |
| 1.2 碳纳米管的结构、性质、生物修饰及应用 | 第12-19页 |
| 1.2.1 碳纳米管简介 | 第12-13页 |
| 1.2.2 碳纳米管的性能 | 第13-14页 |
| 1.2.3 碳纳米管的修饰 | 第14-17页 |
| 1.2.4 碳纳米管在药物输运中的应用 | 第17-19页 |
| 1.3 石墨烯的结构、性质及应用 | 第19-22页 |
| 1.3.1 石墨烯简介 | 第19-20页 |
| 1.3.2 石墨烯的性能 | 第20-21页 |
| 1.3.3 石墨烯的应用 | 第21-22页 |
| 1.4 本论文的研究工作 | 第22-23页 |
| 参考文献 | 第23-27页 |
| 第2章 分子动力学模拟基本理论 | 第27-37页 |
| 2.1 分子动力学模拟的概况 | 第27-28页 |
| 2.2 分子动力学基础知识 | 第28-31页 |
| 2.2.1 分子力场 | 第28-29页 |
| 2.2.2 周期性边界条件 | 第29-30页 |
| 2.2.3 统计系综 | 第30-31页 |
| 2.3 分子动力学模拟的基本步骤 | 第31-33页 |
| 2.3.1 模型的建立 | 第31-32页 |
| 2.3.2 给定初始条件 | 第32页 |
| 2.3.3 趋于平衡的计算过程 | 第32页 |
| 2.3.4 物理量的统计及分析 | 第32-33页 |
| 2.4 分子动力学软件 NAMD | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-37页 |
| 第3章 基于碳纳米管的非共价修饰多肽分子设计 | 第37-61页 |
| 3.1 引言 | 第37-39页 |
| 3.2 模型构建和模拟方法 | 第39-43页 |
| 3.2.1 模型构建 | 第39-40页 |
| 3.2.2 MD 模拟 | 第40-41页 |
| 3.2.3 功能化多肽分子的设计 | 第41-42页 |
| 3.2.4 分析方法 | 第42-43页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第43-55页 |
| 3.3.1 平衡态模拟 | 第43-44页 |
| 3.3.2 有效吸附 | 第44-45页 |
| 3.3.3 吸附残基 | 第45-46页 |
| 3.3.4 蛋白质的结构变化 | 第46-48页 |
| 3.3.5 蛋白质吸附动力学 | 第48-50页 |
| 3.3.6 多肽分子的设计 | 第50-52页 |
| 3.3.7 多肽分子的优化 | 第52-55页 |
| 3.4 小结 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 第4章 20 种由单一氨基酸组成的多肽分子在石墨烯表面的吸附动力学研究 | 第61-87页 |
| 4.1 引言 | 第61-62页 |
| 4.2 模型构建与模拟方法 | 第62-64页 |
| 4.2.1 模型构建 | 第62页 |
| 4.2.2 模拟细节 | 第62-63页 |
| 4.2.3 分析方法 | 第63-64页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第64-82页 |
| 4.3.1 碱性氨基酸 | 第64-69页 |
| 4.3.2 酸性氨基酸 | 第69-72页 |
| 4.3.3 非极性氨基酸 | 第72-77页 |
| 4.3.4 极性氨基酸 | 第77-82页 |
| 4.4 小结 | 第82-84页 |
| 参考文献 | 第84-87页 |
| 第5章 蛋白质在石墨烯和碳纳米管表面的吸附比较 | 第87-111页 |
| 5.1 引言 | 第87-88页 |
| 5.2 模型构建与模拟方法 | 第88-89页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第89-106页 |
| 5.3.1 蛋白质在石墨烯表面的吸附 | 第89-98页 |
| 5.3.2 碳材料曲率对吸附的影响 | 第98-103页 |
| 5.3.3 蛋白质结构对吸附的影响 | 第103-106页 |
| 5.4 小结 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-111页 |
| 致谢 | 第111-113页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第113-114页 |