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部分雀形目鸟类的CoⅠ和Cytb基因序列测定及其系统发育研究

摘要第1-7页
Abstract第7-11页
1 文献综述第11-19页
   ·分子系统学概述第11-13页
   ·线粒体DNA在鸟类分子系统学研究中的应用第13-16页
     ·鸟类线粒体基因组结构特点第13-14页
     ·鸟类细胞色素c氧化酶亚单元Ⅰ基因第14-15页
     ·鸟类细胞色素b基因第15-16页
   ·雀形目鸟类分类及分子系统学研究现状第16-18页
   ·研究内容、目的和意义第18-19页
2 材料与方法第19-31页
   ·试验材料第19-21页
   ·主要仪器设备第21-22页
   ·主要试剂及其配制第22-24页
   ·基因组DNA的提取与检测第24-25页
     ·基因组DNA的提取第24页
     ·DNA质量的检测第24-25页
   ·PCR扩增、检测与回收第25-26页
     ·扩增引物第25页
     ·PCR反应主要体系组成及扩增程序第25-26页
     ·扩增产物的检测第26页
     ·PCR产物的回收与纯化第26页
   ·线粒体基因的克隆第26-29页
     ·感受态细胞的制备第27页
     ·感受态细胞效价测定第27-28页
     ·连接反应第28页
     ·转化步骤第28-29页
     ·重组质粒的PCR鉴定第29页
   ·测序第29页
   ·数据处理与分析第29-31页
     ·序列编辑、校对及序列比对第29-30页
     ·序列特征分析第30页
     ·数据组系统发育信号检验第30页
     ·系统发育树的构建第30-31页
       ·距离法(Neighbor-joining,NJ)第31页
       ·最大简约法(Maximum-Parsimony,MP)第31页
       ·极大似然法(maximum-likelihood,ML)第31页
       ·贝叶斯系统发育推论法(Bayesian,BI)第31页
3 结果与分析第31-42页
   ·CoⅠ& CYTB序列特征第31-35页
     ·序列组成分析第32-33页
     ·遗传距离第33-35页
   ·分子系统进化树的构建与分析第35-42页
     ·两基因间不一致水平检验第35页
     ·部分雀形目鸟类分子系统发育树的构建与分析第35-38页
     ·鸫亚科分子系统发育树的构建与分析第38-40页
     ·画眉亚科分子系统发育树的构建与分析第40-42页
4 讨论第42-48页
   ·雀形目鸣禽鸟类的系统发育关系第42-46页
     ·莺总科(Sylvioidea)第43页
     ·鸫总科(Muscicapoidea)第43-44页
     ·雀总科(Pasesoridea)第44页
     ·鸫亚科的系统发育关系及其分类地位第44-45页
       ·鸫亚科各属间的系统发育关系第44页
       ·宝兴歌鸫的分类地位第44-45页
     ·画眉亚科的系统发育关系及其分类地位第45-46页
       ·鸦雀类的系统发育关系及分类地位第45页
       ·暗绿绣眼鸟与凤鹛属种的系统发育关系及分类地位第45页
       ·红头穗鹛与钩嘴鹛属种的系统发育关系第45页
       ·希鹛属的系统发育关系及分类地位第45-46页
       ·鳞胸鹪鹛、鵙鹛和褐胁雀鹛的分类问题第46页
   ·雀形目鸟类的单系性第46-47页
   ·关于Co Ⅰ基因在鸟类系统发育关系研究中的应用第47-48页
5 结论第48-50页
参考文献第50-56页
致谢第56页

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