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小麦抗条锈病基因Yr26载体材料BAC文库构建及转录组测序

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 文献综述第14-33页
    1.1 小麦与条锈菌第14-17页
        1.1.1 小麦第14页
        1.1.2 小麦条锈病第14-17页
    1.2 抗条锈病基因Yr26及其在抗条锈病育种中的利用第17-20页
        1.2.1 Yr26基因的来源第17页
        1.2.2 Yr26及其等位基因的定位第17-18页
        1.2.3 Yr26基因在抗条锈病育种中的应用第18-20页
        1.2.4 对Yr26基因有毒性小种的出现及分布第20页
    1.3 细菌人工染色体基因组文库第20-26页
        1.3.1 DNA大片段插入文库的研究进展第21页
        1.3.2 小麦BAC文库研究进展第21-24页
        1.3.3 大片段DNA插入文库在小麦抗病基因图位克隆中的应用第24-26页
    1.4 转录组测序第26-31页
        1.4.1 转录组方法及简介第26-28页
        1.4.2 RNA测序平台第28-29页
        1.4.3 RNA-seq在小麦转录组研究中的应用第29-31页
    1.5 本研究的目的及意义第31-32页
    1.6 技术路线第32-33页
第二章 Yr26载体材料 92R137细菌人工染色体文库构建第33-43页
    2.1 材料与方法第33-37页
        2.1.1 植物材料与高分子量DNA制备第33-34页
        2.1.2 限制性酶切及DNA片段选择第34页
        2.1.3 连接载体第34-35页
        2.1.4 连接和细菌转化第35页
        2.1.5 检测插入DNA片段大小第35页
        2.1.6 碱裂解法提取质粒DNA第35-36页
        2.1.7 挑取阳性克隆第36页
        2.1.8 检测叶绿体污染第36页
        2.1.9 BAC克隆混池第36-37页
        2.1.10 用Yr26基因连锁的分子标记筛选BAC文库第37页
    2.2 结果第37-41页
        2.2.1 部分酶切实验及大片段DNA选择第37-38页
        2.2.2 BAC文库构建第38-40页
        2.2.3 BAC克隆混池以及Yr26连锁标记筛选阳性克隆第40-41页
    2.3 讨论第41-43页
第三章 Yr26基因介导的抗条锈病转录组测序第43-58页
    3.1 材料与方法第43-44页
        3.1.1 小麦材料与条锈菌第43页
        3.1.2 条锈菌接种及采样第43页
        3.1.3 RNA提取检测及RNA-seq测序第43页
        3.1.4 RNA-seq数据分析第43-44页
    3.2 结果第44-55页
        3.2.1 RNA-seq测序数据量及质控结果第44-46页
        3.2.2 比对到基因组的结果统计第46-47页
        3.2.3 基因表达量及差异基因分析第47-48页
        3.2.4 差异基因功能注释第48-49页
        3.2.5 差异基因介导的信号通路分析及趋势分析第49-55页
    3.3 讨论第55-57页
        3.3.1 条锈菌侵染对寄主光合作用的影响第55-56页
        3.3.2 病原菌侵染对寄主激素代谢的影响第56页
        3.3.3 病菌侵染介导的寄主防卫反应基因的差异表达第56-57页
    3.4 结论第57-58页
第四章 小麦抗条锈病已知基因对中国当前流行小种有效性分析第58-68页
    4.1 材料与方法第58-61页
        4.1.1 植物材料第58-59页
        4.1.2 病原菌第59-60页
        4.1.3 温室苗期分小种的抗条锈病鉴定第60页
        4.1.4 田间成株期人工接种病圃抗条锈病鉴定第60页
        4.1.5 天水条锈病自然发病圃抗病性鉴定第60-61页
        4.1.6 数据分析标准第61页
    4.2 实验结果分析第61-64页
        4.2.1 单个抗病基因有效性分析第64页
        4.2.2 含有多个基因组合的载体材料对条锈病的抗性评估第64页
    4.3 讨论第64-68页
        4.3.1 当前威胁我国小麦生产的条锈菌主要流行小种第64-65页
        4.3.2 已知抗条锈病基因的有效性第65-66页
        4.3.3 抗病基因持续有效利用的策略第66-68页
参考文献第68-83页
附录第83-84页
缩略词第84-86页
致谢第86-87页
作者简介第87页

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