| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-16页 |
| 1.1 木霉的分类 | 第11页 |
| 1.2 关于木霉的生物防治 | 第11-13页 |
| 1.3 基因组学和蛋白质组学及其木霉在抑菌机制研究中的应用 | 第13-15页 |
| 1.4 研究的目的与主要研究内容 | 第15-16页 |
| 第二章 钩状木霉生物防治菌株的筛选与鉴定 | 第16-43页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第16-17页 |
| 2.2 方法 | 第17-21页 |
| 2.2.1 生物防治活性菌株的筛选 | 第17-18页 |
| 2.2.2 生物防治活性菌株的形态和分子鉴定 | 第18页 |
| 2.2.3 钩状木霉活性菌株YYH13最适生长条件的筛选 | 第18-19页 |
| 2.2.4 钩状木霉YYH13代谢物抑制青枯雷尔氏菌的活性 | 第19页 |
| 2.2.5 钩状木霉YYH13发酵液抑制青枯雷尔氏菌的活性 | 第19-20页 |
| 2.2.6 田间抑菌试验 | 第20-21页 |
| 2.3 结果与分析 | 第21-39页 |
| 2.3.1 生物防治活性菌株的筛选 | 第21-22页 |
| 2.3.2 生物防治活性菌株的鉴定 | 第22-26页 |
| 2.3.3 钩状木霉YYH13最适生长条件 | 第26-28页 |
| 2.3.4 钩状木霉YYH13接种及其代谢物抑制青枯雷尔氏菌的活性比较 | 第28-30页 |
| 2.3.5 钩状木霉YYH1 3发酵液制备及其抑制青枯雷尔氏菌的活性比较 | 第30-32页 |
| 2.3.6 钩状木霉YYH13最适固体发酵条件 | 第32-37页 |
| 2.3.7 田间条件下钩状木霉YYH13的抑菌效果 | 第37-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-42页 |
| 2.4.1 生物防治效应差异显著的钩状木霉菌株的筛选 | 第39-40页 |
| 2.4.2 钩状木霉YYH13在田间条件下的抑菌作用 | 第40-42页 |
| 2.5 小结 | 第42-43页 |
| 第三章 钩状木霉胞外蛋白质鉴定与蛋白质组学分析 | 第43-59页 |
| 3.1 材料与试剂 | 第43页 |
| 3.2 方法 | 第43-45页 |
| 3.2.1 代谢液中胞外蛋白的提取 | 第44页 |
| 3.2.2 不同温度、pH值条件下胞外蛋白质抑菌活力的测定 | 第44页 |
| 3.2.3 胞外蛋白SDS-PAGE凝胶电泳分析 | 第44页 |
| 3.2.4 LC-MS/MS质谱分析 | 第44-45页 |
| 3.2.5 蛋白质组学分析 | 第45页 |
| 3.3 结果与分析 | 第45-57页 |
| 3.3.1 不同(NH4)2SO4饱和度提取胞外蛋白的抑菌活性 | 第45-46页 |
| 3.3.2 不同温度影响胞外蛋白抑菌活性比较 | 第46-47页 |
| 3.3.3 不同pH值影响胞外蛋白抑菌活性的比较 | 第47页 |
| 3.3.4 SDS-PAGE凝胶电泳分析 | 第47-48页 |
| 3.3.5 钩状木霉胞外蛋白质的质谱鉴定 | 第48-52页 |
| 3.3.6 差异蛋白的相关生物信息学分析 | 第52-57页 |
| 3.4 讨论 | 第57-58页 |
| 3.4.1 钩状木霉胞外蛋白质的分离与鉴定 | 第57页 |
| 3.4.2 钩状木霉胞外蛋白质的活性分析 | 第57-58页 |
| 3.5 小结 | 第58-59页 |
| 第四章 钩状木霉菌YYH13和YYH16比较基因组学研究 | 第59-90页 |
| 4.1 材料 | 第59页 |
| 4.2 方法 | 第59-65页 |
| 4.2.1 Illumina测序实验流程 | 第59-61页 |
| 4.2.2 17-K-mer分析以及基因组大小估计 | 第61-63页 |
| 4.2.3 基因组组装 | 第63-64页 |
| 4.2.4 基因功能注释 | 第64页 |
| 4.2.5 突变预测及注释结果统计 | 第64-65页 |
| 4.2.6 比较基因组分析 | 第65页 |
| 4.3 结果与分析 | 第65-86页 |
| 4.3.1 基因组测序数据统计分析 | 第65-69页 |
| 4.3.2 YYH13和YYH16测序信息及数据量比较 | 第69-71页 |
| 4.3.3 K-mer数据统计分析 | 第71-73页 |
| 4.3.4 基因组组装分析 | 第73-74页 |
| 4.3.5 基因组组装质量评估 | 第74-75页 |
| 4.3.6 基因功能注释分析 | 第75-78页 |
| 4.3.7 突变预测与注释 | 第78-80页 |
| 4.3.8 基因组共线性分析 | 第80-81页 |
| 4.3.9 木霉基因家族收缩与扩张的差异比较 | 第81-83页 |
| 4.3.10 基因家族酶类比较 | 第83-85页 |
| 4.3.11 与生物防治相关基因的预测 | 第85-86页 |
| 4.4 讨论 | 第86-89页 |
| 4.4.1 关于基因组数据杂和度分析 | 第86-87页 |
| 4.4.2 关于钩状木霉基因组测序与组装的策略流程 | 第87-88页 |
| 4.4.3 关于基因组突变预测分析 | 第88页 |
| 4.4.4 关于生物防治相关基因的预测 | 第88-89页 |
| 4.5 小结 | 第89-90页 |
| 第五章 钩状木霉生物防治候选功能基因的验证 | 第90-109页 |
| 5.1 材料与试剂 | 第90页 |
| 5.2 方法 | 第90-94页 |
| 5.2.1 DNA qRT-PCR反应 | 第90-91页 |
| 5.2.2 RNA qRT-PCR反应 | 第91-92页 |
| 5.2.3 基因转录水平分析 | 第92页 |
| 5.2.4 YYH13107内切几丁质酶基因克隆 | 第92-94页 |
| 5.3 结果与分析 | 第94-107页 |
| 5.3.1 候选基因在YYH13和YYH16中DNA qRT-PCR表达分析结果 | 第94-96页 |
| 5.3.2 半定量RT-PCR测序验证 | 第96页 |
| 5.3.3 不同几丁质诱导时间对YYH13107和YYH1311002基因表达的影响 | 第96-97页 |
| 5.3.4 不同碳源对YYH132757和YYH1311002基因表达的影响 | 第97-99页 |
| 5.3.5 不同诱导时间对YYH132757和YYH1311002基因表达的影响 | 第99-101页 |
| 5.3.7 基因ctoi18-148内切几丁质酶基因的克隆 | 第101-107页 |
| 5.4 讨论 | 第107-108页 |
| 5.4.1 关于在YYH13与YYH16中内切几丁质酶基因转录差异分析 | 第107-108页 |
| 5.4.2 关于在YYH13与YYH16中外切β-1,3-葡聚糖酶基因转录差异分析 | 第108页 |
| 5.5 小结 | 第108-109页 |
| 第六章 全文总结与展望 | 第109-111页 |
| 6.1 全文总结 | 第109页 |
| 6.2 本研究的特色与创新点 | 第109-110页 |
| 6.3 下一步研究计划 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-122页 |
| 附录：缩略词表 | 第122-123页 |
| 致谢 | 第123-124页 |
| 作者简介 | 第124页 |
