猪动静脉血液miRNA表达谱分析
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第10-25页 |
| 1.1 miRNA简介 | 第10-17页 |
| 1.1.1 miRNA的发现 | 第10-11页 |
| 1.1.2 miRNA的生成 | 第11-12页 |
| 1.1.3 miRNA的作用机制 | 第12-13页 |
| 1.1.4 miRNA的检测方法 | 第13-17页 |
| 1.2 猪miRNA研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3 血液miRNA研究进展 | 第19-25页 |
| 1.3.1 血液miRNA的发现和稳定性 | 第20页 |
| 1.3.2 血液miRNA的存在形式 | 第20-22页 |
| 1.3.3 血液miRNA作为分子标记 | 第22-25页 |
| 2 研究内容与目的意义 | 第25-27页 |
| 3 材料和方法 | 第27-34页 |
| 3.1 实验样品采集 | 第27页 |
| 3.2 主要仪器和试剂 | 第27-28页 |
| 3.2.1 主要仪器设备 | 第27-28页 |
| 3.2.2 主要试剂 | 第28页 |
| 3.3 试验方法 | 第28-34页 |
| 3.3.1 Total RNA的提取 | 第28-29页 |
| 3.3.2 Total RNA的质检 | 第29页 |
| 3.3.3 高通量测序 | 第29-31页 |
| 3.3.4 miRNA定量 | 第31-33页 |
| 3.3.5 靶基因预测和功能注解分析 | 第33-34页 |
| 4 结果与分析 | 第34-52页 |
| 4.1 Total RNA提取结果 | 第34页 |
| 4.2 测序结果 | 第34-39页 |
| 4.2.1 原始数据结果 | 第34-35页 |
| 4.2.2 Mappable序列长度分布统计 | 第35-36页 |
| 4.2.3 核酸倾向性分析 | 第36页 |
| 4.2.4 miRNA的鉴定和分组 | 第36-38页 |
| 4.2.5 miRNA簇 | 第38-39页 |
| 4.3 高表达miRNAs的分析 | 第39-47页 |
| 4.3.1 miRNA的拷贝数变异 | 第39-40页 |
| 4.3.2 高表达miRNAs的分析 | 第40-43页 |
| 4.3.3 高表达miRNAs的靶基因预测 | 第43页 |
| 4.3.4 高表达miRNAs的生物学过程分析 | 第43-47页 |
| 4.4 动静脉血液miRNA表达谱差异分析 | 第47-50页 |
| 4.4.1 动静脉血液miRNA的聚类分析 | 第47-48页 |
| 4.4.2 IDEG6差异检验差异miRNAs | 第48-49页 |
| 4.4.3 差异miRNAs生物学功能分析 | 第49-50页 |
| 4.5 定量验证 | 第50-52页 |
| 5 讨论 | 第52-56页 |
| 5.1 Solexa测序的优越性 | 第52-53页 |
| 5.2 猪是理想的医学动物模型 | 第53页 |
| 5.3 血液miRNAs文库表达谱特征 | 第53-54页 |
| 5.4 高表达和差异表达的miRNAs | 第54-55页 |
| 5.5 基于血液miRNAs的核酸诊断和核酸治疗 | 第55-56页 |
| 6 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第63页 |
