| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-29页 |
| 1.1 植物microRNA研究背景介绍 | 第12-18页 |
| 1.1.1 植物miRNA的合成途径及主要关键酶的介绍 | 第12-14页 |
| 1.1.2 植物microRNA的调控机理 | 第14-16页 |
| 1.1.3 microRNA基因的产生 | 第16页 |
| 1.1.4 植物microRNA的生物学功能 | 第16-18页 |
| 1.2 小RNA测序和降解组测序介绍 | 第18-20页 |
| 1.2.1 小RNA测序研究介绍 | 第18-19页 |
| 1.2.2 降解组测序研究介绍 | 第19页 |
| 1.2.3 小RNA测序和降解组测序技术在棉花中的运用 | 第19-20页 |
| 1.3 microRNA157靶标基因功能研究进展 | 第20-23页 |
| 1.4 棉花纤维发育研究进展 | 第23-26页 |
| 1.4.1 棉花纤维发育时期介绍 | 第23-24页 |
| 1.4.2 激素等信号分子对纤维发育的调控 | 第24页 |
| 1.4.3 转录因子对纤维发育的调控 | 第24-25页 |
| 1.4.4 细胞壁合成修饰相关蛋白以及细胞骨架相关蛋白对纤维发育的影响 | 第25-26页 |
| 1.4.5 棉花纤维人工驯化的研究进展 | 第26页 |
| 1.5 调控器官大小研究进展 | 第26-27页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 海岛棉纤维发育相关microRNA的鉴定与分析 | 第29-45页 |
| 2.1 实验材料和方法 | 第29-34页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第29页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第29-34页 |
| 2.2 实验结果与分析 | 第34-44页 |
| 2.2.1 小RNA的注释与序列分析 | 第35-36页 |
| 2.2.2 保守和新microRNA的鉴定 | 第36-40页 |
| 2.2.3 microRNA表达模式分析 | 第40-41页 |
| 2.2.4 microRNA在胚珠和纤维中生物活性检测 | 第41-44页 |
| 2.3 讨论 | 第44-45页 |
| 第三章 调控纤维发育microRNA靶标的挖掘 | 第45-58页 |
| 3.1 实验材料和方法 | 第45-48页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第45页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第45-48页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第48-55页 |
| 3.2.1 microRNA靶标的鉴定与验证 | 第48-52页 |
| 3.2.2 靶标与对应microRNA的表达模式相关性分析 | 第52-55页 |
| 3.3 讨论 | 第55-58页 |
| 第四章 microRNA157影响棉花纤维发育,形态建成和器官大小 | 第58-85页 |
| 4.1 实验材料和方法 | 第58-62页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第58页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第58-62页 |
| 4.2 实验结果与分析 | 第62-82页 |
| 4.2.1 棉花的驯化改变了microRNA157和其靶标在纤维的表达量 | 第62-63页 |
| 4.2.2 降低microRNA157在纤维中的活性导致纤维细胞变短 | 第63-68页 |
| 4.2.3 超量表达microRNA157导致植株丛生，花和棉桃变小 | 第68-71页 |
| 4.2.4 超量表达microRNA157抑制了花器官的发育 | 第71-75页 |
| 4.2.5 RNA seqencing分析差异表达基因 | 第75-79页 |
| 4.2.6 miRNA157及其靶标基因GhSPLs表达模式分析 | 第79页 |
| 4.2.7 超量表达GhmiR157导致生长素信号减弱 | 第79-82页 |
| 4.3 讨论 | 第82-85页 |
| 参考文献 | 第85-99页 |
| 附录 | 第99-132页 |
| 附录1 植物基因组DNA抽提方法 | 第99-100页 |
| 附录2 Southern blot操作步骤 | 第100-102页 |
| 附录3 异硫氰酸胍法抽提RNA | 第102-103页 |
| 附录4 七个文库中保守miRNAs和候选新miRNAs表达量 | 第103-105页 |
| 附录5 七个纤维发育文库中预测的miRNA前体 | 第105-107页 |
| 附录6 miRNA保守性分析 | 第107-109页 |
| 附录7 七个纤维发育文库中保守miRNA家族代表序列 | 第109-112页 |
| 附录8 纤维起始期鉴定的miRNA靶标 | 第112-118页 |
| 附录9 纤维伸长期鉴定的miRNA靶标 | 第118-122页 |
| 附录10 纤维次生壁加厚期鉴定的miRNA靶标 | 第122-125页 |
| 附录11 引物序列列表 | 第125-132页 |
| 攻读学位期间已发表和待发表论文 | 第132-133页 |
| 致谢 | 第133-135页 |
