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致病疫霉诱导下番茄小RNA文库构建及sly-miR396的功能特性研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
引言第10-11页
1 文献综述第11-23页
    1.1 番茄晚疫病的研究进展第11-12页
        1.1.1 致病疫霉第11页
        1.1.2 番茄晚疫病第11页
        1.1.3 番茄晚疫病的研究现状第11-12页
    1.2 miRNA概述第12-16页
        1.2.1 miRNA的产生机制第12-13页
        1.2.2 miRNA的作用机理第13-14页
        1.2.3 miRNA的功能第14-16页
    1.3 miRNA的研究方法第16-20页
        1.3.1 miRNA的发现方法第16-19页
        1.3.2 miRNA靶基因的研究方法第19-20页
    1.4 植物miR396的研究进展第20-21页
        1.4.1 miR396的保守性第20页
        1.4.2 miR396的功能第20-21页
    1.5 本研究的目的及意义第21-23页
2 致病疫霉诱导下番茄小RNA文库的构建第23-38页
    2.1 引言第23页
    2.2 实验材料和试剂第23页
        2.2.1 数据分析软件第23页
        2.2.2 实验材料第23页
        2.2.3 实验试剂及仪器第23页
    2.3 实验方法第23-25页
        2.3.1 致病疫霉孢子悬浮液的制备第23-24页
        2.3.2 番茄植株的处理第24页
        2.3.3 总RNA提取第24页
        2.3.4 电泳检测第24-25页
    2.4 番茄小RNA文库数据分析第25-27页
        2.4.1 小RNA文库的构建第25页
        2.4.2 晚疫病相关miRNA的靶基因分析第25页
        2.4.3 番茄miRNA的实时定量验证第25-27页
    2.5 结果第27-37页
        2.5.1 番茄叶片总RNA第27页
        2.5.2 sRNA分析第27-29页
        2.5.3 番茄中保守miRNA鉴定第29-30页
        2.5.4 番茄新miRNA的鉴定及靶基因预测第30-34页
        2.5.5 番茄miRNA的差异表达分析第34-35页
        2.5.6 番茄miRNA实时定量验证第35页
        2.5.7 番茄miRNA的靶基因预测第35-37页
    2.6 讨论第37页
    2.7 小结第37-38页
3 sly-miR396的表达模式分析第38-51页
    3.1 引言第38页
    3.2 实验材料及试剂第38-39页
        3.2.1 数据库及分析软件第38页
        3.2.2 实验材料第38页
        3.2.3 实验试剂及仪器第38-39页
    3.3 实验方法第39-41页
        3.3.1 sly-miR396的生物信息学分析第39页
        3.3.2 sly-miR396及其靶基因的表达模式分析第39-41页
    3.4 结果与分析第41-49页
        3.4.1 sly-miR396的靶基因预测结果第41页
        3.4.2 sly-miR396基因的上游序列分析第41-42页
        3.4.3 sly-miR396的表达模式分析第42-49页
    3.5 讨论第49页
    3.6 小结第49-51页
4 MIR396基因的克隆及植物表达载体构建第51-60页
    4.1 引言第51页
    4.2 实验材料及试剂第51页
        4.2.1 实验材料第51页
        4.2.2 实验试剂及仪器第51页
    4.3 实验方法第51-56页
        4.3.1 番茄基因组DNA的提取第51-52页
        4.3.2 MIR396基因的克隆第52-55页
        4.3.3 MIR396植物过表达载体的构建第55-56页
    4.4 结果与分析第56-58页
        4.4.1 番茄基因组DNA第56-57页
        4.4.2 MIR396基因的克隆结果第57页
        4.4.3 MIR396植物表达载体的构建结果第57-58页
    4.5 讨论第58-59页
    4.6 小结第59-60页
5 miR396的功能分析第60-68页
    5.1 引言第60页
    5.2 实验材料与试剂第60页
        5.2.1 实验材料第60页
        5.2.2 实验试剂及仪器第60页
    5.3 实验方法第60-62页
        5.3.1 根癌农杆菌工程菌的获得第60-61页
        5.3.2 miR396在番茄内的瞬时表达第61-62页
        5.3.3 miR396在烟草内的稳定表达第62页
        5.3.4 烟草再生植株的分子检测第62页
    5.4 结果与分析第62-67页
        5.4.1 农杆菌工程菌的检测第62-63页
        5.4.2 miR396在番茄中瞬时表达情况第63-64页
        5.4.3 瞬时表达番茄的抗病性检测第64页
        5.4.4 MIR396转化烟草的检测第64-66页
        5.4.5 转基因烟草中miR396及其靶基因的表达分析第66-67页
    5.5 讨论第67页
    5.6 小结第67-68页
结论第68-69页
参考文献第69-74页
附录A 培养基配方第74-75页
附录B 论文中所用质粒图谱第75-76页
附录C 电泳用DNA Marker第76-77页
附录D MIR396基因序列第77-78页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第78-79页
致谢第79-80页

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