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基于同源重组策略的新型人源染色体靶向载体介导的人β-珠蛋白基因簇转移的研究

摘要第7-10页
英文摘要第10-11页
前言第12-32页
    (一) 基因治疗载体系统第12-22页
        1. 病毒载体系统应用第12-18页
            1.1 反转录病毒载体第13-14页
            1.2 慢病毒载体第14-15页
            1.3 腺相关病毒载体第15-16页
            1.4 腺病毒载体第16-18页
        2. 非病毒载体系统的应用第18-21页
            2.1 裸DNA的物理转移第18-19页
            2.2 通过化学载体分子的基因转移第19-20页
            2.3 具有特殊结构的治疗载体第20-21页
        3. 非病毒载体系统在基因转移中的优势第21-22页
    (二) Β-地中海贫血基因治疗研究第22-26页
        1. 人类珠蛋白基因家族结构特点及其表达调控第22-24页
        2 β-地中海贫血的基因治疗策略第24-26页
            2.1 细胞水平基因转移研究第24-25页
            2.2 回体基因转移研究第25-26页
    (三) 基于同源重组策略的基因治疗载体的研究第26-32页
        1. 同源重组机制第27-29页
        2 基于同源重组的新型人源染色体靶向的BAC载体第29-32页
材料方法第32-55页
    (一)、实验材料第32-34页
        1. 菌株和质粒第32页
        2. 细胞系第32页
        3. 限制性内切酶及修饰酶第32页
        4. 放射性核素第32页
        5. 本研究中使用的PCR引物第32-33页
        6. 其它主要试剂第33页
        7. 主要仪器第33-34页
    (二) 实验方法第34-55页
        1. 研究的技术路线第34-36页
            1.1 新型人源染色体靶向BAC载体构建技术路线第34-35页
            1.2 人β-珠蛋白基因簇转移技术路线第35-36页
        2. 含人β-珠蛋白基因簇的重组靶向载体构建和鉴定第36-41页
            2.1 BAC质粒的制备第36页
                2.1.1 BAC质粒的小量制备第36页
                2.1.2 BAC质粒的大量制备第36页
            2.2 聚乙二醇(PEG)法纯化质粒DNA第36-37页
            2.3 人β-珠蛋白基因簇DNA的回收第37页
                2.3.1 沟槽电泳法回收人β-珠蛋白基因簇大片段DNA第37页
                2.3.2 低熔点琼脂糖凝胶回收人β-珠蛋白基因簇大片段DNA第37页
            2.4 含人β-珠蛋白基因簇的靶向的BAC载体(BACMS/BGGC)亚克隆第37-39页
                2.4.1 载体去磷酸化第37-38页
                2.4.2 大片段DNA分子的连接第38页
                2.4.3 DH10B感受态细胞的制备和连接产物的转化第38-39页
            2.5 重组BAC靶向载体(BACMS/BGGC)的鉴定第39-41页
                2.5.1 斑点杂交第39-40页
                2.5.2 酶切鉴定第40页
                2.5.3 重组载体基因簇完整性鉴定分析第40-41页
        3. 细胞传代和培养第41-42页
            3.1 细胞复苏第41页
            3.2 细胞培养第41-42页
            3.3 细胞传代和冻存第42页
            3.4 G418和GCV溶液配制第42页
        4. 细胞转染和筛选第42-44页
            4.1 目的DNA的制备和纯化第42-43页
            4.2 脂质体转染细胞第43页
            4.3 电穿孔转染细胞第43页
            4.4 转染细胞的筛选和单克隆细胞株的获得第43-44页
        5. 单克隆细胞基因组DNA分析第44-51页
            5.1 基因组DNA PCR检测第44-45页
                5.1.1 基因组DNA提取第44页
                5.1.2 PCR扩增目的DNA策略第44页
                5.1.3 PCR扩增的条件第44-45页
            5.2 基因组DNA Southern blot整合位点分析第45-46页
                5.2.1 DNA探针模板制备第45页
                5.2.2 DNA探针标记第45页
                5.2.3 基因组DNA的酶切,电泳及转膜第45-46页
                5.2.4 杂交和自显影第46页
            5..3 转移DNA完整性分析第46页
                5.3.1 探针模板制备和探针标记第46页
                5.3.2 基因组DNA酶切电泳第46页
                5.3.3 转膜、杂交和自显影第46页
            5.4 单克隆细胞染色体荧光原位杂交分析(DNA FISH)第46-51页
                5.4.1 常规收集细胞染色体和滴片第46-47页
                5.4.2 常规G显带第47-48页
                5.4.3 高分辩率方法处理和收集细胞染色体第48-49页
                5.4.4 探针直接标记第49-50页
                5.4.5 常规染色体荧光原位杂交(DNA FISH)第50-51页
                5.4.6 染色体G-显带荧光原位杂交(DNA G-banding-FISH)第51页
        6. 目的基因—人γ~A-珠蛋白基因表达水平分析第51-55页
            6.1 Hemin诱导K562细胞分化第51-52页
            6.2 联苯胺染色试剂配制第52页
            6.3 提取细胞总RNA第52页
            6.4 RNase保护实验第52-55页
                6.4.1 RNA探针标记第52-53页
                6.4.2 RNA探针纯化第53-54页
                6.4.3 RNA: RNA杂交及RNase反应第54页
                6.4.4 变性胶电泳及放射自显影第54-55页
结果第55-71页
    (一) 含人β-珠蛋白基因簇靶向载体构建和鉴定第55-58页
        1. 斑点杂交第55页
        2. 酶切鉴定第55-57页
            2.1 NotI酶切鉴定BACMS/BGGC第55-56页
            2.2 不同酶切鉴定BACMS/BGGC第56-57页
        3. Southern blot鉴定人β-珠蛋白基因簇完整性第57-58页
    (二) 单克隆细胞株的获得第58页
    (三) 单克隆细胞基因组DNA结构分析第58-70页
        1. PCR检测第58-60页
        2. Southern blot分析第60-63页
            2.1 整合位点分析第60-62页
            2.2 转移DNA完整性分析第62-63页
        3. DNA FISH分析第63-70页
            3.1 K562细胞系核型分析第63-66页
            3.2 常规DNA-FISH分析第66-67页
            3.3 G-带DNA-FISH分析第67-70页
    (三) 人Γ~A-珠蛋白基因表达水平分析第70-71页
讨论第71-84页
    (一) 新型人源染色体靶向载体介导的Β-地中海贫血基因治疗第71-74页
        1. 新型靶向载体介导人β-珠蛋白基因簇的转移第71-72页
        2. 新型人源染色体靶向载体介导基因转移的优势第72-73页
        3. 靶细胞的选择第73-74页
    (二) 成簇基因转移与基因治疗第74-75页
    (三) 基于同源重组策略的非病毒载体介导基因转移第75-77页
    (四) 同源重组过程中的定点整合与随机整合第77-81页
    (五) 本研究的不足之处第81-83页
    (六) 展望第83-84页
小结第84-85页
参考文献第85-91页
文献综述第91-106页
缩略语第106-108页
致谢第108-109页
个人简历第109页

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