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枯草芽孢杆菌G-7拮抗香蕉枯萎病菌的效果及相关基因研究

摘要第3-5页
abstract第5-6页
缩略词及中英文对照第7-11页
1 前言第11-17页
    1.1 香蕉枯萎病生物防治的研究概况第11-12页
        1.1.1 香蕉枯萎病的发生与危害情况第11页
        1.1.2 香蕉枯萎病的生物防治第11-12页
    1.2 芽孢杆菌第12-14页
        1.2.1 芽孢杆菌生防作用的研究进展第12-13页
        1.2.2 芽孢杆菌对植物病原菌的抑制作用机制第13-14页
    1.3 脂肽类抗生素研究概况第14-17页
        1.3.1 非核糖体肽类抗生素类型及结构特点第14-15页
        1.3.2 Surfactin家族第15页
        1.3.3 Iturin家族第15-16页
        1.3.4 Fengycin家族第16页
        1.3.5 脂肽类抗生素的应用第16-17页
    1.4 研究目的与意义第17页
2 材料与方法第17-31页
    2.1 供试材料第17-19页
        2.1.1 供试生防菌株第17页
        2.1.2 供试病原菌第17页
        2.1.3 质粒载体第17页
        2.1.4 主要仪器与设备第17-18页
        2.1.5 主要试剂及溶液配制第18-19页
    2.2 试验方法第19-31页
        2.2.1 菌株G-7 抑菌活性的测定第19-20页
            2.2.1.1 菌株G-7 与Foc4对峙培养第19页
            2.2.1.2 菌株G-7 对Foc4菌丝体生长的抑制作用第19-20页
            2.2.1.3 菌株G-7 对Foc4孢子萌发的抑制作用第20页
            2.2.1.4 菌株G-7 活体抑菌活性的测定第20页
        2.2.2 菌株G-7 生长曲线的测定第20页
        2.2.3 拮抗相关基因的筛选第20页
        2.2.4 itu D-1、lpa-14 的克隆第20-26页
            2.2.4.1 菌株G-7 的培养第20-21页
            2.2.4.2 菌株G-7 基因组总DNA的提取第21-22页
            2.2.4.3 PCR引物设计与合成第22页
            2.2.4.4 itu D-1、lpa-14 基因的扩增第22-23页
            2.2.4.5 PCR产物的回收第23-24页
            2.2.4.6 宿主菌E.coli DH5α 感受态细胞的制备第24页
            2.2.4.7 回收产物的连接转化第24页
            2.2.4.8 连接产物转化大肠杆菌(E.coli DH5α)感受态细胞第24-25页
            2.2.4.9 阳性克隆的筛选与鉴定第25-26页
            2.2.4.10 生物信息学分析第26页
        2.2.5 菌株G-7 与Foc4拮抗前后itu D-1、lpa-14 的相对表达第26-31页
            2.2.5.1 菌株G-7 的预处理第26-27页
            2.2.5.2 菌株G-7 的总RNA提取第27-29页
            2.2.5.3 菌株G-7 c DNA第一链的合成第29页
            2.2.5.4 Foc4 RNA提取第29-30页
            2.2.5.5 Foc4 c DNA第一链的合成第30页
            2.2.5.6 Real-time PCR引物设计第30-31页
            2.2.5.7 Real-time PCR反应第31页
3 结果与分析第31-43页
    3.1 菌株G-7 与Foc4对峙培养第31-32页
    3.2 菌株G-7 的抑菌活性测定第32-33页
        3.2.1 菌株G-7 离体抑菌活性测定第32-33页
        3.2.2 菌株G-7 活体抑菌活性的测定第33页
    3.3 菌株G-7 的生长曲线测定第33-34页
    3.4 itu D-1、lpa-14 基因的克隆第34-36页
        3.4.1 菌株G-7 基因组DNA的提取第34页
        3.4.2 菌株G-7 拮抗相关基因的PCR扩增第34-35页
        3.4.3 PCR产物的克隆与鉴定第35-36页
    3.5 生物信息学分析第36-42页
        3.5.1 itu D-1 和lpa-14 物理性质分析第36页
        3.5.2 itu D-1 和lpa-14 同源性比对及蛋白功能域预测分析第36-37页
        3.5.3 itu D-1 和lpa-14 编码蛋白的Coli分区第37-38页
        3.5.4 itu D-1 和lpa-14 编码蛋白二级结构预测分析第38-39页
        3.5.5 itu D-1 和lpa-14 编码蛋白三级结构预测分析第39-40页
        3.5.6 itu D-1 和lpa-14 氨基酸序列系统进化树分析第40-42页
    3.6 菌株G-7 与Foc4拮抗前后itu D-1、lpa-14 相对表达量分析第42-43页
4 结论与讨论第43-47页
    4.1 菌株G-7 的离体活性的测定第43-44页
    4.2 菌株G-7 拮抗相关基因的克隆第44-46页
    4.3 菌株G-7 与Foc4拮抗前后itu D-1、lpa-14 相对表达量分析第46-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-54页
附录A:lpa-14 和itu D-1 核苷酸序列第54-55页

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