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链霉菌抗生素生物合成中酮基还原酶Med-ORF12功能研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 前言第13-24页
    1.1 链霉菌和抗生素第13-15页
        1.1.1 链霉菌第13-14页
        1.1.2 抗生素介绍第14-15页
    1.2 苯并异色烷醌家族化合物第15-20页
        1.2.1 苯并异色烷醌家族化合物简介第15-16页
        1.2.2 苯并异色烷醌家族抗生素生物合成第16-20页
    1.3 美达霉素和Med-ORF12第20-21页
        1.3.1 链霉菌Streptomyces sp.AM7161第20页
        1.3.2 美达霉素生物合成第20-21页
    1.4 酮基还原酶: RED1和RED2第21-22页
    1.5 本研究的意义及目的第22-24页
第二章 材料与方法第24-38页
    2.1 菌株质粒及引物第24-26页
    2.2 培养基第26-29页
        2.2.1 链霉菌培养基第26-29页
        2.2.2 大肠杆菌培养基第29页
        2.2.3 HPLC和LC/MS分析条件第29页
    2.3 溶液和试剂第29-32页
        2.3.1 大肠杆菌质粒DNA小量提取试剂[Sambrook J et al.,1996]参考《分子克隆手册》配制第29页
        2.3.2 抗生素第29-30页
        2.3.3 链霉菌原生质体制备和转化试剂第30-32页
    2.4 实验方法第32-38页
        2.4.1 大肠杆菌质粒DNA小量提取(碱性裂解法)第32页
        2.4.2 大肠杆菌感受态制备及转化第32-33页
        2.4.3 DNA体外操作第33-34页
        2.4.4 大肠杆菌菌种的保存第34页
        2.4.5 链霉菌的液体和固体培养第34页
        2.4.6 链霉菌孢子的收集第34-35页
        2.4.7 链霉菌基因组DNA的提取第35页
        2.4.8 链霉菌的发酵培养和产物粗提取第35页
        2.4.9 链霉菌原生质体的制备和转化第35-36页
        2.4.10 接合转移实验第36-37页
        2.4.11 生物信息学分析第37-38页
第三章 med-ORF12的生物信息学分析第38-43页
    3.1 Med-ORF12进化树构建第38-39页
    3.2 Med-ORF12及其同源序列的多序列比对分析第39-41页
    3.3 讨论第41-43页
第四章 med-ORF12的敲除第43-54页
    4.1 基因敲除质粒的构建第43-49页
        4.1.1 med-ORF12 L臂和R臂的克隆载体的构建第44-46页
        4.1.2 L臂和R臂的连接第46-47页
        4.1.3 构建含L臂和R臂的pYH7重组质粒第47-48页
        4.1.4 构建接合转移的菌株ET12567(pUZ8002)/pHSL124第48-49页
    4.2 野生型链霉菌中med-ORF12的敲除第49-51页
        4.2.1 ET12567/pUZ8002/pHSL124与野生型链霉菌的接合转移第49页
        4.2.2 基因敲除转化子的筛选及验证第49-51页
    4.3 med-ORF12缺失对于野生菌产素影响第51-52页
    4.4 讨论第52-54页
第五章 突变菌株的中间产物分析第54-61页
    5.1 CH999/pRM5宿主表达系统介绍第54-56页
        5.1.1 pRM5导入CH999,构建CH999/pRM5第55-56页
    5.2 发酵产物初提及HPLC分析第56页
    5.3 LC/MS质谱分析第56-59页
    5.4 Med-ORF12参与生物合成反应路线图推测第59页
    5.5 讨论第59-61页
第六章 med-ORF12的回补和超表达第61-66页
    6.1 缺失菌HQ的回补第61-62页
    6.2 发酵液产素分析及HPLC分析第62页
    6.3 med-ORF12的超表达第62-63页
    6.4 超量表达med-ORF12对美达霉素产量的影响第63-64页
    6.5 讨论第64-66页
总结与展望第66-68页
参考文献第68-74页
硕士期间发表的论文第74-75页
致谢第75页

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