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Amycolatopsis orientalis ZEL-1的聚乙烯降解特性及其基于转录组测序的降解关键基因和代谢通路研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
1 绪论第12-22页
    1.1 聚乙烯塑料污染的现状第12页
    1.2 废弃聚乙烯塑料的处理方法第12-14页
        1.2.1 目前聚乙烯塑料污染问题的解决办法第12-13页
        1.2.2 光降解途径第13页
        1.2.3 热裂解途径第13-14页
        1.2.4 微生物降解第14页
    1.3 生物降解聚乙烯塑料第14-17页
        1.3.1 聚乙烯的降解菌第14-15页
        1.3.2 聚乙烯塑料的降解条件、过程和机理第15-16页
        1.3.3 聚乙烯降解特性的研究方法第16-17页
    1.4 诱变育种概述第17-19页
        1.4.1 物理诱变方法及原理第18页
        1.4.2 化学诱变方法及原理第18-19页
        1.4.3 复合诱变方法及原理第19页
        1.4.4 生物诱变第19页
    1.5 转录组测序技术概述第19-20页
        1.5.1 转录组与转录组测序技术简介第19-20页
        1.5.2 转录组测序的研究方法第20页
        1.5.3 转录组测序在生物降解研究中的应用第20页
    1.6 本研究目的与技术路线第20-22页
        1.6.1 研究目的第20-21页
        1.6.2 研究意义和创新点第21页
        1.6.3 研究主要内容和技术路线第21-22页
2 聚乙烯降解菌的筛选、鉴定及其降解特性研究第22-43页
    2.1 实验材料第22-25页
        2.1.1 菌种来源第22页
        2.1.2 培养基第22-23页
        2.1.3 仪器和药品第23-25页
    2.2 实验方法第25-30页
        2.2.1 菌株的分离纯化第25页
        2.2.2 菌株理化性质鉴定第25-26页
        2.2.3 16S rDNA鉴定第26页
        2.2.4 菌株ZEL-1 降解效果研究——培养液组分研究第26-29页
        2.2.5 菌株ZEL-1 降解效果研究——残留固体聚乙烯性能测定第29-30页
        2.2.6 数据处理第30页
    2.3 结果与讨论第30-42页
        2.3.1 菌株理化性质鉴定第30-31页
        2.3.2 16S rDNA的扩增第31-32页
        2.3.3 菌株降解特性研究——培养液成分测定第32-37页
        2.3.4 菌株降解特性研究——残留固体PE性能测定第37-42页
    2.4 本章小结第42-43页
3 Amycolatopsis orientalis ZEL-1 的诱变育种第43-53页
    3.1 实验材料与仪器设备第43页
        3.1.1 菌株第43页
        3.1.2 实验药品和仪器第43页
        3.1.3 培养基第43页
    3.2 实验方法第43-46页
        3.2.1 出发菌株培养和菌悬液制备第43-44页
        3.2.2 紫外诱变第44页
        3.2.3 微波诱变第44页
        3.2.4 吖啶橙诱变第44-45页
        3.2.5 LiCl诱变第45页
        3.2.6 盐酸羟胺诱变第45页
        3.2.7 复合诱变第45-46页
        3.2.8 复筛第46页
        3.2.9 优势菌株降解性性能测定第46页
    3.3 结果与讨论第46-52页
        3.3.1 致死率和正突变率统计第46-49页
        3.3.2 复筛结果统计第49页
        3.3.3 优势菌株的筛选结果统计第49-51页
        3.3.4 优势菌株与原始菌株降解性能比较第51-52页
    3.4 本章小结第52-53页
4 Amycolatopsis orientalis ZEL-1 的转录组测序以及聚乙烯降解关键酶和主要代谢通路研究第53-86页
    4.1 实验材料第53-54页
        4.1.1 菌株第53页
        4.1.2 培养基第53页
        4.1.3 药品与耗材第53-54页
        4.1.4 仪器设备第54页
    4.2 实验方法第54-61页
        4.2.1 样品准备第54页
        4.2.2 转录组建库、上机流程第54-56页
        4.2.3 原始数据质量控制第56页
        4.2.4 与参考基因组比对以及GO功能、CGO分类、KEGG通路注释第56-57页
        4.2.5 基因表达量分析第57页
        4.2.6 不同碳源的G组和W组基因表达差异分析第57-58页
        4.2.7 荧光定量PCR验证转录组基因表达差异第58-61页
    4.3 结果与讨论第61-85页
        4.3.1 RNA提取质检结果第61-62页
        4.3.2 测序数据质量控制统计第62-63页
        4.3.3 与参考基因组序列比对结果统计第63-64页
        4.3.4 转录组整体质量评估第64-65页
        4.3.5 GO、COG、KEGG通路注释结果统计第65-69页
        4.3.6 基因表达量分析第69-70页
        4.3.7 不同碳源组的基因表达差异分析第70-77页
        4.3.8 菌株ZEL-1 降解聚乙烯的关键基因和代谢通路分析第77-83页
        4.3.9 荧光定量PCR验证转录组基因表达差异结果第83-85页
    4.4 本章小结第85-86页
5 总结与展望第86-88页
参考文献第88-96页
附录第96-112页
致谢第112-113页
在校期间的研究成果第113页

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