基于多数据源融合的蛋白质功能预测方法研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-15页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-13页 |
| 1.2.1 蛋白质序列信息的方法研究 | 第12页 |
| 1.2.2 蛋白质相互作用的方法研究 | 第12-13页 |
| 1.2.3 多数据融合策略的研究现状 | 第13页 |
| 1.3 本文的研究内容及结构 | 第13-15页 |
| 2 蛋白质功能预测相关知识 | 第15-25页 |
| 2.1 蛋白质数据源及相关数据库 | 第15-19页 |
| 2.1.1 蛋白质数据 | 第15-16页 |
| 2.1.2 GO功能注释 | 第16-18页 |
| 2.1.3 相关数据库介绍 | 第18-19页 |
| 2.2 蛋白质有权网络的构建策略 | 第19页 |
| 2.3 基于网络的融合策略 | 第19-22页 |
| 2.3.1 网络融合模型 | 第20-21页 |
| 2.3.2 结果融合模型 | 第21-22页 |
| 2.4 基于网络的蛋白质功能预测方法 | 第22-24页 |
| 2.4.1 近邻方法 | 第23页 |
| 2.4.2 全局网络拓扑方法 | 第23-24页 |
| 2.5 本章小结 | 第24-25页 |
| 3 基于多数据源融合的蛋白功能预测方法 | 第25-37页 |
| 3.1 多数据网络构建 | 第25-31页 |
| 3.1.1 基因表达数据 | 第25-26页 |
| 3.1.2 序列数据 | 第26-27页 |
| 3.1.3 蛋白质相互作用数据 | 第27-28页 |
| 3.1.4 多数据网络融合策略 | 第28-29页 |
| 3.1.5 全局功能预测算法 | 第29-31页 |
| 3.2 实验数据和评价指标 | 第31-32页 |
| 3.2.1 实验相关数据 | 第31页 |
| 3.2.2 结果评价指标 | 第31-32页 |
| 3.3 实验结果分析 | 第32-36页 |
| 3.3.1 单数据源与多数据源融合对比实验 | 第32-34页 |
| 3.3.2 融合策略对比实验 | 第34-35页 |
| 3.3.3 不同预测方法对比实验 | 第35-36页 |
| 3.4 本章小结 | 第36-37页 |
| 4 基于功能相关性的蛋白质功能预测方法 | 第37-48页 |
| 4.1 功能相关性 | 第37-38页 |
| 4.2 基于双重索引矩阵的蛋白质功能预测方法 | 第38-40页 |
| 4.3 实验结果分析 | 第40-47页 |
| 4.3.1 算法性能分析 | 第40-43页 |
| 4.3.2 参数选择 | 第43-44页 |
| 4.3.3 预测结果分析 | 第44-47页 |
| 4.4 本章小结 | 第47-48页 |
| 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-54页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
