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向日葵锈菌分泌蛋白预测及内参基因筛选

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 文献综述第10-18页
    1 向日葵锈病的为害与防治第10-11页
        1.1 向日葵锈病的发生与危害第10页
        1.2 向日葵锈病的防治第10-11页
    2 向日葵抗锈病育种第11-13页
        2.1 向日葵锈菌生理小种分化研究第11-12页
        2.2 向日葵抗锈病育种研究第12-13页
    3 病原菌与寄主互作中分泌蛋白研究第13-15页
        3.1 分泌蛋白在病原菌与寄主互作中的作用第13-14页
        3.2 分泌蛋白的研究方法第14-15页
    4 内参基因的选择第15-16页
    5 研究目的与意义第16-18页
第二章 向日葵锈菌生理小种及品种抗性鉴定第18-28页
    1 材料与方法第18-20页
        1.1 锈菌标样采集、扩繁第18-19页
            1.1.1 锈菌菌样来源第18-19页
            1.1.2 锈菌夏孢子的繁殖第19页
        1.2 锈菌生理小种的鉴定第19-20页
            1.2.1 国际标准鉴别寄主的种植第19页
            1.2.2 向日葵锈病反应型分级标准第19页
            1.2.3 生理小种鉴定命名第19-20页
        1.3 向日葵品种抗锈病性鉴定第20页
            1.3.1 供试向日葵品种第20页
            1.3.2 供试菌样第20页
            1.3.3 向日葵品种抗性分级标准第20页
    2 结果与分析第20-26页
        2.1 生理小种鉴定结果第20-22页
        2.2 向日葵品种抗诱病性鉴定结果第22-26页
    3 结论与讨论第26-28页
第三章 基于锈菌转录组数据的分泌蛋白预测第28-44页
    1 数据来源与方法第28-30页
        1.1 向日葵锈菌转录组数据来源第28页
        1.2 分泌蛋白预测及分析第28-30页
            1.2.1 分泌蛋白组预测第28-29页
            1.2.2 分泌蛋白及信号肽特征分析第29页
            1.2.3 分泌蛋白的功能注释第29页
            1.2.4 分泌蛋白GO、COG及KEGG分析第29-30页
            1.2.5 分泌蛋白的致病性分析第30页
    2 结果与分析第30-42页
        2.1 分泌蛋白预测结果第30-32页
        2.2 分泌蛋白及其信号肽特征分析第32-35页
            2.2.1 分泌蛋白特征分析第32-33页
            2.2.2 分泌蛋白信号肽特征分析第33-34页
            2.2.3 信号肽氨基酸组成统计第34-35页
        2.3 分泌蛋白功能预测第35-37页
        2.4 分泌蛋白GO、COG及KEGG分析第37-42页
            2.4.1 GO分类第37-38页
            2.4.2 COG功能分类第38-39页
            2.4.3 KEGG比对第39-40页
            2.4.4 PHI分析第40-42页
    3 讨论与结论第42-44页
第四章 向日葵锈菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选第44-54页
    1 材料与方法第44-46页
        1.1 实验材料第44页
        1.2 实验方法第44-46页
            1.2.1 向日葵锈菌接种及夏孢子萌发第44页
            1.2.2 候选内参基因及引物设计第44-45页
            1.2.3 总RNA提取及cDNA第一链合成第45页
            1.2.4 候选内参基因荧光定量PCR分析第45-46页
            1.2.5 候选内参基因的表达稳定性分析第46页
    2 结果与分析第46-51页
        2.1 总RNA质量检测第46页
        2.2 引物扩增效率及特异性分析第46-47页
        2.3 内参基因表达稳定性分析第47-51页
            2.3.1 内参基因表达水平分析第47-48页
            2.3.2 geNorm分析第48-50页
            2.3.3 NormFinder分析第50页
            2.3.4 BestKeeper分析第50-51页
        2.4 综合分析第51页
    3 结论与讨论第51-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-66页
作者简介第66页

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