| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 背景介绍 | 第9-31页 |
| 第一节 A.westerdijkiae的特征与研究现状 | 第9-12页 |
| 第二节 曲霉真菌的碳水化合物降解作用 | 第12-18页 |
| 2.1 碳水化合物活性酶数据库 | 第13-14页 |
| 2.2 植物细胞壁多糖降解机制 | 第14-18页 |
| 第三节 曲霉真菌的蛋白酶水解作用 | 第18-20页 |
| 第四节 微生物次级代谢产物及其生物合成 | 第20-27页 |
| 4.1 聚酮化合物的生物合成 | 第21-24页 |
| 4.2 非核糖体肽的生物合成 | 第24-26页 |
| 4.3 次级代谢产物生物合成基因簇的生物信息学分析策略及意义 | 第26-27页 |
| 第五节 全基因组测序在曲霉属真菌物种研究中的应用 | 第27-31页 |
| 第二章 材料与方法 | 第31-38页 |
| 第一节 全基因组测序及组装评估 | 第31-33页 |
| 1.1 培养菌株 | 第31页 |
| 1.2 分离基因组DNA | 第31-32页 |
| 1.3 基因组测序和组装 | 第32-33页 |
| 1.4 基因组完整性评估 | 第33页 |
| 第二节 基因组功能注释及比较分析 | 第33-35页 |
| 2.1 预测蛋白质编码基因 | 第33-34页 |
| 2.2 蛋白质功能注释 | 第34-35页 |
| 2.3 次级代谢产物生物合成基因簇的预测 | 第35页 |
| 第三节 比较基因组分析 | 第35-38页 |
| 3.1 全基因组序列比较 | 第35-36页 |
| 3.2 构建系统发生树 | 第36-38页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第38-70页 |
| 第一节 基因组概况 | 第38-41页 |
| 第二节 全基因组序列比较 | 第41-43页 |
| 第三节 进化分析 | 第43-44页 |
| 第四节 分泌蛋白、毒力以及解毒作用相关蛋白 | 第44-46页 |
| 第五节 碳水化合物活性酶 | 第46-54页 |
| 5.1 碳水化合物活性酶 | 第46-51页 |
| 5.2 植物细胞壁多糖降解酶 | 第51-54页 |
| 第六节 蛋白水解酶 | 第54-56页 |
| 第七节 次级代谢产物生物合成基因簇 | 第56-70页 |
| 7.1 赭曲霉毒素A生物合成基因簇 | 第57-64页 |
| 7.2 其他次级代谢产物生物合成基因簇 | 第64-70页 |
| 第四章 总结与展望 | 第70-75页 |
| 第一节 论文结论 | 第70-71页 |
| 第二节 论文不足之处 | 第71-73页 |
| 第三节 A.westerdijkiae相关研究展望 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-91页 |
| 附录 | 第91-102页 |
| 攻读学位期间成果 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103-105页 |
