| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略语表 | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-32页 |
| 1.1 奶牛乳房炎概述 | 第11-13页 |
| 1.1.1 乳房炎致病菌 | 第12页 |
| 1.1.2 乳房炎治疗方法 | 第12-13页 |
| 1.2 奶牛肠道菌群 | 第13-16页 |
| 1.3 肠道菌群与疾病 | 第16-17页 |
| 1.4 影响胃肠道菌群的因素 | 第17-22页 |
| 1.5 乳酸菌制剂在奶牛养殖中的应用现状 | 第22-27页 |
| 1.5.1 乳酸菌对乳房炎的预防与治疗 | 第24-26页 |
| 1.5.2 抗乳房炎乳酸菌的筛选 | 第26-27页 |
| 1.6 L. casei Zhang介绍 | 第27-28页 |
| 1.7 肠道微生物宏基因组学研究 | 第28-30页 |
| 1.8 菌群移植研究 | 第30-32页 |
| 2 本研究的立题背景与主要研究内容 | 第32-34页 |
| 2.1 立题背景 | 第32页 |
| 2.2 主要研究内容 | 第32-34页 |
| 3 健康奶牛与患乳房炎奶牛肠道微生物与乳腺微生物定量实验 | 第34-46页 |
| 3.1 仪器与试剂 | 第34页 |
| 3.2 样品采集与DNA的提取 | 第34-35页 |
| 3.3 制备荧光定量PCR外标品 | 第35页 |
| 3.4 定量PCR所使用的试剂与反应条件 | 第35-38页 |
| 3.5 定量实验结果与分析 | 第38-46页 |
| 4 以无菌小鼠为动物模型进行健康奶牛与乳房炎奶牛肠道菌群移植实验 | 第46-104页 |
| 4.1 奶牛粪便的采集 | 第47页 |
| 4.2 无菌小鼠移植奶牛粪便 | 第47-48页 |
| 4.3 小鼠生理生化指标检测 | 第48-53页 |
| 4.3.1 仪器与试剂 | 第48页 |
| 4.3.2 小鼠乳腺组织病HE染色切片 | 第48-50页 |
| 4.3.3 小鼠乳腺组织病理免疫组化染色切片 | 第50-51页 |
| 4.3.4 小鼠乳腺等组织蛋白提取与Western blot检测 | 第51-52页 |
| 4.3.5 小鼠乳腺等组织酶联免疫吸附实验 | 第52-53页 |
| 4.4 小鼠与奶牛肠道菌群宏基因组与16S rRNA基因全长测序分析 | 第53-54页 |
| 4.5 实验结果与分析 | 第54-68页 |
| 4.5.1 小鼠乳腺组织病理切片结果与分析 | 第54-58页 |
| 4.5.2 小鼠肠组织与肝脏组织病理切片结果与分析 | 第58-60页 |
| 4.5.3 小鼠乳头外观 | 第60-62页 |
| 4.5.4 小鼠乳腺组织westernblot检测炎症蛋白表达 | 第62-66页 |
| 4.5.5 血清与组织中免疫指标ELISA检测 | 第66-68页 |
| 4.6 肠道菌群宏基因组与16S rRNA基因全长测序结果与分析 | 第68-104页 |
| 4.6.1 小鼠与奶牛肠道菌群宏基因组测序结果与分析 | 第68-75页 |
| 4.6.2 奶牛肠道宏基因组菌群结构分析 | 第75-79页 |
| 4.6.3 小鼠肠道宏基因组菌群结构分析 | 第79-84页 |
| 4.6.4 奶牛与小鼠肠道宏基因组菌群功能分析 | 第84-96页 |
| 4.6.5 16S rRNA基因全长测序结果与分析 | 第96-104页 |
| 5 讨论 | 第104-108页 |
| 6 结论 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-124页 |
| 作者简介 | 第124-125页 |
